医疗 AI-Ready 训练数据集库（上万即取即用）

致力于为医疗 AI 研究人员找到合适的数据集。已收录 2,043 个 AI-Ready 数据集，覆盖医学影像、电子病历与文本、病灶分割与标注等多模态数据。

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乳腺阳性影像数据集

乳腺钼靶阳性病例影像数据，覆盖肿块、钙化等典型征象，面向乳腺 AI 辅助筛查模型训练。

TCT 宫颈细胞学数据集

液基薄层细胞学（TCT）数字图像，含阴阳性判读结果，适配宫颈癌细胞学筛查模型。

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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

按任务类型浏览

图像分类目标检测语义分割

共 1885 个数据集

基因组学与多组学表观基因组测序数据

Roadmap Epigenomics — 人类参考表观基因组图谱

127 个整合参考表观基因组2,805 个基因组范围数据集1,502 亿条测序 reads15 状态 ChromHMM 注释免费开放无需注册非患者数据（健康人原代细胞、组织与干细胞系样本）

127 个整合参考表观基因组，2,805 个基因组范围数据集

NIH Roadmap Epigenomics Mapping Consortium（WashU Ting Wang 实验室托管数据门户） url: https://egg2.wustl.edu/roadmap/web_portal/ 52

基因组学与多组学心血管疾病肿瘤学队列研究

TOPMed — 心肺血液睡眠多组学旗舰

96,620 份 30x WGS（freeze 8）约 4.28 亿过 QC 变异RNA-seq甲基化代谢组多组学dbGaP 受控访问逾 18 万名参与者（WGS freeze 8 为 96,620 人）

逾 18 万份 30x 全基因组 + 深度表型的心肺血液睡眠精准医学资源

National Heart, Lung, and Blood Institute (NHLBI), NIH url: https://topmed.nhlbi.nih.gov 71

生理信号电子健康记录睡眠信号队列研究

SHHS — 睡眠心脏健康研究队列

356 GB 全库93.6 MB 开放子集6,441 例入组3,295 例二次 PSG1995-2011 年随访Compumedics 家庭 PSG需 NSRR 注册 + DUA6,441 名入组成人（NSRR 可共享 5,804）

家庭便携 PSG + 心血管随访 · 6,441 例 · NSRR 托管的睡眠呼吸金标准

Sleep Heart Health Study Research Group / National Sleep Research Resource url: https://sleepdata.org/datasets/shhs 101

医学影像CT肺癌

NSCLC-Radiomics — 肺癌影像组学队列

422 名患者52,073 张 CT 切片35.78 GB DICOM7 项临床字段CC BY-NC 3.0 开放下载422 名 NSCLC 患者

422 例 NSCLC 患者的 CT 影像组学与生存随访金标准队列

MAASTRO Clinic / The Cancer Imaging Archive (TCIA) url: https://www.cancerimagingarchive.net/collection/nsclc-radiomics/ 80

医疗NLP电子健康记录临床电子病历医学问答

emrQA — 电子病历抽取式问答数据集

196 万问答对（终版）680 个问题模板2,425 份脱敏病历i2b2n2c2 DUA 授权免费申请获取2018 年后停更2,425 份临床病历

临床 QA 首个大规模社区语料 · 40 万+ 问答对 · i2b2 授权

UIUC & IBM Research & MIT-IBM Watson AI Lab（底层语料：i2b2/n2c2，哈佛 DBMI 托管） url: https://portal.dbmi.hms.harvard.edu/projects/n2c2-nlp/ 64

药物发现与化学化学信息学药物-靶点相互作用

Davis 激酶亲和力 — 激酶抑制剂 Kd 矩阵

442 种激酶 × 72 种抑制剂30,056 个 Kd 测量（社区标准版）pKd 范围约 5.0–10.8开放下载（CC BY 4.0）不适用（体外药物-靶点结合数据，无患者）

442 种激酶 × 72 种抑制剂的全激酶组 Kd 亲和力矩阵

Ambit Biosciences（Davis et al., Nature Biotechnology 2011） url: https://www.nature.com/articles/nbt.1990 77

医学影像电子健康记录临床电子病历皮肤影像

PAD-UFES-20 — 智能手机皮肤癌筛查数据集

2,298 张临床照片1,373 名患者6 类诊断3.35 GB PNG+CSVCC BY 4.0 开放1,373 名患者

2,298 张智能手机临床照片 + 1,373 名患者临床特征，6 类皮肤病变多模态基准

Universidade Federal do Espírito Santo (UFES) — LABCIN & PAD url: https://data.mendeley.com/datasets/zr7vgbcyr2 96

公共卫生与流行病学神经科学转录组

Allen Brain Atlas — 多模态脑图谱

约 20,000 个基因 ISH3,702 个人脑微阵列样本非商业免费须引用非患者队列（脑组织转录组/连接组研究图谱）

全脑基因表达+连接组+细胞类型多模态公共图谱

Allen Institute for Brain Science url: https://portal.brain-map.org/ 93

生理信号可穿戴传感时序数据步态与运动

MHEALTH — 穿戴多传感器活动识别基准

10 名受试者12 类身体活动23 个传感器通道50 Hz 采样72.1 MB 文本日志10 名健康志愿者（非患者队列）

10 名受试者 × 23 通道穿戴多模态信号 × 12 类身体活动

UCI 机器学习库（数据收集：西班牙格拉纳达大学 CITIC-UGR） url: https://archive.ics.uci.edu/dataset/319/mhealth+dataset 83

医学影像电子健康记录皮肤影像真实世界数据

SCIN — 众包真实世界皮肤影像

约 10,408 张 PNG 照片5,033 个贡献案例12.6 GB 免费开放下载加权鉴别诊断标注5,033 个公众贡献案例（约 5,000 余名美国志愿者）

10,408 张众包皮肤状况照片与加权鉴别诊断标注，覆盖美国公众常见皮肤病谱

Google Research 与 Stanford Medicine url: https://github.com/google-research-datasets/scin 68

医学影像手术视频内窥镜影像医学图像分割结直肠癌

HeiCo — 结直肠腹腔镜手术器械分割

30 段结直肠腹腔镜视频14 类手术相位10,040 帧实例分割掩码CC BY-NC-SASynapse 申请获取30 例结直肠腹腔镜手术视频

30 段结直肠腹腔镜视频 + 14 相位 + >10,000 帧实例分割标注

DKFZ / Heidelberg University Hospital url: https://link.springer.com/article/10.1038/s41597-021-00882-2 76

医学影像药物发现与化学病理图像虚拟筛选评测基准

BBBC — Broad Bioimage Benchmark Collection 显微图像分析基准集

TIFFPNG荧光明场DICCC0 为主CellProfiler 兼容细胞/显微结构图像

Broad Institute Imaging Platform (Anne Carpenter Lab) 141

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