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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 776 个数据集

病理图像医学图像分割结直肠癌肿瘤学图像分类

EBHI-Seg

人工标注影像数据原始数据2,228 张切片图像（+2,228 张 ground truth 掩码，合计 4,456 文件；患者级数量未披露）

东北大学 MIaMIA 组 4,456 张结直肠肠镜活检 H&E 图像（2,228 切片 + 2,228 像素级分割掩码）、六类肿瘤分化阶段，CC BY 4.0 于 figshare 公开直链；论文自带经典机器学习与深度学习分割基线（最高 Dice 0.965）

辽宁省肿瘤医院/中国医科大学附属肿瘤医院肠镜活检结肠组织 H&E 切片，Nissan Olympus 显微镜 400×（目镜 10× × 物镜 40×）采集，224×224 像素 PNG 切片图像 + 像素级二值分割掩码，六类肿瘤分化阶段（Normal/Polyp/Low-grade IN/High-grade IN/Serrated adenoma/Adenocarcinoma） 37

医学影像X光影像医学图像分割评测基准肺癌

CheXlocalize

人工标注影像数据原始数据700 患者（val 200 + test 500）；902 张胸片（val 234 + test 668）

斯坦福 AIMI 托管的胸片病灶定位标注集——2 名放射科医师 18/27 年经验对 CheXpert val/test 902 张逐像素勾画 643 条分割，度量 7 种 saliency 方法定位能力的老牌基准，代码由哈佛 Rajpurkar Lab 维护

CheXpert val/test 派生胸片 902 张 + 放射科医师像素级轮廓标注（643 条 val 分割，RLE 编码）+ test 集 human benchmark 分割与最代表点 + val 集 DenseNet121 Grad-CAM 热图 47

电子健康记录队列研究真实世界数据评测基准流行病学

Chronic Kidney Disease (UCI)

原始数据临床检验含缺失值二分类标签400 例患者（ckd 250 / notckd 150，归一后口径；原样含 2 例 ckd\t 脏标签；年龄 2-90 岁，均值 51.48±17.17）

UCI 机器学习仓库 ID 336——印度泰米尔纳德邦 Apollo Hospitals 2015 年捐赠的 400 例肾内科检验表格数据集，24 项临床指标+ckd/notckd 二分类标签，缺失率 10.12%、零缺失完整行仅 39.5%，机器学习教科书级小数据与 99%+ 准确率通胀现象的活标本

Apollo Hospitals（印度泰米尔纳德邦）肾内科患者 24 项临床检验/体格检查指标（人口学、尿液检查、血生化、血液学、合并症五组）+ 临床诊断二分类标签 class（ckd/notckd）；官方唯一机读格式 data.csv（45,092 字节，401 行×25 列） 53

医学影像X光影像图像分类COVID-19评测基准医学图像分割

BrixIA — COVID-19 胸片六区 Brixia 评分数据集

人工标注影像数据原始数据图像 4,695 张 CXR 现行（论文 Table 3 记 4,703 / 采集 4,707 / 第三方有症状子集口径 4,644）；唯一患者数项目未披露（匿名 Subject 标识，图像数大于患者

意大利布雷西亚疫情峰值一个月 4,695 张 COVID-19 胸片，每张带六区 Brixia score（6 区×0-3，全局 0-18），配 BS-Net 弱监督端到端评分网络与 150 张五人共识金标准——首个把放射科日常报告评分数值化并公开的 COVID-19 CXR 数据集

意大利布雷西亚 ASST Spedali Civili di Brescia 第 2 放射科，2020-03-04 至 2020-04-04 疫情峰值期次重症与重症监护病房全部 COVID-19 胸片（CR 62%/DX 38%，AP 87%/PA 13%，DICOM 匿名化 float32），每张附当班放射科医师日常报告中的六区 Brixia score（ABCDEF 各 0-3）与全局分（0-18） 50

医学影像MRI医学图像分割目标检测评测基准

Prostate158

人工标注影像数据原始数据158 例（train 139 + test 19，患者级不重叠；其中 102 确诊前列腺癌 + 56 对照，年龄 69±9 岁，35–84 岁）

柏林夏里特医学院（Charité Berlin）单中心专家标注前列腺 3T bpMRI 数据集——158 例（102 确诊前列腺癌 + 56 对照），T2w + 高 b 值 DWI/ADC，解剖分区分割（central gland + peripheral zone）与 PI-RADS ≥4 病灶检测双任务标注，ITK-Snap 双 Reader 流水线，U-ResNet 基线分区分割 Dice 0.877、病灶分割 Dice 0.453

Siemens VIDA 与 Skyra 3.0T 采集的前列腺 bpMRI（T2w：0.47×0.47 mm 面内 / 3 mm 层厚 / FOV 180×180 mm；DWI：b=0,100,500,1000 s/mm²，ADC 图由 b100–b1000 计算），NIfTI 轴向序列，统一重采样与中心裁剪；标注为 T2w 三类解剖分区掩膜（背景 / central gland / peripheral zone）+ PI-RADS ≥4 病灶逐层勾画（三序列参照） 60

医学影像MRI医学图像分割挑战赛数据集心血管疾病

MyoPS

人工标注影像数据原始数据MyoPS 2020：45 例 AMI 患者（25 训练公开+20 测试加密；45 男/0 女，56.2±7.92 岁）；CARE MyoPS++ 2024：250 例患者、7 中心（中法英）

MICCAI 多序列 CMR 心肌病理分割挑战（MyoPS 2020 首届 + CARE MyoPS++ 2024 真实世界升级）——bSSFP/T2/LGE 三序列互补定位心肌水肿与瘢痕，45 例 AMI 起步、250 例 7 中心升级，公开基准与加密金标准自评工具随包发布

多序列心脏 MRI 短轴位 .nii.gz：bSSFP（C0）/ T2-weighted / LGE（DE）三序列 + 心肌病理分割金标准（NIfTI 标签值编码：scar=2221、edema=1220、normal=200、LV=500、RV=600）+ 加密测试金标准与官方评估工具箱；2024 届另含未对齐版与缺失序列真实世界变体 60

医学影像CTMRI挑战赛数据集评测基准肺癌

Learn2Reg 2023

影像数据人工标注挑战赛数据NLST2023 挑战赛包 210 对（170 train/10 val/30 test，源自 TCIA NLST 筛查人群）；ThoraxCBCT 19 例（11/3/5，每例 2 配对=38 对，

MICCAI 2023 医学图像配准挑战赛：NLST 胸部 CT 吸气-呼气跨期配准扩展（双专家 >100 landmark+肺结节 TRE）与新增 ThoraxCBCT 放疗 FBCT-CBCT 跨模态配准（TCIA 4D-Lung 19 例 38 对）双任务 Docker 制评测，SynDeeds 与 LapIRNv2 分获冠军

NLST：TCIA NLST 胸部 CT（DOI 10.7937/TCIA.HMQ8-J677，CC BY 4.0）重采样 224×192×224@1.5mm；ThoraxCBCT：TCIA 4D-Lung（DOI 10.7937/K9/TCIA.2016.ELN8YGLE，CC BY 3.0）FBCT/CBCT 重打包 390×280×300@1.0mm+13 结构掩码+landmarks（16/对）+Förstner keypoints；评测代码 MDL-UzL/L2R 75

医学影像MRI医学图像分割多模态影像挑战赛数据集脑肿瘤

crossMoDA 2023

人工标注影像数据原始数据959 扫描（UK MC-RC 274 扫描/145 患者 + London SC-GK 309 + Tilburg SC-GK 376）；公开可下载 618（源 227 + 目标 295 + 验证

crossMoDA 跨模态域适应挑战赛第三届（MICCAI 2023）：ceT1→hrT2 无监督跨模态分割前庭神经鞘瘤（瘤内/瘤外亚分割）与耳蜗，三队列 959 扫描新增英国 10 站常规随访异质数据，平台迁至 Synapse，冠军方案用'生成站点风格'取代风格 harmonization

三队列 MRI（NIfTI）：London SC-GK 放射外科计划数据（Avanto 1.5T，MP-RAGE + CISS/FIESTA）+ Tilburg SC-GK（Ingenia 1.5T，3D-FFE + 3D-TSE）+ UK MC-RC 10 站常规随访（1.0/1.5/3.0T，四厂商）；标注：ceT1 源域瘤内/瘤外 VS+耳蜗三分类掩码 + 无标注 hrT2 目标域 44

医学影像医学图像分割挑战赛数据集评测基准CT

STSR 2025

人工标注影像数据原始数据CBCT 全集 370 例（70 标注=30 训练+40 验证，300 未标注；年龄 7-70 岁）｜IOS 样本 700 例（60 标注+640 未标注；配准任务 Table 3 口径 330 对=

MICCAI 2025 ODIN Workshop 半监督牙齿分割与配准挑战赛官方数据集——370 例多中心 CBCT（70 标注/300 未标注）与 700 例口内扫描构成牙科首个跨模态半监督基准，双任务覆盖牙齿+牙髓根管实例分割与 CBCT-IOS 冠根配准，78 支队伍 392 次提交淬炼出 U-Mamba2 与 PointNetLK 两套开源冠军方案

多中心口腔临床机构 CBCT 体数据（NIfTI 格式，标准化重建重采样，FDI 牙位编码实例级 3D 标注，含牙齿+牙髓根管双结构）+ 同患者相近时间窗口内扫描 IOS 网格 + 每颌 4×4 刚性变换矩阵配准真值；伦理批件：杭州口腔医院医学伦理委员会 2022YR014 81

医学影像CT医学图像分割挑战赛数据集评测基准

ToothFairy3

人工标注影像数据原始数据532 例公开 CBCT（Set A 417 + Set B 63 + Set C 52；论文总口径 582 = 532 公开 + 50 隐藏测试）；≈17,024 颗牙齿（STS2024 对比表口径

MICCAI 2025 ODIN workshop 的 CBCT 多结构分割挑战赛与 532 例公开数据集：77 类牙位+牙髓+神经血管管标注、runtime 首次纳入主排名、IAC 点击式交互双任务——冠军 U-Mamba2，CC-BY-NC-SA 经 ditto 注册墙发放

牙科 CBCT（NIfTI 体数据）：体素间距 0.3mm 各向同性、Hounsfield 强度标度、RPI 朝向（附官方 RPI→LPS 转换脚本）、nnU-Net dataset 格式（raw images + segmentation maps + dataset.json）；77 类体素级 3D 标注（FDI 牙位扩展：颌骨/牙列/牙髓/神经血管管/上颌窦/咽/修复体与种植体） 97

医学影像CT医学图像分割挑战赛数据集评测基准肺癌

LNQ 2023

人工标注影像数据原始数据513 患者（女 239/男 274，2007-2020 年采集）；训练 383 / 验证 20 / 测试 100

MICCAI 2023 纵隔淋巴结 CT 分割量化挑战赛——513 患者对比增强胸部 CT（训练 383 部分标注/验证 20/测试 100 全标注双协议），rank-then-aggregate 评估，冠军 Skeleton Suns DSC 71.2%/ASSD 2.95mm，数据经 TCIA 以 CC BY 4.0 全量公开

多中心多癌种对比增强胸部 CT（512×512，层间距 3.0-3.8mm，面内 0.8-0.9mm）+ 纵隔 >1cm 淋巴结 3D 分割掩码（NRRD）；训练集来自临床试验工作流部分标注，验证/测试集经 3D Slicer 4.11 全标注 49