即取即用的 AI-Ready 医疗数据集库

哥伦比亚真菌学实验室捐赠的 3,025 张原始镜检图经自动切块过滤得 9,114 张 500×500 彩色显微图像，按 TSH/BASH/GMA/SHC/BBH 五种真菌形态人工标注五分类，主题专家策展，CC BY 4.0，2023 年入藏 UCI Machine Learning Repository（id=773），面向真菌诊断最早期的直接镜检环节

哥伦比亚某真菌学实验室捐赠的浅表真菌感染直接镜检原始图像（Sony DSC W830 拍摄）经自动 patching（切 500×500 patch）+ filtering（剔除无关区、去噪去伪影）得到 9,114 张 500×500 RGB 图像，按 TSH/BASH/GMA/SHC/BBH 五种真菌形态人工标注，主题专家策展 33

医学影像病理图像目标检测图像分类肿瘤学儿科

BoneMarrowWSI-PediatricLeukemia — 儿童白血病骨髓涂片全片检测数据集

人工标注影像数据临床数据246 例儿童白血病患者（<18 岁；ALL 96 / AML 97 / CML 53）；细胞框标注 47,176 个；整数类别体系 49 类（评测分类器 33 类）

Fraunhofer MEVIS 联合埃尔朗根大学医院的 246 例儿童白血病骨髓穿刺涂片全切片数据集——Pappenheim 染色 40× 扫描、47,176 个细胞框、49 类标注体系、多专家共识标注，覆盖细胞检测到三型白血病诊断全流程，CC BY 4.0 经 NCI IDC 公开

骨髓穿刺涂片全切片图像（MIRAX 经 3DHistech 扫描仪采集，40×，0.11×0.11 μm/px，Pappenheim 染色）+ DICOM Bulk Annotations（ANN 模态，细胞框与共识类标）+ 病例级临床与实验室元数据（年龄组/性别/诊断/原始细胞/白细胞/血小板/LDH/尿酸/血红蛋白） 33

医学影像目标检测图像分类医学图像分割评测基准

UMID — Urine Microscopic Image Dataset — 首个公开尿液沉渣显微图像细胞检测数据集

人工标注影像数据原始数据未披露患者级数量（366 张图像；图像来源为大学医院单医生日常诊断流程；因基础设施缺失患者信息未存储，图像在源头即匿名化）

366 张 1280×720 明场显微尿沉渣图像、3733 个细胞标注（RBC/pus/epithelial 三类）——点标注+missed label 两项标注新策略，真实「in-the-wild」低质量临床图像，BITS Pilani 团队 GitHub 公开

大学医院医师日常诊断中采集的尿液沉渣明场显微图像（两台 MAGNUS CH20iBIMF 显微镜，10× 目镜 + 40× 消色差物镜 = 400× HPF，COSLAB COSUSB5000 5 MP 相机，1280×720 分辨率）+ Microsoft VoTT 标注（RBC/pus/epithelial 三类框标注 + 簇内点标注 + missed label 类） 41

医学影像MRI医学图像分割多模态

SegThy — 甲状腺与颈部血管 3D 超声+MRI 分割数据集

影像数据原始数据人工标注214 例 = 子集 1（28 健康志愿者）+ 子集 2（186 患者）；子集 1 每例 1×MRI + 9×3D US，子集 2 每例 6×3D US

TUM CAMP 发布的 214 例（28 健康志愿者+186 患者）主动追踪式自由手 3D 超声与 MRI 配对分割数据集——电磁追踪 0.12mm³ 体素超声、多医师多次扫描的观察者间变异样本，CC BY 公开直链、torch-em 官方收录

TUM CAMP 单中心采集：Siemens Acuson NX-3 超声 + 12MHz VF12-4 探头 + Piur tUS 电磁追踪系统采集双侧 3D 自由手超声（体素 0.12×0.12×0.12 mm³）；Siemens Biograph mMR 3T 采集 T1 加权 VIBE 序列 MRI（体素 0.625×0.625×1 mm³，FOV 320×320×80 mm³）；含甲状腺及颈部血管标签图与年龄/性别元数据 45

医学影像眼科影像医学图像分割图像分类儿科

HVDROPDB — 早产儿视网膜病变视网膜结构分割数据集

人工标注影像数据原始数据600 张已标注分割图像（3 主数据集 × 4 子数据集 × 50 张）+ 对应掩膜；分类子集（ROP/Normal）另计；逐患儿临床元数据未公开

首个为早产儿视网膜病变（ROP）公开发布的眼底视网膜结构分割数据集——H.V. Desai 眼科医院 RetCam 与 Neo 双设备采集，视盘/血管/嵴三结构逐像素掩膜，三主数据集×四子集×50 张=600 张标注图像，Mendeley Data CC BY 4.0 直链公开

印度浦那 PBMA's H.V. Desai Eye Hospital 早产儿 ROP 筛查现场采集的眼底彩色照相（RetCam by Clarity Medical Systems + Neo by Forus Healthcare）＋临床专家逐像素标注掩膜（视盘 OD / 血管 BV / 嵴 RIDGE 三结构） 34

医学影像内窥镜影像图像分类肿瘤学

CystoDS — 膀胱镜膀胱癌多分类图像数据集

真实世界采集影像数据医生标注160 名患者（2016-2022 于 VAPAHCS 招募，IRB #29838/#36085 批准，签署知情同意）；8067 张图像

真实临床膀胱镜 8067 张图像 / 160 患者的五类二十二子类多分类数据集——白光与蓝光双模态、768 张 ROI 分割标注、病理确诊驱动标签，以 Swin-Transformer 跨库泛化验证可直接训练可迁移，CC BY 4.0 全链开放

真实临床膀胱镜检查图像：TURBT 手术室 KARL STORZ Endoskope 硬镜（n=200）+ 门诊 Olympus 软性膀胱镜（n=8）；白光 WLC 7617 张 + 蓝光 BLC 450 张；PNG 格式、宽 252-5120 px、高 209-2880 px；含 5 大类 22 子类标签 + 768 张 ROI 分割 JSON + cystods.csv 元数据表（632,115 字节） 41

内窥镜影像手术视频医学图像分割目标检测评测基准肿瘤学

GraSP — 机器人前列腺癌手术场景理解数据集

影像数据视频数据人工标注13 例机器人辅助根治性前列腺切除术视频（真实患者 in vivo 手术数据，去标识）

13 例达芬奇机器人根治性前列腺切除术视频（32.37 小时）的多粒度手术场景理解基准——11 阶段/21 步骤/7 器械/14 原子动作四任务统一标注，配套全 Transformer 的 TAPIS 模型，MIT 许可 Google Drive 公开

Fundación Santa Fe de Bogotá 采集的 da Vinci Si 手术系统机器人根治性前列腺切除术视频：原始 30 fps 视频 + GraSP_30fps（完整训练评测集）/GraSP_1fps（轻量版）帧 + JSON 长短期标注 + PNG 器械分割掩膜 48

医学影像医学图像分割目标检测心血管疾病儿科评测基准

FOCUS: Four-chamber Ultrasound Image Dataset for Fetal Cardiac Biometric Measurement — 胎儿四腔心超声「心脏+胸腔」双椭圆首创标注数据集，CTR 心胸径比生物测量的开源标尺

影像数据人工标注原始数据217 例（300 张图像来自 217 位患者；患者级划分 200 训练 : 50 验证 : 50 测试）

300 张胎儿四腔心切面超声、源自公开 FETAL_PLANES_DB 再标注、带资深超声医师手工椭圆/旋转框/掩码三合一标注，专为 CTR（心胸径比）自动测量设计；配 MICCAI 2025 EllipseDet 单阶段椭圆检测方法与 CC-BY 4.0 全开放许可

公开 FETAL_PLANES_DB 数据库（西班牙巴塞罗那 Hospital Clinic 等采集）中的四腔心切面抽取再标注；230×245 像素二维灰阶胎儿超声；每图心脏与胸腔各一条椭圆 + 旋转框 + 二值掩码 35

医学影像病理图像医学图像分割图像分类

DeepUTI — Urine Microscopy Open Dataset — 尿液显微七分类细胞注释数据集

影像数据人工标注像素级标注300 例患者（300 份自然排尿样本，mean 42±15 岁，95.1% 女性）；300 张图像；3,562 个手工标注细胞

300 张自然排尿未染色明场显微图 + 3,562 个手工像素级标注细胞（七类：Rod/RBC-WBC/Yeast/Miscellaneous/Single EPC/Small EPC sheet/Large EPC sheet）——为尿道感染（UTI）深度学习诊断测试奠基，RODARE 数据集先行（2023-09-12）论文后置（Sci Data 2024），CC-BY-4.0 开放直链，GitHub casus/UMOD 配 MIT 代码

英国伦敦 Whittington Health NHS Trust LUTS 专科门诊的症状性 UTI 患者自然排尿样本（2022-04 至 2022-08 采集），Olympus BX41F 明场显微镜 + ×20 物镜 + Infinity 3S-1UR 彩色相机 + C Chip™ 血细胞计数板，16-bit 彩色 1392×1040 TIFF；含 img/ bin_mask/ mult_mask/ 三目录各 300 文件 38

医学影像目标检测公共卫生与流行病学全球健康疾病监测

STH-Schisto — 肠道蠕虫与曼氏血吸虫虫卵粪涂片检测数据集（10562 视野）

人工标注影像数据原始数据未披露患者数；300 份粪便样本（Schistoscope）+ 272 片（AI4NTD 上游），受试为尼日利亚学龄儿童

尼日利亚 Kato-Katz 粪涂片显微镜视野图像与四类蠕虫虫卵 COCO 边界框标注——Schistoscope 低成本自动化显微镜现场采集（300 样本）+ Ward et al. AI4NTD KK2.0 P1.5 公开集合并（272 片），EfficientDet-D0 边缘 AI 检测加权 F1 0.940，CC BY-4.0 于 Zenodo 公开直链

尼日利亚联邦首都区（FCT）Kato-Katz 粪涂片（41.7 mg 模板）显微镜视野图像：Schistoscope 现场采集（4× / 0.10 NA，2028×1520 px）300 样本共 141,600 FOV，其中 3,040 含卵 FOV + Ward et al. AI4NTD KK2.0 P1.5（10× / 0.25 NA，1640×1232 px）272 片 7,780 含卵 FOV；四类虫卵 COCO 边界框（PNG 图像 + JSON 标注） 30