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GSE29985:ChIP-on-Chip鉴定ARX靶基因——一个与智力障碍和癫痫相关的转录因子
该数据集来自NCBI GEO,标题为GSE29985,利用ChIP-on-Chip技术鉴定转录因子ARX的靶基因。ARX与X连锁智力障碍、癫痫及神经元迁移缺陷相关,在小鼠端脑GABA能神经元中表达

EGAS00001002171-5-sc-2022-06-29T07:58:17Z 样本集
该数据集来自 omicsdi.org,包含 AT/RT 与 Ewing's sarcoma 两种肿瘤类型的单细胞转录组数据,使用 chromium 10X 3' 测序生成;同时每个个体还获取了肿瘤与正常组织的全基因组测序数据,采用 Illumina 短读长测序,平均深度 30X

TAF1/DYT3中疾病特异性序列改变DSC3影响囊泡运输与多巴胺代谢相关基因
该数据集来自NCBI GEO(GSE41157),围绕X染色体连锁的肌张力障碍帕金森综合征(XDP)相关TAF1/DYT3多转录本系统中的疾病特异性序列改变DSC3展开

EGAS00001000419-sc-20130130 样本数据集
该数据集来自 omicsdi.org,属于肿瘤/其他分类,主题标签为 Genomics。源站描述显示,将对四个 Ewing's sarcoma 细胞系和两个对照细胞系进行 Illumina RNA-Seq,所有细胞系的 RNA 均采用基础 Trizol 提取方案获得

Arx转染N2a细胞与空载体转染细胞的基因表达比较
该数据集来自NCBI GEO,比较Arx转染N2a细胞与相应空载体转染细胞的基因表达差异,包含1个文件(GSE30190_series_matrix.txt.gz),基于GPL10333表达谱芯片平台,物种为小鼠(10090)

dfb2a07a-09ab-4034-8da5-678e3c0a27a1 - samples 数据集
该数据集包含54例Ewing's sarcoma样本的全基因组测序(WGS)数据,样本由加拿大多伦多The Hospital for Sick Children的Adam Shlien实验室完成测序,相关成果发表于Science 2018,并引用Anderson等人关于骨与软组织肿瘤重排爆发产生经典

EGAS00001000267-sc-20130529 样本数据集
该数据集来自 omicsdi.org,属于肿瘤/其他分类,主题标签为 Genomics。源站描述指出,癌症由基因组突变驱动,研究旨在揭示导致 Ewing's sarcoma(一种主要影响儿童的骨肿瘤)的突变

EGAS00001000362-sc-20130424 样本数据集
该数据集来自 omicsdi.org,属于肿瘤/其他分类,主题标签为 Genomics。源站描述指出癌症由基因组突变驱动,研究旨在揭示导致 Ewing 肉瘤(一种主要影响儿童的骨肿瘤)的突变,将使用第二代 Illumina 大规模并行测序和定制软件来表征 Ewing 肉瘤肿瘤的基因组和转录组

尤文肉瘤患者样本数据集(含全外显子、RNAseq与正常DNA数据)
该数据集来源于omicsdi.org,包含5例尤文肉瘤(Ewing sarcoma)患者的样本数据。其中5个样本具有肿瘤全外显子数据,1个样本具有肿瘤RNAseq数据,4个样本具有匹配的正常DNA序列数据

通过抑制FACT复合物靶向治疗尤文肉瘤(RNA-Seq II)
该数据集来自omicsdi.org,属于肿瘤/其他分类,主题为转录组学。数据围绕尤文肉瘤(EwS)中EWS/ETS融合转录因子(最常见为EWSR1-FLI1)驱动的发病机制,通过转录组与功能基因组学分析结合小分子筛选,鉴定出FACT复合物亚基SSRP1和SUPT16H为EWSR1-FLI1诱导的关键
![肌张力障碍基因THAP1调控DNA双链断裂修复选择[新生RNA-seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/190629.jpg)
肌张力障碍基因THAP1调控DNA双链断裂修复选择[新生RNA-seq]
研究关注THAP1、YY1和HCF1转录因子结合SHLD1启动子并协同维持其低基础表达,从而在生理性DNA双链断裂修复中平衡末端保护与末端切除;在BRCA1缺陷背景下,THAP1依赖的SHLD1表达缺失可导致交叉耐药
![肌张力障碍基因THAP1调控DNA双链断裂修复选择[CRISPR-Cas9筛选]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/190625.jpg)
肌张力障碍基因THAP1调控DNA双链断裂修复选择[CRISPR-Cas9筛选]
源站描述指出,Shieldin复合体(SHLD1、SHLD2、SHLD3和REV7)保护DNA双链断裂免受核酸酶切除,THAP1、YY1和HCF1直接结合SHLD1启动子并协同维持其低基础表达,从而平衡末端保护与末端切除
