尤文肉瘤患者样本数据集(含全外显子、RNAseq与正常DNA数据)
该数据集来源于omicsdi.org,包含5例尤文肉瘤(Ewing sarcoma)患者的样本数据。其中5个样本具有肿瘤全外显子数据,1个样本具有肿瘤RNAseq数据,4个样本具有匹配的正常DNA序列数据

基本信息
资源简介
尤文肉瘤患者样本数据集(含全外显子、RNAseq与正常DNA数据)
该数据集来源于 omicsdi.org,收录了 5 例尤文肉瘤(Ewing sarcoma)患者的样本数据,属于肿瘤领域的基因组学数据资源。从数据类型构成来看,这批样本覆盖了肿瘤全外显子测序、肿瘤 RNA 测序以及匹配的正常 DNA 序列三类数据:5 个样本具有肿瘤全外显子数据,1 个样本具有肿瘤 RNAseq 数据,4 个样本具有匹配的正常 DNA 序列数据。尤文肉瘤是一种少见但侵袭性较强的骨与软组织肿瘤,其分子特征研究对理解发病机制和探索治疗靶点具有重要意义。该数据集将肿瘤组织的外显子层面信息、转录层面信息与个体自身的正常 DNA 信息组织在一起,为研究者提供了在同一患者背景下比较肿瘤与正常基因组差异的可能,适合用于变异识别、肿瘤特异性突变分析及转录表达探索等基因组学研究方向。
【数据集背景】
该数据集的主题标签为 Genomics,本站分类归入肿瘤 / 其他。尤文肉瘤属于较为罕见的肿瘤类型,公开可用的多组学样本数据相对有限,因此此类汇集了患者肿瘤与正常样本的基因组数据具有较高的研究参考价值。数据集通过 omicsdi.org 这一组学数据索引平台对外呈现,便于研究者在统一的检索入口下发现并定位该资源。源站描述仅说明了样本数量与数据类型构成,未提供研究项目背景、所属课题或发表文献等进一步信息。
【数据内容】
数据集共涉及 5 例尤文肉瘤患者。按数据类型划分:全部 5 个样本均具有肿瘤全外显子(whole exome)数据;其中 1 个样本额外具有肿瘤 RNAseq 数据;另有 4 个样本具有匹配的正常 DNA 序列数据。这意味着数据集中同时存在肿瘤与正常两类材料,可用于配对比较;但并非所有样本都具备完整的肿瘤—正常配对,其中 1 例缺少匹配的正常 DNA 数据,另 4 例缺少肿瘤 RNAseq 数据。样本的具体编号、测序平台、读长、覆盖深度、文件格式及数据量等信息,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org,原始数据的具体提交机构、样本采集地点、采集时间及伦理审批信息,源站未提供。数据所对应的患者数量为 5 例,均为尤文肉瘤患者,这一信息来自源站对该数据集的描述。
【适用场景】
基于现有数据类型,该数据集可用于肿瘤与正常组织间的外显子层面差异分析,例如体细胞突变筛查、拷贝数变化探索等;具备 RNAseq 数据的样本可用于转录层面的表达分析,并与外显子数据结合开展多组学关联探索。由于样本量较小(5 例患者),该数据更适合作为方法验证、初步探索或与其他尤文肉瘤数据集联合分析的组成部分,而不宜单独用于需要大样本统计效力的研究。具体分析用途需结合研究者自身设计确定,源站未对适用场景作出说明。
【使用方法】
该数据集以样本为单位组织,使用者可按样本区分肿瘤全外显子数据、肿瘤 RNAseq 数据与匹配正常 DNA 序列数据,并根据是否具备配对正常样本选择相应的分析策略。数据的下载方式、访问权限、文件命名规则及配套元数据字段,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集的主要限制在于样本规模较小,仅包含 5 例患者,且各样本的数据类型并不齐备:仅部分样本具备匹配正常 DNA 序列,仅 1 例具备肿瘤 RNAseq 数据,这种不均衡会限制配对分析和多组学联合分析的样本量。此外,测序质量指标、覆盖度、样本纳入标准及数据质控流程等信息,源站未提供,使用前需自行评估数据质量。
【引用与许可】
该数据集的使用许可、引用方式及原始发表文献信息,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据前,应向数据来源平台核实相关许可与致谢要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001008282
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含5名尤文肉瘤患者的样本。其中5个样本具有全外显子组肿瘤数据,1个样本具有肿瘤RNAseq数据,4个样本具有匹配的正常DNA序列数据。
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