dfb2a07a-09ab-4034-8da5-678e3c0a27a1 - samples 数据集

该数据集包含54例Ewing's sarcoma样本的全基因组测序(WGS)数据,样本由加拿大多伦多The Hospital for Sick Children的Adam Shlien实验室完成测序,相关成果发表于Science 2018,并引用Anderson等人关于骨与软组织肿瘤重排爆发产生经典

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基因组分类Genomics
dfb2a07a-09ab-4034-8da5-678e3c0a27a1 - samples

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-28

资源简介

dfb2a07a-09ab-4034-8da5-678e3c0a27a1 - samples 数据集

该数据集收录了54例Ewing's sarcoma(尤文肉瘤)样本的全基因组测序数据,测序工作由加拿大多伦多The Hospital for Sick Children的Adam Shlien实验室完成,相关研究成果发表于Science 2018,并引用了Anderson等人关于骨与软组织肿瘤中重排爆发产生经典基因融合的研究。数据集以基因组学为主题标签,在站内归入肿瘤/其他分类,来源于omicsdi.org。整体而言,这是一份围绕尤文肉瘤全基因组测序的肿瘤基因组学数据资源,可用于观察该队列样本的基因组层面信息,服务于骨与软组织肿瘤相关研究场景。

【数据集背景】

该数据集聚焦于Ewing's sarcoma这一肿瘤类型。Ewing's sarcoma属于骨与软组织肿瘤范畴,其分子特征与基因融合密切相关。数据集的源站描述明确引用了Anderson等人的研究"Rearrangement bursts generate canonical gene fusions in bone and soft tissue tumors",该研究讨论了骨与软组织肿瘤中重排爆发(rearrangement bursts)如何产生经典基因融合(canonical gene fusions)。这一背景说明该数据集所承载的测序样本与基因融合、基因组重排等研究主题存在直接关联。数据集对应的成果发表于Science 2018,测序工作完成于The Hospital for Sick Children(多伦多)的Adam Shlien实验室。

【数据内容】

数据集包含54例Ewing's sarcoma样本的全基因组测序(WGS)数据。全基因组测序意味着数据覆盖样本基因组的整体序列信息,而非仅针对特定基因区域。样本数量为54例,构成一个具有一定规模的肿瘤基因组队列。数据集的英文名称标识为"dfb2a07a-09ab-4034-8da5-678e3c0a27a1 - samples",其中"samples"表明该资源以样本为单位组织。主题标签为Genomics,表明其内容属于基因组学范畴。除上述信息外,关于具体文件格式、数据文件数量、测序深度、覆盖度、变异检出结果等细节,源站未提供。

【采集与来源】

样本的测序工作由加拿大多伦多The Hospital for Sick Children的Adam Shlien实验室完成。数据集来源站为omicsdi.org。源站描述指出,相关成果发表于Science 2018,并引用了Anderson等人关于骨与软组织肿瘤重排爆发产生经典基因融合的研究。关于样本采集的具体临床机构、采集时间、伦理审批信息、样本处理流程等,源站未提供。

【适用场景】

基于其肿瘤类型与全基因组测序属性,该数据集适用于尤文肉瘤及骨与软组织肿瘤的基因组学研究场景,例如围绕基因融合、基因组重排等主题的分析工作。数据集的主题标签为基因组学,也可用于基因组学相关的方法验证或比较研究。由于数据集包含54例样本,可用于队列层面的观察。关于具体的分析类型、下游应用案例或已验证的使用场景,源站未提供。

【使用方法】

源站未提供关于数据下载方式、访问权限、文件组织结构、数据处理流程或分析工具的具体说明。

【质量与限制】

数据集包含54例样本的全基因组测序数据,样本量与测序类型已在源站描述中明确。关于数据质量指标(如测序深度、覆盖均匀性、碱基质量值)、样本纳入排除标准、数据完整性以及已知的技术限制,源站未提供。

【引用与许可】

数据集相关成果发表于Science 2018,并引用Anderson等人"Rearrangement bursts generate canonical gene fusions in bone and soft tissue tumors"一文。关于数据的使用许可条款、引用格式要求或再分发规定,源站未提供。

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源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001004589

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

54例WGS尤文肉瘤样本在多伦多病童医院(Adam Shlien实验室)完成测序,并于2018年发表在《Science》上。参考文献:Anderson等,“Rearrangement bursts generate canonical gene fusions in bone and soft tissue tumors”。

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