脑肿瘤

脑肿瘤是指发生于颅腔内组织的异常新生物，包括原发性和继发性两类。原发性脑肿瘤起源于脑实质、脑膜、垂体、颅神经等结构，最常见的类型为胶质瘤和脑膜瘤。其发病机制涉及基因突变、染色体异常及信号通路失调，导致细胞增殖失控和凋亡抑制。临床表现取决于肿瘤位置、大小及生长速度，常见症状包括进行性头痛、癫痫发作、局灶性神经功能缺损及颅内压增高征象。诊断依靠影像学检查如MRI和CT，确诊需病理活检。治疗策略综合手术切除、放射治疗和化学治疗，精准靶向与免疫治疗日益成为重要方向。脑肿瘤研究聚焦于分子分型、微环境调控及血脑屏障穿透技术，推动个体化诊疗发展。

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共 2983 个数据集

PRJNA818644：ACTR5 CRISPRi敲低HepG2与U87细胞的RNA-seq和ChIP-seq

基因组分类Other

该数据集来自NCBI，包含HepG2肝癌细胞和U87胶质母细胞瘤细胞在CRISPRi敲低ACTR5后的RNA-seq基因表达谱和TST-ChIP-seq染色质靶向数据

PRJNA1516445：ADCC抗T98G胶质母细胞瘤后脱颗粒CD107a+ NK细胞的bulk RNA测序

基因组分类Raw sequence reads

该数据集为PRJNA1516445的原始序列读取，来源于原代人NK细胞对T98G胶质母细胞瘤靶细胞执行ADCC后的bulk RNA测序

PRJNA772959：细胞内组成型活性TrkB激酶域及纯细胞内NTRK2融合癌基因介导的非典型细胞反应

基因组分类Transcriptome or Gene expression

该数据集来自NCBI，对稳定表达TrkB的U87MG人胶质母细胞瘤细胞系进行RNA-seq分子谱分析，涵盖九个测试条件、四个独立mRNA制备样本，每样本约4000万条唯一reads

PRJNA1406743：CXCR4+循环肿瘤细胞在皮下免疫抑制CXCL12水凝胶中聚集

时间序列分类Transcriptome or Gene expression

该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1406743），主题为 CXCR4+ 循环肿瘤细胞（CTCs）在皮下、免疫抑制、负载 CXCL12 的水凝胶中聚集

PRJNA1474031：长期芳烃受体激活对头颈癌进展影响研究

时间序列预测Raw sequence reads

数据围绕长期芳烃受体（aryl hydrocarbon receptor）激活对头颈癌（Head and Neck cancer）进展的影响展开，属于肿瘤研究范畴

PRJNA1514113：自噬抑制增强高级别突变IDH1胶质瘤放疗反应 [CUT&Run]

基因组分类Epigenomics

数据围绕高级别突变 IDH1 胶质瘤中自噬抑制增强放疗反应这一研究方向，采用 CUT&Run 技术产生表观基因组学数据。可用于研究自噬与放疗响应之间的表观遗传调控机制，并支持相关肿瘤生物学分析（来源 NCBI）

DeepSomatic：面向多种测序技术的精准体细胞小变异发现

基因组预测Phenotype or Genotype

该数据集来自 NCBI，属于肿瘤/脑肿瘤方向，主题涉及表型或基因型。研究提出 DeepSomatic，一种基于深度学习的工具，用于从肿瘤-正常短读长和长读长测序数据中检测体细胞 SNV 和 indel

DeepSomatic：面向多种测序技术的体细胞小变异精准发现

基因组预测肿瘤脑肿瘤体细胞变异检测深度学习长读长测序CASTLE数据集胶质母细胞瘤

本研究介绍了 DeepSomatic，一种基于深度学习的工具，用于从肿瘤-正常短读长和长读长测序数据中检测体细胞 SNV 和 indel

PRJNA1277588：DNA损伤剂与DNA损伤修复基因化学基因组相互作用的靶向CRISPR敲除筛选综合探究

基因组回归Other

该数据集来自NCBI，聚焦肿瘤与脑肿瘤领域，围绕DNA损伤剂（DDA）与DNA损伤修复（DDR）基因之间的化学基因组相互作用

PRJNA1303996：N4BP2核酸酶切割胞质暴露染色体引发染色体碎裂与ecDNA

基因组预测Raw sequence reads

该数据集来自NCBI，属于肿瘤/脑肿瘤分类，主题标签为Raw sequence reads。源站描述显示，研究通过靶向全部204种已知及推定人类核酸酶的成像siRNA筛选，鉴定出胞质内切酶N4BP2，其进入破裂微核引发DNA损伤和染色体碎裂，促进ecDNA形成，并在诱导性人类高级别胶质瘤模型中促进D