PRJNA1516445：ADCC抗T98G胶质母细胞瘤后脱颗粒CD107a+ NK细胞的bulk RNA测序

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1516445

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
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数据说明

本研究呈现了针对T98G胶质母细胞瘤靶细胞进行抗体依赖性细胞介导的细胞毒性作用（ADCC）后，从原代人自然杀伤（NK）细胞中产生的批量RNA测序数据。NK细胞在四种条件下与T98G细胞共培养：（1）未刺激的对照NK细胞，（2）NK细胞+T98G细胞（无抗体），（3）NK细胞+T98G细胞+抗GD2抗体，（4）NK细胞+T98G细胞+与ADC（抗体偶联药物）偶联的抗GD2抗体。共培养后，根据CD107a（溶解性颗粒胞吐的标志物）的表面表达分离脱颗粒的NK细胞。本研究的主要目的是比较上述条件下CD107a+脱颗粒NK细胞的转录谱，以描绘与ADCC介导的活化相关的分子特征，包括有无ADC共刺激的情况。通过比较全局基因表达模式，本数据集旨在识别由抗GD2抗体和ADC介导的胶质母细胞瘤靶向所触发的NK细胞活化、细胞毒性、细胞因子产生及代谢重编程中涉及的关键通路。

这些发现为NK细胞介导的针对表达GD2的肿瘤的ADCC机制提供了关键见解，并可能为胶质母细胞瘤及其他GD2阳性恶性肿瘤改进免疫治疗策略的开发提供依据。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。