PRJNA1514113：自噬抑制增强高级别突变IDH1胶质瘤放疗反应 [CUT&Run]
数据围绕高级别突变 IDH1 胶质瘤中自噬抑制增强放疗反应这一研究方向，采用 CUT&Run 技术产生表观基因组学数据。可用于研究自噬与放疗响应之间的表观遗传调控机制，并支持相关肿瘤生物学分析（来源 NCBI）
![PRJNA1514113: Autophagy Inhibition Sensitizes Radiotherapy Responses in High-grade Mutant IDH1 Glioma [CUT&Run]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/70693.jpg)
基本信息
资源简介
PRJNA1514113：自噬抑制增强高级别突变IDH1胶质瘤放疗反应 [CUT&Run]
PRJNA1514113 是一个围绕高级别突变 IDH1 胶质瘤中自噬抑制增强放疗反应这一研究方向而建立的生物项目，其英文全称为 Autophagy Inhibition Sensitizes Radiotherapy Responses in High-grade Mutant IDH1 Glioma [CUT&Run]。该项目采用 CUT&Run 技术产生表观基因组学数据，主题标签为 Epigenomics，在分类上归属于肿瘤 / 脑肿瘤领域。作为 NCBI BioProject 体系中的一条记录，它为研究者提供了一个集中入口，用以发现和链接围绕该研究计划所产生的多种数据类型。整体而言，该数据集可用于探索自噬与放疗响应之间的表观遗传调控机制，并支持相关的肿瘤生物学分析，尤其适用于关注高级别突变 IDH1 胶质瘤放疗敏感性问题的研究场景。
【数据集背景】
该数据集所对应的研究主题是高级别突变 IDH1 胶质瘤中的放疗反应调控，具体聚焦于自噬抑制如何增强放疗反应。IDH1 突变是胶质瘤中具有重要生物学意义的事件，而高级别胶质瘤的治疗往往涉及放疗。该研究将自噬抑制与放疗响应联系起来，试图从表观遗传层面理解这一过程。数据集以 BioProject 的形式组织，BioProject 是围绕单一研究计划、来自单一组织或联合体的一组生物数据的集合，其记录为用户提供查找该项目所产生各类数据的统一位置。该项目的主题标签为表观基因组学，说明其数据产出以表观基因组学为核心。
【数据内容】
该数据集采用 CUT&Run 技术产生表观基因组学数据。CUT&Run 是一种用于研究染色质相关蛋白结合或组蛋白修饰的技术，属于表观基因组学研究的常用手段。数据集的主题标签为 Epigenomics，进一步表明其内容属于表观基因组学范畴。除上述信息外，关于数据的具体样本数量、测序深度、覆盖范围、数据文件类型与规模等，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI 的 BioProject 体系，记录标识为 ID 1514113。其英文名称中包含 PRJNA1514113 这一项目编号。源站对 BioProject 的说明指出，BioProject 是围绕单一研究计划、来自单一组织或联合体的一组生物数据的集合，并为用户提供查找该项目所产生多种数据类型的统一入口。关于样本采集的具体地点、时间、伦理审批信息以及实验操作细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集可用于研究自噬与放疗响应之间的表观遗传调控机制，并支持相关肿瘤生物学分析。其主题标签为表观基因组学，分类归属为肿瘤 / 脑肿瘤，因此适用于关注高级别突变 IDH1 胶质瘤、放疗反应、自噬调控以及表观基因组学分析的科研场景。研究者可借助该 BioProject 记录查找围绕该研究计划所产生的多种数据类型，进而开展机制探索或与其他组学数据整合的分析。关于更具体的适用分析流程或推荐工具，源站未提供。
【使用方法】
该数据集以 BioProject 记录的形式提供，用户可通过 NCBI BioProject 体系访问，并借助该记录查找围绕同一研究计划所产生的多种数据类型。其英文名称中包含的项目编号 PRJNA1514113 可作为检索与引用时的标识。关于数据下载方式、文件格式说明、预处理步骤或分析流程，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来自 NCBI BioProject，属于围绕单一研究计划的生物数据集合。其主题标签为表观基因组学，采用 CUT&Run 技术产生数据。关于数据质量评估指标、批次效应、样本量、重复数、数据完整性或潜在偏差等具体信息，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，记录标识为 ID 1514113，英文名称中包含项目编号 PRJNA1514113。关于该数据集的引用格式、许可条款或使用限制，源站未提供。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
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使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1514113
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
突变型异柠檬酸脱氢酶1（mIDH1）催化2-羟基戊二酸（2-HG）的生成，导致TP53/ATRX缺失的星形细胞瘤发生表观遗传重编程。RNA测序、单细胞RNA测序和染色质免疫沉淀测序及后续分析显示，人和小鼠mIDH1胶质瘤中线粒体代谢相关的基因本体（GOs）下调，而自噬相关的GOs上调。线粒体代谢降低伴随糖酵解减少，使自噬成为mIDH1胶质瘤的能量来源。突变型IDH1胶质瘤细胞自噬相关蛋白表达增加，LC3 I/II转化增强，表明自噬增强。通过给予包裹自噬相关基因7沉默RNA的合成蛋白纳米颗粒在体内抑制自噬，使mIDH1胶质瘤细胞对放疗敏感，导致肿瘤消退、长期生存和免疫记忆。这项工作揭示了自噬是mIDH1胶质瘤生存的关键途径，抑制自噬可在体外使人和小鼠mIDH1胶质瘤细胞对放疗敏感，并在体内mIDH1模型中产生放疗增敏效应。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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