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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 1403 个数据集

生理信号神经科学时序数据癫痫脑电信号

Bonn EEG — 经典癫痫脑电分类基准

500 段单通道 EEG每段 23.6 秒173.61 HzASCII TXT 免费下载约 20 MB10 名受试者（5 名健康志愿者 + 5 名癫痫患者）

500 段单通道 EEG 的癫痫检测世界基准，5 组状态 × 23.6 秒

Universitat Pompeu Fabra（巴塞罗那庞培法布拉大学）NTSA 课题组（原始采集：德国波恩大学癫痫学系） url: https://www.upf.edu/web/ntsa/downloads 87

医学影像医疗NLP视觉问答评测基准

OmniMedVQA — 综合医学视觉问答基准

118,010 张医学影像127,995 个多选题12 种影像模态73 个来源数据集JSON 标注 + 原始图像不适用（影像问答评测基准，非患者队列）

118,010 张影像、127,995 个多选题的 12 模态医学 VQA 评测基准

上海人工智能实验室与香港大学（OpenGVLab） url: https://github.com/OpenGVLab/Multi-Modality-Arena 60

医学影像乳腺癌病理图像肿瘤学

TUPAC16 — 乳腺肿瘤增殖 WSI 评分挑战

约 821 张 WSI训练 500 + 测试 321注册后获取H&E SVS 全切片821 例 TCGA-BRCA + 73 例荷兰辅助有丝分裂病例

乳腺 WSI 肿瘤增殖评估标准挑战 · 821 张 WSI · 三大任务

Eindhoven 医学图像分析组 (IMAG/e) / Radboud DIAG url: https://tupac.grand-challenge.org/ 63

医学影像眼科影像医学图像分割皮肤影像骨骼肌肉影像

HRF — 45 幅高分辨率眼底血管分割基准

45 幅 3504×2336 眼底照健康DR青光眼各 15 幅单套专家共识血管金标准双专家视盘定位标注约 73 MB 开放直链下载45 幅眼底图像（健康、DR、青光眼各 15 幅；每幅独立病例）

45 幅 3504×2336 眼底照，健康/DR/青光眼三分组血管分割基准

Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg (FAU), Pattern Recognition Lab url: https://www5.cs.fau.de/research/data/fundus-images/ 63

公共卫生与流行病学神经科学儿科脑影像队列研究

HBN — 儿童青少年脑与精神健康跨诊断队列

约 4,867 名受试者多模态 MRIEEG表型BIDS 格式CC BY-NC-SA 与 CC BY-SA 双许可DUA 申请获取约 4,867 名 5-21 岁受试者（Release 11，数据截至 2022-11）

5-21 岁约 4,867 名受试者的跨诊断儿童脑与精神健康开放生物样本库

Child Mind Institute（美国儿童心理研究所） url: https://fcon_1000.projects.nitrc.org/indi/cmi_healthy_brain_network/ 109

医学影像内窥镜影像目标检测手术视频结直肠癌

SUN Database — 昭和大学结肠镜视频数据库

113 段 HDTV 白光结肠镜视频158,690 帧逐帧边界框标注99 名患者100 个病理确诊息肉JPEG + TXT 角点坐标免费申请获取99 名患者（男 71 / 女 28，中位年龄 69 岁）

113 段结肠镜视频 · 158,690 帧逐帧息肉边界框

昭和大学北横滨医院消化疾病中心 & 名古屋大学 Mori 研究室 url: http://sundatabase.org/ 91

电子健康记录医疗NLP时序数据重症监护

CCCDB — 中文危重症 ICU 电子病历数据库

约 3.19 GB CSV8,180 例 ICU 住院7,638 名患者10 张关系表凭证化访问7,638 名 ICU 患者（8,180 例住院）

8,180 例 ICU 住院、10 张关系表、约 3.19 GB 中文危重症 EHR

Zhejiang Provincial People's Hospital（浙江省人民医院） url: https://physionet.org/content/zhejiang-ehr-critical-care/ 119

公共卫生统计死亡登记流行病学

CDC WONDER — 美国公共卫生统计查询平台

30+ 在线数据库1999-2020 死因聚合XML API 免鉴权公共领域免费全美死亡证书聚合（2020 年 3,383,729 例）

30+ 公共卫生数据库 · 1999-2020 死因统计 · 免费 XML API

U.S. Centers for Disease Control and Prevention (CDC) / National Center for Health Statistics (NCHS) url: https://wonder.cdc.gov/ 72

药物发现与化学分子对接虚拟筛选

DUD-E — 分子对接诱饵基准

102 个蛋白靶标22,886 个活性配体（ChEMBL）约 110 万性质匹配诱饵（ZINC1:50）SMILESmol2SDF 三格式 + receptor.pdb不适用（纯小分子-靶标计算基准，无人类受试者数据）

102 靶标 · 22,886 活性物 · 约 110 万性质匹配诱饵的虚拟筛选基准

UCSF Irwin & Shoichet 实验室（加州大学旧金山分校药化系） url: http://dude.docking.org/ 111

医学影像内窥镜影像手术视频

SLAM 3D Endoscopic — 内窥镜三维重建与定位

35 子数据集（EndoSLAM）6 相机多分辨率合成 + 真实数据6D 位姿真值MICCAI 2022 挑战赛Ex-vivo 猪器官（EndoSLAM）+ 3 例患者真实结肠镜（SimCol3D）

Bogazici University & UCL WEISS & University of Coimbra & Harvard Medical School & Stanford & NUS 108

电子健康记录药物发现与化学临床电子病历真实世界数据药物安全

CGRD — 中国台湾最大多院区电子病历库

约 500 万门诊患者（2000）约 290 万住院患者（2000）2000 年起每年更新ICD-9/10-CM 编码院内申请审核获取约 500 万门诊与 290 万住院患者样本（2000 年口径）

中国台湾长庚体系约 790 万患者去标识化多院区电子病历研究数据库

长庚医疗财团法人（Chang Gung Medical Foundation, CGMH） url: https://www.cgmh.org.tw 74

医学影像骨骼肌肉影像CT医学图像分割

CTSpine1K — 千例脊柱CT椎体分割数据集

1,005 例脊柱 CT11,172 个标注椎体约 150GB NIfTICC BY-NC-SA 4.0官方三段划分1,005 例受检者

1,005 例多中心脊柱 CT，11,172 个椎体实例级标注

中国科学院计算技术研究所智能信息处理重点实验室（MIRACLE 中心） url: https://github.com/MIRACLE-Center/CTSpine1K 67

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