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共 1838 个数据集
EPA CompTox Chemicals Dashboard — 137 万化学品毒理与暴露信息聚合门户
美国 EPA 计算毒理学与暴露中心（CCTE）打造的化学品信息「一站式门户」：以 DSSTox 身份体系（DTXSID/DTXCID）为骨架，聚合 ToxCast 体外生物活性、ToxValDB 毒性值、ToxRefDB 动物毒性、CPDat 用途、OPERA 预测等 20 余个数据源，覆盖 1,376,722 种化学品，全部美国政府公共领域开放数据；本文厘清「门户 ≠ 单一数据集」的边界，并给出 API 只读取数与批量下载的实操路径
TCMBank — 全球最大免费中医药关系型数据库
9191 种草药、61965 种成分、15179 个靶标与 32529 种疾病构成六对异质关系网络——中山大学陈语谦团队以 IDIM 智能文献识别+两次人工验证持续更新，并提供 mol2 三维结构支撑虚拟筛选与集成学习药物重定位
HERB 2.0 — 中医药临床与实验证据一体化知识库
本草组鉴 2.0：整合 8,558 项临床试验、8,032 项荟萃分析、2,231 项高通量实验与 6,644 篇参考文献，汇聚 129,441 个实体与 287 万条关系的九类实体中医药知识图谱，并以连接图谱把中药-成分-方剂映射到现代药物与疾病
Real-MedNLP — 首个真实英日平行病例与放射报告的医学 NLP 共享任务
NTCIR-16 上以 224 篇真实病例报告与 135 篇真实放射报告为基座、覆盖日语原文与英语人工翻译的 MedTxt 平行语料，含低资源 NER、药物不良事件提取、同一病例识别三类任务，9 支队伍参赛，CC BY 4.0 训练部分公开释放
SPRSound — 首个公开儿科呼吸音数据库：2,683 条录音与 9,089 个事件的听诊 AI 基准
上海交大联合上海儿童医学中心采集的儿科呼吸音库——1 个月至 18 岁、11 名儿科医师金标准标注、自研 SoundAnn 标注软件，历经 2022-2025 四届 IEEE BioCAS 呼吸音挑战赛，从事件级/记录级分类扩展到压缩与事件检测双赛道
HF_Lung_V1 — 开放获取肺音数据库与呼吸相位检测基准
Heroic-Faith 与台湾团队构建的 9,765 段 15 秒肺音库——含 34,095 吸气/18,349 呼气/13,883 连续异常音/15,606 爆裂音标签，自研 HF-Type-1 八麦克风设备，CC BY 4.0 于 GitLab 公开，八种 RNN 变体基准确立双向优于单向、加 CNN 增益的结论
COPS — 帕金森病症状连续观测：双腕加速度计与逐小时症状日记同步数据集
德国科隆大学医院 66 例帕金森病患者佩戴 GENEActiv 双腕三轴加速度计（100 Hz）最多 7 天，逐小时填写运动状态/震颤/冻结步态/跌倒/用药日记，产出 393.8 天同步金标准数据，CC BY 4.0 于 OSF 公开
KPIs 2024 — MICCAI 2024 肾小球分割挑战赛
MICCAI 2024 首个肾脏病理功能单元分割挑战赛——逾 10,000 个肾小球标注、60+ 张 PAS 染色全切片、10,428 个 2048×2048 patch，以 DSC 与 F1 双指标在四种 CKD 啮齿模型上建立肾小球分割基准
EMPIAR — 电镜公共图像档案：冷冻电镜原始图像的全球总库
Electron Microscopy Public Image Archive 收录单颗粒冷冻电镜原始帧、电子断层倾斜系列、体积电镜与 X 射线断层三维数据集，2026 年累计 3,196 条、9.42 PiB，EMBL-EBI 运营、CC0 公共领域奉献、REST API 免认证开放，与 EMDB 三维图谱、PDB 原子坐标构成三方协作归档体系
NB-TCM-CHM — 宁波中医药材果实图像数据集 — 20 类中药果实 3,784 张图与深度学习识别基线
宁波大学等打造的首个公开发布中药材果实图像数据集：网络爬取 3,384 张加中药房手机实拍 400 张，覆盖补骨脂、枸杞子、五味子等 20 类果实，中医师逐张标注、CC BY 4.0 公开于 Mendeley Data
Lacuna — 跨三大洲 60 万住院的重症监护协调时序数据集
把美欧中九个 ICU/ED 源库用 ricu 概念层协调成近 10 亿数据点的超大规模时序集合——首次纳入治疗变量（给药速率与剂量），并为跨院迁移学习立基准：LightGBM 仍胜深度模型
MAUDE — FDA 医疗器械不良事件报告数据库
美国 FDA 依 21 CFR Part 803 强制收集的医疗器械不良事件（MDR）库：制造商/进口商/使用机构/自愿者四路报告，1991 年以来累计逾 2,300 万条，CC0 公有领域开放，配套 openFDA API 与全量 pipe-delimited 下载——器械安全监测的全球基准库
定制数据集服务
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