即取即用的 AI-Ready 医疗数据集库

千方医数集致力于为医疗 AI 研究人员找到合适的数据集，让你的 AI 感知模型能够更快地学习、更准确地运行，并无缝适应现实世界的环境。

医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 1808 个数据集

医学影像X光影像目标检测图像分类骨骼肌肉影像

VinDr-SpineXR — 万张脊柱 X 光病灶检测集

人工标注原始数据影像数据10,466 张脊柱 X 光片（5,000 studies；train 8,389/test 2,077）——13 类病灶 bounding box 标注（含 No finding 共 14 值）

10,466 张脊柱片 13 类病灶框标注：VinDr 家族挂牌最早的脊柱先行者，MICCAI 顶会背书+官方双 baseline

Hospital 108（H108）+ Hanoi Medical University Hospital（HMUH）双院 PACS 2011-2020 采集 >50,000 原始；双 IRB；脱标识三步（含 4 人独立双轮像素复核）；20,000 人工种子+CNN 半自动过滤；VinDr-Lab 3 医生标注 53

医学影像脑肿瘤医学图像分割肿瘤学

BraTioUS — 脑肿瘤术中超声多中心数据集

影像数据人工标注原始数据142 例胶质瘤患者（1669 张 B-mode 二维 ioUS 图像，每图 1 个专家精修分割掩膜）

六院五国 142 例胶质瘤手术中采集的 1669 张 B-mode 二维术中超声（ioUS）图像与专家精修肿瘤分割掩膜——nnU-Net 伪标签 + 神经外科医师 ITK-SNAP 复核，CC BY 4.0 于 Zenodo 公开，为术中实时判读与导航 AI 提供跨设备跨协议多样性

Rio Hortega University Hospital（西班牙）、Tata Memorial Center（印度）、CHRU de Tours（法国）、Carlo Besta Neurological Institute（意大利）、University of Palermo（意大利）、Massachusetts General Hospital（美国）六中心 2018–2023 术中采集 43

医学影像医学图像分割目标检测

heart-lung-segmentations — 心肺手工分割金标准

医学影像分割掩码边界框338 个心掩码（200 MIMIC + 138 Montgomery）+ 200 个肺掩码（MIMIC）

538 个手工金标准掩码：训练出 96K 胸片生物标志物的那批'教科书标注'

MIMIC-CXR/MIMIC-CXR-JPG 半随机 PA 子集（200）+ Montgomery County TB 库全量 PA（138）；ITK-Snap 勾画自 DICOM 49

生理信号电子健康记录

MIMIC-IV Waveform Database — 重症监护波形数据库

200 记录198 患者12.8 GBECG 250 Hzv0.1.0 预览版198 名 ICU 患者（v0.1.0 技术预览版；代理 subject_id + 与 MIMIC-IV 共享的代理日期）

MIMIC-IV 生态的波形模块：ECG 250 Hz 多采样率体系 · FLAC 压缩 · 共享 date shift——新一代 ICU 波形的技术预览与路线图

https://physionet.org/content/mimic4wdb/ 64

电子健康记录重症监护

浙江重症监护数据库 — 省人民医院 EHR 数据集

7,638 名患者8,180 次住院11,082,482 条检验记录214 种检验项目3.22 GB 全开放下载7,638 名独立患者 / 8,180 次住院

浙江重症 EHR 库：7,638 名患者 × 8,180 次住院 × 11,082,482 条检验记录——中国三级医院十年重症数据，3.22 GB 全开放下载

https://physionet.org/content/zhejiang-ehr-critical-care/1.0/ 95

医学影像医学图像分割图像分类评测基准

TN3K — 3,493 张甲状腺结节超声像素级分割数据集

人工标注影像数据原始数据2,421 例患者（3,493 张甲状腺结节超声图；官方划分 trainval 2,879 / test 614，同患者不跨子集）

中山大学联合南方医科大学珠江医院发布的开放获取甲状腺结节超声分割数据集——3,493 张多中心多设备灰度超声图配像素级二值结节掩码与良恶性标签，官方划分 2,879/614，随 TRFE+ 腺体先验多任务分割论文（CBM 2022）发布，发布时大幅超越此前唯一无使用限制的公开库 DDTI 的 637 张单中心规模

南方医科大学珠江医院 30,000+ 张甲状腺超声图中筛选（GE Logiq E9、ARIETTA 850、RESONA 70B 三种超声系统）：3,493 张灰度超声图 + 像素级二值结节掩码 + 良恶性二元标签（label4trainval.csv / label4test.csv）+ 五折划分 json 89

医学影像病理图像乳腺影像挑战赛数据集乳腺癌评测基准

BCI — 乳腺癌 H&E 到 IHC 配对图像生成基准

影像数据原始数据人工标注51 名患者（51 对连续切片 WSI，每对含一张 H&E 与一张 HER2 IHC）；产出 9746 张图像 = 4873 对（train 3896 对 + test 977 对）

首个公开配对 H&E 与 HER2 IHC 的乳腺癌图像翻译基准：51 对全切片切出 4873 对 1024×1024 图像块，3896 对训练加 977 对测试，四级 HER2 标签，PyramidPix2pix 基线，PSNR 加 SSIM 双指标，CVPR 2022 Workshop 发布并衍生 Grand Challenge 竞赛

Hamamatsu NanoZoomer S60 扫描的乳腺癌切除标本连续切片 WSI（H&E 与 HER2 IHC 各一张，20×，0.46 μm/px）；投影变换手工对齐后经 Elastix toolbox 精配准，切为 1024×1024 tile；文件名编码 split 与 WSI 级 HER2 等级（0/1+/2+/3+） 61

医疗NLP命名实体识别临床文本知识图谱

DisTEMIST — 西语临床疾病实体标注与 SNOMED CT 链接语料

1,000 篇临床案例10,665 个疾病注释7,303 个唯一 SNOMED CT 编码15.8 MB ZIPCC BY 4.0 开放下载1,000 份已发表临床病例文档（无患者级记录链接）

1,000 篇西语临床案例，10,665 个疾病注释人工映射 SNOMED CT

巴塞罗那超算中心（BSC）TeMU 团队 url: https://zenodo.org/records/7614764 60

医疗NLP临床文本评测基准挑战赛数据集电子健康记录

TREC 2021 Clinical Trials Track — 患者简况到 37.6 万临床试验的匹配评测基准

文本数据人工标注评测基准75 份合成患者简况（synthetic case，受真实病例启发但非真实患者数据；每份 5-10 句入院记录式自由文本）

NIST 第三十届 TREC 临床试验赛道评测三件套：ClinicalTrials.gov 2021-04-27 快照 375,580 份试验注册语料 + 75 份合成患者入院简况 + 35,832 条 OHSU 医师三级相关性判定，patient-to-trial matching 任务元年基准，nDCG@5/@10 主指标，ir_datasets clinicaltrials/2021 一键加载

ClinicalTrials.gov 2021-04-27 注册库快照（375,580 份试验 XML，5 个 zip 分卷）+ topics2021.xml（75 份合成患者简况）+ qrels2021.txt（35,832 条三级判定）+ 113 个参赛 run 官方评估结果 43

医学影像CT心血管疾病挑战赛数据集评测基准医学图像分割

orCaScore — 自动冠状动脉钙化评分评测框架

影像数据专家标注临床数据72 例患者（32 训练 + 40 测试）；每例含 1 对 CSCT+CCTA

MICCAI 2014 波士顿发起的自动冠状动脉钙化评分评测框架——72 例多中心心脏 CT（32 训练/40 测试，四院四厂商），CSCT+CCTA 配对，三级评测（病灶/血管/患者），五个（半）自动方法的独立横评，Grand Challenge 平台托管

四家医院、四种厂商 CT 扫描仪采集的非增强 ECG 触发心脏钙化评分 CT（CSCT）+ 配对增强 CTA（CCTA）；参考标准由两名专家独立标注>130 HU、3-D 6-connectivity 连通病灶、LAD/LCX/RCA 血管归属，分歧共识复核；mhd/zraw MetaImage 格式 50

电子健康记录生理信号心电信号重症监护时序数据临床电子病历

MOVER — 首个公开手术室高保真波形与电子病历配对仓库

原始数据时序数据临床数据58,799 唯一患者 / 83,468 台手术（SIS 数据集 19,114 患者；EPIC 数据集 39,685 患者 / 64,354 手术）

UC Irvine 医学中心 2015-2022 年 58,799 患者 / 83,468 台手术的围术期医学信息学仓库——手术室内 ECG、脉搏血氧（PPG）与动脉压三通道高保真波形与 EHR 事件配对，SIS+EPIC 双系统覆盖，签 DUA 免费开放，是麻醉与术中决策支持 AI 迄今唯一的公开波形级数据基座

UC Irvine 医学中心手术室围术期数据（2015-2022）：手术室内高保真生理波形（ECG/脉搏血氧 PPG/动脉压）经 Bernoulli Health 平台实时抓取 + EHR 配对（SIS 系统 2015-2017 九表 / EPIC 系统 2017-2022 十表），HIPAA 合规去标识 171