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医学影像 AI-Ready 数据集

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电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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共 49 个数据集

药物发现化学信息学药物敏感性癌细胞系精准肿瘤学

CTRP v2 癌细胞系药敏数据库 — AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 900 细胞系 × 545 化合物AUCEC50 药敏 + 分子特征开放下载 CC BY 4.0txtCSV 多表非患者数据，细胞系药敏数据

约 900 细胞系 × 545 化合物的肿瘤药敏矩阵与分子特征库

Broad Institute, Center for the Science of Therapeutics (CTD²) url: https://portals.broadinstitute.org/ctrp.v2.1/ 4

神经影像自闭症谱系障碍公共卫生与脑神经静息态 fMRI多中心联盟

ABIDE — 自闭症脑成像多中心联盟开放数据集 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 2,226 个影像数据集539+521 名 ASD 受试者rs-fMRI + T1 + 73 字段表型CC BY-NC-SA 开放获取2,156 名独立受试者（官网口径 2,226 个数据集）

17+19 站点 2,226 个 rs-fMRI/T1 自闭症脑影像开放数据

ABIDE Consortium（NYU Langone / Nathan S. Kline Institute / Child Mind Institute） url: http://fcon_1000.projects.nitrc.org/indi/abide/ 2

肿瘤学病理组织与全切片肺癌结直肠癌图像分类

LC25000 — 肺与结肠 H&E 病理图像分类基准 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

25,000 张 H&E 图像768×768 JPEG1.85 GB ZIP5 类各 5,000 张免费开放下载病例数未披露（1,250 个原始组织 tile，患者与玻片层级元数据未公开）

25,000 张 H&E 肺与结肠病理图像，5 类均衡分类基准

James A. Haley Veterans' Hospital 病理科 / University of South Florida url: https://github.com/tampapath/lung_colon_image_set 2

临床电子病历重症监护围术期医学麻醉信息学结局预测

INSPIRE 首尔大围术期数据库 — 围术期医学 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

131,109 例手术6 张数据表 CSV72 项术中参数38 项实验室指标近 1,000 万条用药记录CITI 培训 + DUA 申请获取约 13.1 万例手术（131,109 例，占全院 50% 随机抽样）

首尔国立大学医院 131,109 例手术的十年围术期电子病历数据库

首尔国立大学医院（Seoul National University Hospital, SNUH） url: https://physionet.org/content/inspire/ 4

基因组学队列研究精准医学多组学心血管

TOPMed — 心肺血液睡眠多组学旗舰 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

96,620 份 30x WGS（freeze 8）约 4.28 亿过 QC 变异RNA-seq甲基化代谢组多组学dbGaP 受控访问逾 18 万名参与者（WGS freeze 8 为 96,620 人）

逾 18 万份 30x 全基因组 + 深度表型的心肺血液睡眠精准医学资源

National Heart, Lung, and Blood Institute (NHLBI), NIH url: https://topmed.nhlbi.nih.gov 5

重症医学电子健康记录时序数据自然语言处理预后预测

CCCDB — 中文危重症 ICU 电子病历数据库 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 3.19 GB CSV8,180 例 ICU 住院7,638 名患者10 张关系表凭证化访问7,638 名 ICU 患者（8,180 例住院）

8,180 例 ICU 住院、10 张关系表、约 3.19 GB 中文危重症 EHR

Zhejiang Provincial People's Hospital（浙江省人民医院） url: https://physionet.org/content/zhejiang-ehr-critical-care/ 4

医学影像内镜图像息肉分割公开基准计算机视觉

CVC-ColonDB — 结肠镜息肉分割经典基准 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

380 帧结肠镜图像15 段检查序列574×500 像素像素级二值息肉 mask原始版含 1,706 个文件（4 组）研究用途免费获取15 例结肠镜检查（各文献记载 13–15 例不一）

380 帧专家标注结肠镜息肉分割图像，源自 15 段检查序列的单中心经典基准

Computer Vision Center, Universitat Autònoma de Barcelona（CVC-UAB） url: http://mv.cvc.uab.es/projects/colon-qa/cvc-colondb 5

医疗NLP多模态基准医学影像基因组

MultiMedBench — 谷歌医学多任务多模态基准 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

14 项任务12 个数据集超 100 万样本7 种数据模态许可证混合（部分需 CITI 认证）无统一打包下载Google Research 发布超 100 万样本（12 个去标识化数据集）

Med-PaLM M 配套评测基准 · 14 任务 12 数据集 7 模态 · 超 100 万样本

Google Research & Google DeepMind url: https://research.google/pubs/towards-generalist-biomedical-ai/ 11

队列研究公共卫生基因组生存分析

China Kadoorie Biobank — 中国慢性病队列 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

512,891 名参与者10 地区（5 城 5 乡）随访近 20 年10 万人基因分型申请审核获取中国大陆香港学术免费51.2 万名参与者

全球最大中国人群前瞻队列 · 51.2 万参与者 · 随访近 20 年

牛津大学人口健康系 & 北京大学公共卫生学院 & 中国医学科学院 url: https://www.ckbiobank.org/ 11

肿瘤学病理组织图像分类

BreakHis — 乳腺癌组织病理图像数据库 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

7,909 张 H&E 显微图像82 名患者40×-400× 四倍率约 4 GB PNG免费非商业使用82 名患者

乳腺癌病理图像分类的事实基准 · 7,909 张图像 · 82 名患者

巴西巴拉那联邦大学（UFPR）VRI 实验室 & P&D Laboratory url: https://web.inf.ufpr.br/vri/databases/breast-cancer-histopathological-database-breakhis/ 7

- "队列研究" - "心血管" - "纵向临床数据" - "公共卫生"

Framingham Heart Study — 心血管流行病学奠基队列 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

- "约 15,000 名参与者（三代+Omni）" - "随访超 75 年" - "教学数据集免申请" - "dbGaPBioLINCC 申请获取" - "风险评分发源地"约 1.5 万名参与者

现代医学最长寿三代心血管队列 · 约 1.5 万人 · 随访 75 年+ · 风险评分发源地

name: "NHLBI & 波士顿大学弗雷明汉心脏研究" url: "https://www.framinghamheartstudy.org/" 10

基因组学转录组eQTL参考图谱

GTEx — 人类组织基因表达调控图谱 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 1.74 万 RNA-seq 样本（V8）948 名供体 · 54 种组织WGS 中位 32×汇总数据开放免注册基因型需 dbGaP 申请948 名供体 · 1.74 万组织样本

全球最大健康人多组织表达与 eQTL 参考图谱 · 948 供体 · 54 组织

NIH Common Fund GTEx 项目（Broad Institute LDACC） url: https://gtexportal.org/home/ 9

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