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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 147 个数据集

眼科眼底影像病理性近视图像分割医学分类

PALM — 病理性近视眼底多任务分割 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

1,200 张眼底彩照400/400/400 官方划分4 项任务多标签研究用途注册获取720 名受试者 / 1,200 只左眼眼底照

1,200 张眼底照 · 病理性近视分类＋病灶/视盘分割＋中央凹定位

iChallenge / Zhongshan Ophthalmic Center & Baidu（IEEE DataPort / FigShare 存档） url: https://palm.grand-challenge.org 2

医疗 NLP 与多模态Medical VQA影像问答

VQA-Med — 医学影像视觉问答年度评测 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

跨 7 个年度版本累计约 3.5 万 QA 对放射+内镜多模态竞赛注册后获取逐年评测协议完整匿名医学影像问答对（非患者级，约 3.5 万 QA 对/7 年版）

ImageCLEF 年度医学 VQA 挑战系列：2018-2024，多模态影像 + QA 对评测基准

ImageCLEF / CLEF url: https://www.imageclef.org/ 2

乳腺癌多组学队列基因组学预后分型

METABRIC — 乳腺癌分子分型大队列 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

2,509 例原发性乳腺肿瘤mRNA + CNA + 突变 + 临床中位随访约 10 年cBioPortal 开放获取2,509 例原发性乳腺肿瘤患者

乳腺癌整合基因组+转录组开创性队列 · 2,509 例 · 引用 7,000+

University of Cambridge & British Columbia Cancer Agency（METABRIC Consortium） url: https://www.cbioportal.org/study/summary?id=brca_metabric 2

病理组织与全切片肿瘤学乳腺癌AI 医学影像挑战

TUPAC16 — 乳腺肿瘤增殖 WSI 评分挑战 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 821 张 WSI训练 500 + 测试 321注册后获取H&E SVS 全切片821 例 TCGA-BRCA + 73 例荷兰辅助有丝分裂病例

乳腺 WSI 肿瘤增殖评估标准挑战 · 821 张 WSI · 三大任务

Eindhoven 医学图像分析组 (IMAG/e) / Radboud DIAG url: https://tupac.grand-challenge.org/ 3

放疗计划CT 影像器官分割胸部肿瘤

LCTSC — 肺癌放疗 CT 正常器官勾画挑战 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

60 例胸部放疗 CT5 类正常器官勾画5.15GB DICOMCC BY 3.0 公开60 例患者

60 例胸部放疗 CT + 5 类正常器官勾画，TCIA 公开基准

The Cancer Imaging Archive (TCIA) url: https://www.cancerimagingarchive.net/collection/lctsc/ 2

EHR理赔行政档案健康保险药物流行病学全人群队列

NHIRD — 台湾健保理赔全人群数据库 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

覆盖约 2,300 万参保人单项目≤10%人口可申请卫生福利资料科学中心审批制ICD-9-CMICD-10-CMLHID 1 百万抽样子集覆盖约 2,300 万中国台湾省参保人

覆盖 2,300 万中国台湾省参保人理赔档案，可串联 70+ 健康数据库

中国台湾卫生福利部统计处 / 卫生福利资料科学中心 url: https://dep.mohw.gov.tw/DOS/cp-5119-59201-113.html 2

脑神经转录组公共健康

Allen Brain Atlas — 多模态脑图谱 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 20,000 个基因 ISH3,702 个人脑微阵列样本非商业免费须引用非患者队列（脑组织转录组/连接组研究图谱）

全脑基因表达+连接组+细胞类型多模态公共图谱

Allen Institute for Brain Science url: https://portal.brain-map.org/ 2

外科手术内窥镜与 3D 重建手术视频实例分割

HeiCo — 结直肠腹腔镜手术器械分割 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

30 段结直肠腹腔镜视频14 类手术相位10,040 帧实例分割掩码CC BY-NC-SASynapse 申请获取30 例结直肠腹腔镜手术视频

30 段结直肠腹腔镜视频 + 14 相位 + >10,000 帧实例分割标注

DKFZ / Heidelberg University Hospital url: https://link.springer.com/article/10.1038/s41597-021-00882-2 2

眼科与视觉眼底成像医学影像多标签分类

RFMiD — 视网膜多病种眼底图像数据集 | AI-Ready 百科 | 千方病案医数集

3,200 张眼底彩照45+ 病种多标签CC-BY 4.0竞赛托管获取3,200 张眼底图像（图像级，非独立患者计数）

3,200 张眼底彩照 · 45+ 病种多标签标注 · 罕见病长尾筛选

RIADD Grand Challenge (Grand Challenge in Biomedical Image Analysis) url: https://riadd.grand-challenge.org/ 2

医疗 NLP 与多模态医学视觉问答 MedVQAPubMed Central 图文

PMC-VQA — 医学视觉问答大基准 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

227k 问答对149k 图像约 21GB CSV+JPEG开放下载 CC BY-SA复合图版本抉择MedVInT 生成式基准149k 幅生物医学图像 / 227k 个问答对

227k 问答对 / 149k 图的生物医学图文视觉问答数据集

上海交通大学 & 上海人工智能实验室 url: https://github.com/xiaoman-zhang/PMC-VQA 1

基因组学多组学儿科肿瘤NCIGDCAI-Ready 数据集

TARGET — 儿童肿瘤基因组项目 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 6,363 名知情受试者WGSWESRNA-seqmiRNA-seq受控+开放获取dbGaP 申请肿瘤-正常配对约 6,363 名知情同意受试者（dbGaP v26）

NCI 儿科癌症多组学队列，约 6,000+ 例 WES/WGS/RNA-seq

National Cancer Institute — Center for Cancer Genomics url: https://www.cancer.gov/ccg/research/genome-sequencing/target 2

组织病理乳腺癌图像回归医学影像挑战赛

BreastPathQ — 乳腺癌细胞增殖定量挑战 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

3,698 patch96 WSI55 名 NAT 后患者H&E 20X 扫描0-1 连续 TC 标签需申请下载55 名乳腺癌新辅助治疗后患者（NAT 后残余病变）

新辅助治疗后乳腺癌 H&E patch 肿瘤细胞占比回归 · 3,698 patch · 55 患者

SPIE BreastPathQ Grand Challenge（官方组织方） url: https://breastpathq.grand-challenge.org/ 2

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