医疗 AI-Ready 训练数据集库(上万即取即用)

致力于为医疗 AI 研究人员找到合适的数据集。已收录 2,151 个 AI-Ready 数据集,覆盖医学影像、电子病历与文本、病灶分割与标注等多模态数据。

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千方医数集 · 商业级 AI-Ready 数据集

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乳腺钼靶影像与病灶标注数据集

四体位乳腺钼靶 DICOM 影像,配病灶检出框与像素级分割掩膜,标签按 BI-RADS 术语组织。

眼底照相与 OCT 影像数据集

眼底彩照与 OCT 报告图文配对,一眼一报告可回溯,含逐项所见与 AI 辅诊结论。

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医学影像 AI-Ready 数据集

电子病历与文本数据集

病灶分割与标注数据集

共 1886 个数据集

BBBC051 (Human kidney cortex cells)
医学影像病理图像图像分类评测基准

BBBC051 (Human kidney cortex cells)

人工标注影像数据原始数据三口径并存:BBBC 总表口径 690,000 images(细胞)|论文口径 ~230,000 cells 完成八类分类|TissueMNIST 衍生口径 236,386 样本;组织来源为 3 例

Broad Bioimage Benchmark Collection 第 051 号:3 例人体肾皮质组织的 DAPI 单通道共聚焦荧光显微图像(3D 体积 / 2D 投影 / 2D 切片三形态),VTEA 半自动流水线标注 8 类肾皮质细胞类型,NephNet3D 仅凭细胞核 DAPI 特征即达 balanced accuracy 80.26%,衍生 MedMNIST 轻量基准 TissueMNIST

OSIC Pulmonary Fibrosis Progression
医学影像CT多模态挑战赛数据集评测基准真实世界数据

OSIC Pulmonary Fibrosis Progression

影像数据临床数据原始数据时序数据训练集 176 患者(train.csv 1549 行);公开测试集 5 患者;隐藏测试集约 200 患者(公私合计约 200,15:85 拆分)

OSIC 联盟 2020 年 Kaggle 肺纤维化进展预测挑战赛数据集——176 例训练患者的基线胸部 CT + 用力肺活量(FVC)纵向随访,任务是用影像与临床元数据预测肺功能下降轨迹并给出置信度,评测采用修正拉普拉斯对数似然(mLLL)

SIIM-ACR Pneumothorax Segmentation
医学影像X光影像医学图像分割挑战赛数据集评测基准

SIIM-ACR Pneumothorax Segmentation

人工标注影像数据原始数据12,047 张唯一胸片(UUID 匿名化患者,未披露患者级数量);掩码 12,954 个(阳性 2,669 / 阴性 9,378)

2019 Kaggle 气胸像素级分割竞赛数据集:12,047 张 NIH 胸片 + RLE 掩码,1,475 队竞逐 mean Dice,原始 GCP 通道已下线、竞赛规则禁再分发,AI-Ready 光谱上「技术可用、治理受限、存续脆弱」的典型样本

LargeIA
医学影像CT医学图像分割目标检测神经科学心血管疾病

LargeIA

影像数据人工标注原始数据1,338 例内部 CTA(1,489 个 IA)+ 外部 A 71 例 + 外部 B 67 例;合计 1,476 例 CTA / 1,640 个 IA

贵州六院联盟 1,338 例颅内动脉瘤 CTA 的大规模分割数据集——GLIA-Net 全局定位+局部分割双通路,配套医师人机协同临床实验;数据需机构邮箱邮件申请、非商业用途

ReXInTheWild
多模态视觉问答医学问答评测基准

ReXInTheWild

人工标注影像数据原始数据受试者人数未披露(484 张照片中含患者与健康人,无个体标识与人口学字段);955 道多选题 / 471 图 × 2 题 + 13 图 × 1 题 / 源自 381 篇 PMC 文献

哈佛 Rajpurkar 组的医学照片理解统一基准——484 张源自 PMC 文献的'野外'普通照片配 955 道两阶段临床医生审核的多选题,覆盖七临床主题,通用旗舰模型 68-78% 而医疗专用 MedGemma 仅 37%,CC BY-NC-ND 3.0 HuggingFace 公开直链

Claimify
医疗NLP医学问答与基准评测基准医学问答

Claimify

人工标注原始数据6,490 个标注句子(396 个 LLM 回答 / 393 个唯一问题;不涉及患者级数据)

Microsoft Research 提出的 LLM 主张抽取方法 Claimify 的官方配套标注数据集——6,490 句 Copilot 问答输出句子级二分类标注(59.1% 含可验证事实主张),CDLA-Permissive-2.0 于 HuggingFace 公开直链,配套 ACL 2025 主会四阶段流水线论文

CORAL
医疗NLP临床文本关系抽取电子健康记录肿瘤学乳腺癌

CORAL

人工标注文本数据基准数据40 份专家标注进展笔记(20 乳腺癌 + 20 胰腺癌,UCSF 2012–2022)+ 200 份 GPT-4 自动标注(每病种 100 份);患者级唯一数量未单独披露

UCSF 40 份乳腺癌与胰腺癌进展笔记的专家级深标注肿瘤信息抽取基准——59 实体/23 属性/26 关系 schema、9028 实体/9986 修饰符/5312 关系人工注释,外加 200 份 GPT-4 自动标注扩展与 GPT-4/GPT-3.5-turbo/FLAN-UL2 八任务零样本评测

ApolloCorpus
医疗NLP临床文本生物医学文献医学问答医学考试评测基准

ApolloCorpus

模型生成文本数据清洗数据3,741,196 条文档(纯文本语料,无患者级数据)

深圳大学 FreedomIntelligence 团队发布的六语言(en/zh/es/fr/pt/hi)医疗 LLM 预训练+SFT 混合语料:374 万文档、预训练部分 2.5B tokens、首创 QA-Augmented Pre-training 与 Priority sampling,Apache-2.0 于 HuggingFace 公开

VISEM — 人类精子显微视频多模态数据集(85 人/研究用途)
多模态手术视频生理信号队列研究评测基准

VISEM — 人类精子显微视频多模态数据集(85 人/研究用途)

视频数据生理信号原始数据85 名男性(≥18 岁;每人收录 1 段显微视频);部分受试者录制两段但因样本漂移仅保留一段

挪威 SimulaMet 与 OsloMet 发布的 85 名男性精子显微视频 + 精液分析 + 脂肪酸 + 性激素 + 人口学五模态开放数据集,人类生殖领域首个开放多模态数据集,MediaEval 2019 Medico 任务官方基准,35.2 GB 直链下载、CC BY-NC 4.0(仅限研究与教育用途)

CLIF
电子健康记录重症监护队列研究时序数据多模态评测基准

CLIF

939,328 名患者(官网 2026-09)67 家医院13 机构(同口径 16 站点)关系型 23 表 schema(论文 v1.0)mCIDE 受控词表 + 原始标签双列官网口径 939,328 名患者 / 1.03M hospitalizations(2026-09);联盟累计格式化。论文口径(2020-2021 队列)111,440 例入院 / 9 systems

Common Longitudinal ICU data Format——跨 12+ 机构的开源重症监护纵向数据标准与联邦研究联盟:939K+ 患者、67 家医院,写一次分析代码跨站运行、患者级数据永不出院,MIMIC-IV-Ext-CLIF 参考实现落 PhysioNet

PatchChestCT — 胸部 CT 九类异常 patch 级空间标注数据集
医学影像CT目标检测医学图像分割肺癌心血管疾病

PatchChestCT — 胸部 CT 九类异常 patch 级空间标注数据集

人工标注影像数据原始数据2,201 例非增强胸部 CT 研究(Train 2016 / Valid 185;每研究标注 1 个重建体数据);源队列 CT-RATE 含 25,692 studies / 21,304 indi

以 CT-RATE 为源队列,为 2,201 例非增强胸部 CT 提供 12×12×24 三维 patch 网格上九类临床显著异常的 token 对齐二值标注——医学生初注+资深医师终审三段质控,patch 级监督定位 Dice 42.2% 碾压弱监督基线 15.6%

MedCalc-Bench
医学问答与基准评测基准医学问答临床文本医疗NLP

MedCalc-Bench

人工标注文本数据合成数据test 1,047 例(全部人工复核,覆盖 55 计算器)+ train 10,053 例(论文口径,覆盖 40 计算器);note 候选语料库 Open-Patients 180,142 条

首个评估大语言模型医学计算能力的评测基准——55 个临床计算器、1,047 例人工复核测试题,GPT-4 one-shot CoT 仅 50.9%,NeurIPS 2024 Datasets & Benchmarks Oral,NLM/NIH 主导,CC BY-SA 4.0 于 HuggingFace 公开

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