医疗 AI-Ready 训练数据集库（上万即取即用）

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千方医数集 · 商业级 AI-Ready 数据集

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乳腺钼靶影像与病灶标注数据集

四体位乳腺钼靶 DICOM 影像，配病灶检出框与像素级分割掩膜，标签按 BI-RADS 术语组织。

眼底照相与 OCT 影像数据集

眼底彩照与 OCT 报告图文配对，一眼一报告可回溯，含逐项所见与 AI 辅诊结论。

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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 1886 个数据集

睡眠信号临床电子病历队列研究儿科生理信号电子健康记录

NCH Sleep DataBank — 全美儿童医院儿科睡眠 PSG 与 560 万条纵向 EHR

3984 份儿科 PSG3673 名唯一患者560 万条 EHR 记录2017–2019资质访问Natus Sleepworks3673 名唯一儿科患者（3984 份 PSG 睡眠研究）

3984 份儿科多导睡眠图研究、3673 名唯一患者，2017–2019 年真实临床采集，附 560 万条纵向临床数据

Nationwide Children's Hospital（全美儿童医院）Abigail Wexner Research Institute url: https://physionet.org/content/nch-sleep/ 53

生理信号心电信号评测基准心血管疾病真实世界数据

CODE-II — 巴西远程医疗 270 万份 12 导联心电 66 类标注数据集

人工标注时序数据原始数据2,735,269 条 ECG 检查 / 2,093,807 名成人患者（1,663,122 人仅 1 份、430,685 人 2 份以上）；CODE-II-open 15,000 患者第一份检查；C

273.5 万条 12 导联 ECG · 209.4 万成人患者 · 66 类 CODE 诊断标注 · 15,000 患者公开子集 · 8,475 份多专家盲评基准

巴西 Telehealth Network of Minas Gerais（TNMG）远程心电服务原始 12 导联数字心电图（每检查最多 4 条 tracings，7-12 秒，300/500/600/1000 Hz，依采集设备）+ 66 类 CODE 诊断标签（class ID + label）+ 人口学与临床元数据（exam ID、日期、性别、出生日期、自述合并症、检查指征、心电测量值、报告类型） 59

医学影像手术视频医学图像分割

AutoImplant — 颅骨植入体自动设计挑战

630 个 NRRD 文件（2020 届）570+100 个三元组（2021 届 SkullBreak）512×512×Z 二值体素CC BY-NC-SA 4.0 免费获取非患者队列：合成数据共 344 个颅骨（2020 届 210 + 2021 届 134），不含人口学信息

CQ500 合成颅骨缺损基准：210 颅骨 + 670 三元组，MICCAI 两届挑战

Graz University of Technology (TU Graz) — Institute of Computer Graphics and Vision url: https://autoimplant.grand-challenge.org/ 60

医学影像病理图像医学图像分割肿瘤学

CryoNuSeg — 冷冻切片 H&E 核实例分割数据集

10 器官 30 张 512×512 patch三套标注 7,596/8,044/8,251 核Kaggle V7 416.43 MBMIT 许可开放下载官方 10 折器官外推协议30 张冷冻切片 WSI 均来自不同 TCGA 患者（每器官 3 张、不同患者与组织中心）

首个全手工标注冷冻切片核分割数据集：10 器官 30 张 512×512 patch · 三套独立标注 7,596/8,044/8,251 核 · 官方 10 折器官外推基准 Dice 80.3%

Medical University of Vienna / Loughborough University / TissueGnostics GmbH（CryoNuSeg 官方，Kaggle ipateam 团队发布） url: https://www.kaggle.com/ipateam/segmentation-of-nuclei-in-cryosectioned-he-images 64

医疗NLP生物医学文献关系抽取药物-靶点相互作用药物发现与化学挑战赛数据集

ChemProt — BioCreative VI 化学-蛋白关系抽取语料

文本关系标注实体标注多类分类公共领域英文挑战赛0

2,432 篇 PubMed 摘要、10 类 CPR 关系、Public Domain 的生物医学关系抽取挑战赛金标准

BioCreative VI Chemical-Protein interaction corpus (ChemProt), Track 5, 2017; mirrored by BigBio on HuggingFace (bigbio/chemprot) 51

医疗NLP知识图谱罕见病基因组学与多组学命名实体识别

Mondo Disease Ontology — 统一全球疾病术语的开放疾病本体

29,315 条疾病术语139,255 条跨库交叉引用OWLOBOJSON 多格式CC BY 4.0 开放许可月度版本发布不适用（本体知识资源，无患者数据）

29,315 条疾病术语 + 139,255 条跨库交叉引用的 OBO 旗舰本体，月度发布、CC BY 4.0、OWL 逻辑定义

Monarch Initiative（Mondo Disease Ontology 维护方） url: https://mondo.monarchinitiative.org/ 95

医学影像皮肤影像皮肤癌

BCN20000 — 皮肤镜野外病变分类基准

18,946 张 1024×1024 皮肤镜 JPEG5,583 个皮损8 类诊断 + OOD 测试类CC BY 4.0 开放下载年龄性别部位日期元数据5,583 个皮损（18,946 张图像；未提供患者级标识）

18,946 张野外皮肤镜图像 / 5,583 个皮损 / 8 类诊断 + OOD 测试类

Hospital Clínic de Barcelona — Melanoma Unit, Department of Dermatology url: https://doi.org/10.6084/m9.figshare.24140028 94

医学影像病理图像医学图像分割肿瘤学

PESO — 前列腺病理上皮分割

约 138.2 GB TIFF 全片102 张 H&E WSI160 个测试区域CC BY-NC-SA 4.0Zenodo 公开下载约 102 例前列腺切除标本（62 训练 + 40 测试 WSI）

102 张前列腺 H&E 全片，IHC 双染参考标准的上皮像素级分割基准

Radboud University Medical Center（Diagnostic Image Analysis Group） url: https://zenodo.org/records/1485967 47

医学影像乳腺影像X光影像图像分类乳腺癌

CMMD — 中国乳腺钼靶良恶性分类

5,202 幅 DICOM 图像1,775 名患者22.86 GB 影像CC BY 4.0 开放获取活检病理证实标注1,775 名患者

1,775 名患者 5,202 幅钼靶图像，活检证实良恶性与分子亚型标注

The Cancer Imaging Archive（TCIA） url: https://www.cancerimagingarchive.net/collection/cmmd/ 71

医学影像图像分类儿科

FETAL_PLANES_DB — 胎儿标准切面分类基准

约 2.1GB ZIP12,400 张超声切面1,792 名患者CC BY 4.0 开放获取6 类切面1,792 名孕妇

12,400 张二维超声标准切面 · 1,792 名患者 · 首个比肩人类技师的切面分类基准

BCNatal（巴塞罗那母胎与新生儿医学中心） url: https://zenodo.org/records/3904280 80

生理信号医学影像病理图像语音信号

SVD 萨尔布吕肯嗓音库 — 病理性嗓音声学+EGG

2,225 名说话人71 类发声障碍38.1 GB 音频档案50 kHz 16-bit 双通道CC BY 4.0 开放下载约 2,225 名说话人（1,356 名发声障碍患者 + 869 名健康对照）

2,225 名说话人、71 类发声障碍的声学与电声门图双模态病理性嗓音语料库

前萨尔大学语音学研究所（现由德国埃森大学医院托管） url: https://stimmdb.coli.uni-saarland.de/ 103

医疗NLP药物发现与化学化学信息学生物医学文献

CHEMDNER — 化学实体识别与药物发现文本挖掘

10,000 篇 PubMed 摘要84,355 个化学实体提及19,805 个唯一化学实体约 14 MB 英文文本开放获取不适用（公开文献摘要语料，无患者数据）

10,000 篇摘要、84,355 个化学实体标注的化学 NER 基准

BioCreative（CNIO 结构计算生物学组等） url: http://www.biocreative.org/resources/biocreative-iv/chemdner-corpus/ 83

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