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乳腺钼靶影像与病灶标注数据集

四体位乳腺钼靶 DICOM 影像，配病灶检出框与像素级分割掩膜，标签按 BI-RADS 术语组织。

TCT 宫颈细胞学数据集

液基薄层细胞学（TCT）数字图像，含阴阳性判读结果，适配宫颈癌细胞学筛查模型。

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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 1868 个数据集

医学影像皮肤影像皮肤癌

BCN20000 — 皮肤镜野外病变分类基准

18,946 张 1024×1024 皮肤镜 JPEG5,583 个皮损8 类诊断 + OOD 测试类CC BY 4.0 开放下载年龄性别部位日期元数据5,583 个皮损（18,946 张图像；未提供患者级标识）

18,946 张野外皮肤镜图像 / 5,583 个皮损 / 8 类诊断 + OOD 测试类

Hospital Clínic de Barcelona — Melanoma Unit, Department of Dermatology url: https://doi.org/10.6084/m9.figshare.24140028 91

医学影像病理图像医学图像分割肿瘤学

PESO — 前列腺病理上皮分割

约 138.2 GB TIFF 全片102 张 H&E WSI160 个测试区域CC BY-NC-SA 4.0Zenodo 公开下载约 102 例前列腺切除标本（62 训练 + 40 测试 WSI）

102 张前列腺 H&E 全片，IHC 双染参考标准的上皮像素级分割基准

Radboud University Medical Center（Diagnostic Image Analysis Group） url: https://zenodo.org/records/1485967 45

医学影像乳腺影像X光影像图像分类乳腺癌

CMMD — 中国乳腺钼靶良恶性分类

5,202 幅 DICOM 图像1,775 名患者22.86 GB 影像CC BY 4.0 开放获取活检病理证实标注1,775 名患者

1,775 名患者 5,202 幅钼靶图像，活检证实良恶性与分子亚型标注

The Cancer Imaging Archive（TCIA） url: https://www.cancerimagingarchive.net/collection/cmmd/ 69

医学影像图像分类儿科

FETAL_PLANES_DB — 胎儿标准切面分类基准

约 2.1GB ZIP12,400 张超声切面1,792 名患者CC BY 4.0 开放获取6 类切面1,792 名孕妇

12,400 张二维超声标准切面 · 1,792 名患者 · 首个比肩人类技师的切面分类基准

BCNatal（巴塞罗那母胎与新生儿医学中心） url: https://zenodo.org/records/3904280 78

生理信号医学影像病理图像语音信号

SVD 萨尔布吕肯嗓音库 — 病理性嗓音声学+EGG

2,225 名说话人71 类发声障碍38.1 GB 音频档案50 kHz 16-bit 双通道CC BY 4.0 开放下载约 2,225 名说话人（1,356 名发声障碍患者 + 869 名健康对照）

2,225 名说话人、71 类发声障碍的声学与电声门图双模态病理性嗓音语料库

前萨尔大学语音学研究所（现由德国埃森大学医院托管） url: https://stimmdb.coli.uni-saarland.de/ 101

医疗NLP药物发现与化学化学信息学生物医学文献

CHEMDNER — 化学实体识别与药物发现文本挖掘

10,000 篇 PubMed 摘要84,355 个化学实体提及19,805 个唯一化学实体约 14 MB 英文文本开放获取不适用（公开文献摘要语料，无患者数据）

10,000 篇摘要、84,355 个化学实体标注的化学 NER 基准

BioCreative（CNIO 结构计算生物学组等） url: http://www.biocreative.org/resources/biocreative-iv/chemdner-corpus/ 81

医疗NLP命名实体识别生物医学文献

NCBI Disease Corpus — 疾病实体标注金标准

793 篇 PubMed 摘要6,892 个疾病提及790 个唯一疾病概念PubTator 纯文本格式公开领域免费下载不适用——文献摘要语料，不含患者级数据

793 篇 PubMed 摘要 · 6,892 个疾病提及 · 医疗 NER 与概念归一化的奠基级金标准

National Center for Biotechnology Information (NCBI), National Library of Medicine, NIH url: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/CBBresearch/Dogan/DISEASE/ 63

公共卫生与流行病学电子健康记录真实世界数据药物安全

openFDA — 美国食品药品监管开放数据中枢

5,500 万+ 条监管记录25+ 个开放端点CC0 公有领域许可JSON API 与压缩包下载季度提取与持续更新2,000 万+ 份药品不良事件报告（FAERS，截至 2026-09）

美国 FDA 全品类监管数据统一 API：5,500 万+ 条记录、25+ 端点、CC0 开放

美国食品药品监督管理局（U.S. Food and Drug Administration） url: https://open.fda.gov/ 124

生理信号语音信号心血管疾病

PhysioNet/CinC Challenge 2016 心音数据集 — 听诊音正常/异常分类基准

3,240 条训练录音764 人隐藏测试 1,277 条308 人2,000 Hz .wav 单导联解压约 1.1 GBODC-By 开放下载训练集 764 名受试者（隐藏测试集另有 308 名）

公开最大心音（PCG）分类基准 · 3,240 条录音 / 764 人 · 2,000 Hz .wav

PhysioNet（MIT Laboratory for Computational Physiology 等） url: https://physionet.org/content/challenge-2016/1.0.0/ 124

医学影像医学图像分割病理图像目标检测肿瘤学

DigestPath — 消化道病理检测与分割基准

687 张印戒细胞检测图872 张结肠镜组织分割图两任务合计 631 名患者XML 边界框 + JPG 掩码签署协议后免费申请631 名患者（印戒细胞 155 名 + 组织分割 476 名，两子任务）

MICCAI 2019 消化系统病理基准：687 张印戒细胞检测图 + 872 张结肠镜组织分割图

商汤科技 / 衡道病理 / 上海交通大学医学院附属瑞金医院 / 西京医院 / 上海市松江区中心医院 url: https://digestpath2019.grand-challenge.org 85

药物发现与化学化学信息学分子生成

Open Reaction Database — 开放化学反应数据库

约 230 万条反应记录USPTO-grants 子集 1.1 GB ParquetCC-BY-SA-4.0 开放许可ProtobufParquet 结构化格式免费开放获取不适用（化学反应数据库，无患者数据）

230 万条开放化学反应，机器可读结构化 schema，AI 驱动合成预测的公共数据底座

Open Reaction Database Project url: https://open-reaction-database.org 80

生理信号神经科学时序数据癫痫脑电信号

Bonn EEG — 经典癫痫脑电分类基准

500 段单通道 EEG每段 23.6 秒173.61 HzASCII TXT 免费下载约 20 MB10 名受试者（5 名健康志愿者 + 5 名癫痫患者）

500 段单通道 EEG 的癫痫检测世界基准，5 组状态 × 23.6 秒

Universitat Pompeu Fabra（巴塞罗那庞培法布拉大学）NTSA 课题组（原始采集：德国波恩大学癫痫学系） url: https://www.upf.edu/web/ntsa/downloads 118

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