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乳腺钼靶影像与病灶标注数据集

四体位乳腺钼靶 DICOM 影像，配病灶检出框与像素级分割掩膜，标签按 BI-RADS 术语组织。

TCT 宫颈细胞学数据集

液基薄层细胞学（TCT）数字图像，含阴阳性判读结果，适配宫颈癌细胞学筛查模型。

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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 1844 个数据集

医学影像CT医学图像分割肿瘤学肺癌

LCTSC — 肺癌放疗 CT 正常器官勾画挑战

60 例胸部放疗 CT5 类正常器官勾画5.15GB DICOMCC BY 3.0 公开60 例患者

60 例胸部放疗 CT + 5 类正常器官勾画，TCIA 公开基准

The Cancer Imaging Archive (TCIA) url: https://www.cancerimagingarchive.net/collection/lctsc/ 91

医学影像病理图像乳腺影像图像分类肿瘤学乳腺癌

BACH — 乳腺癌组织学图像挑战赛数据集

约 13.4 GB（Zenodo 两包）500 张显微图像 + 40 张 WSI四分类完全均衡像素级 WSI 标注CC BY-NC-NDZenodo 免费下载500 张显微图像 + 40 张全切片

ICIAR 2018 乳腺癌组织学挑战赛 · 500 张 H&E 显微图像 + 40 张 WSI

INESC TEC & i3S（IPATIMUP/INEB），葡萄牙波尔图大学 url: https://iciar2018-challenge.grand-challenge.org/ 144

医学问答与基准医疗NLP医学考试医学问答

HeadQA — 西班牙医学考试问答数据集

6,765 道多选题西英双语约 159MB（含图像）MIT 许可含图像题免费获取6,765 道考题

6,765 道西班牙医疗国考真题 · 西英双语 · 多语言 LLM 基准

拉科鲁尼亚大学 CITIC（Vilares & Gómez-Rodríguez） url: http://aghie.github.io/head-qa 83

医学影像公共卫生与流行病学COVID-19X光影像

MIDRC-RICORD — RSNA 新冠开放影像数据库

约 32.6 GB DICOM 影像588 例患者240 例胸部 CT998 张新冠阳性胸片MD.ai JSON 专家标注CC BY-NC 4.0588 例患者（1A 110 例 + 1B 117 例 + 1C 361 例）

RSNA 与 STR 多国专家标注新冠胸片与 CT 开放库，1,238 项检查

RSNA / MIDRC 联盟（NIBIB 资助），TCIA 托管 url: https://www.rsna.org/covid-19/covid-19-ricord 76

医学影像眼科影像医学图像分割皮肤影像骨骼肌肉影像

CHASE_DB1 — 儿童视网膜血管分割基准

28 幅儿童眼底图像56 幅人工血管掩膜999×960 JPGPNG约 2.4 MB ZIPCC BY 4.0 开放获取14 名儿童（双眼 28 幅图像）

28 幅儿童眼底图像 × 双观察者标注的视网膜血管分割参考基准

Kingston University London 与 St George's, University of London url: https://researchinnovation.kingston.ac.uk/en/datasets/chasedb1-retinal-vessel-reference-dataset-4 96

基因组学与多组学变异与注释罕见病

ClinVar — 全球最大临床变异注释数据库

455.7 万唯一变异695.5 万提交记录3,512 家提交者0-4 星评审体系月度发布完全免费开放455 万个变异记录

变异-表型解读的全球事实标准 · 455 万唯一变异 · 3,512 家提交者

美国国家生物技术信息中心（NCBI）/ 美国国立卫生研究院（NIH） url: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar/ 104

公共卫生与流行病学调查数据公共卫生统计

BRFSS — 全球最大健康行为电话调查

433,323 条访谈（2023 年）345 个变量（XPT）ASCIIXPT 免费Public Domain433,323 名成人受访者（2023 年，历年 40 万+/年）

CDC 主持、每年 40 万+ 成人访谈、覆盖美国 50 州的健康行为监测金矿

U.S. Centers for Disease Control and Prevention（CDC） url: https://www.cdc.gov/brfss/annual_data/annual_data.htm 59

药物发现与化学医学问答与基准分子性质预测化学信息学评测基准

MoleculeNet — 分子机器学习基准套件

17 个子数据集约 78.3 万化合物849 个任务SMILES + 3D 坐标MIT（聚合层）DeepChem 一行加载免费获取78.3 万个化合物

分子 ML 的 ImageNet · 17 个子数据集 · 78 万化合物 · 849 个任务

斯坦福大学 Pande Lab & Schrödinger url: https://moleculenet.org/ 122

电子健康记录重症监护临床电子病历队列研究

OUTCOMEREA — 法国多中心 ICU 队列

24,298 次 ICU 住院12-23 家法国 ICU1997-2020 持续采集每日 SOFA 严重度ICD-10CCAM 编码合作申请获取约 2.4 万名患者（24,298 次 ICU 住院，1997-2020）

24,298 次 ICU 住院的法国多中心前瞻研究队列

OUTCOMEREA Study Group（Inserm UMR 1137 IAME / Université Paris Cité） url: https://www.outcomerea.org/ 109

电子健康记录公共卫生与流行病学重症监护COVID-19临床电子病历

NWICU — 芝加哥多院区 COVID 时代 ICU EHR

约 597MB CSV.GZ25,342 名患者28,566 次 ICU 住院12 张表凭证化申请25,342 名患者

25,342 名患者、28,566 次 ICU 住院的芝加哥多院区 ICU EHR 数据库

MIT Laboratory for Computational Physiology × Northwestern University（PhysioNet 托管） url: https://physionet.org/content/nwicu-northwestern-icu/ 110

医疗NLP临床文本命名实体识别

PharmaCoNER — 西班牙语药物实体识别语料

1,000 篇临床病例7,624 条实体标注396,988 词CC-BY-4.0 免费获取1,000 篇临床病例（非患者级数据）

1,000 篇西语临床病例、7,624 条药物/化学实体标注

Barcelona Supercomputing Center (BSC) Text Mining Unit url: https://www.qianfanghub.com/ai-ready-dataset/pharmaconer/0 70

电子健康记录重症监护临床电子病历知识图谱医学问答

AIPatient — 模拟病人知识图谱

15,441 节点 26,882 边56 例 ICU 患者524 题 QANeo4j 图数据受控访问获取KG 收录 56 例 ICU 患者（cohort 口径 1,495 例），KG-CORAL 另含 40 例肿瘤患者

MIMIC-III 衍生 1,495 例患者知识图谱与六 agent 模拟病人系统

PhysioNet（Mass General Brigham AIM 项目与哈佛医学院牵头，多机构合作） url: https://physionet.org/content/aipatient-kg/ 68

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