即取即用的 AI-Ready 医疗数据集库

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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

按任务类型浏览

图像分类目标检测语义分割

共 628 个数据集

公共卫生与流行病学神经科学儿科脑影像队列研究

HBN — 儿童青少年脑与精神健康跨诊断队列

约 4,867 名受试者多模态 MRIEEG表型BIDS 格式CC BY-NC-SA 与 CC BY-SA 双许可DUA 申请获取约 4,867 名 5-21 岁受试者（Release 11，数据截至 2022-11）

5-21 岁约 4,867 名受试者的跨诊断儿童脑与精神健康开放生物样本库

Child Mind Institute（美国儿童心理研究所） url: https://fcon_1000.projects.nitrc.org/indi/cmi_healthy_brain_network/ 112

医学影像内窥镜影像目标检测手术视频结直肠癌

SUN Database — 昭和大学结肠镜视频数据库

113 段 HDTV 白光结肠镜视频158,690 帧逐帧边界框标注99 名患者100 个病理确诊息肉JPEG + TXT 角点坐标免费申请获取99 名患者（男 71 / 女 28，中位年龄 69 岁）

113 段结肠镜视频 · 158,690 帧逐帧息肉边界框

昭和大学北横滨医院消化疾病中心 & 名古屋大学 Mori 研究室 url: http://sundatabase.org/ 93

电子健康记录医疗NLP时序数据重症监护

CCCDB — 中文危重症 ICU 电子病历数据库

约 3.19 GB CSV8,180 例 ICU 住院7,638 名患者10 张关系表凭证化访问7,638 名 ICU 患者（8,180 例住院）

8,180 例 ICU 住院、10 张关系表、约 3.19 GB 中文危重症 EHR

Zhejiang Provincial People's Hospital（浙江省人民医院） url: https://physionet.org/content/zhejiang-ehr-critical-care/ 119

公共卫生统计死亡登记流行病学

CDC WONDER — 美国公共卫生统计查询平台

30+ 在线数据库1999-2020 死因聚合XML API 免鉴权公共领域免费全美死亡证书聚合（2020 年 3,383,729 例）

30+ 公共卫生数据库 · 1999-2020 死因统计 · 免费 XML API

U.S. Centers for Disease Control and Prevention (CDC) / National Center for Health Statistics (NCHS) url: https://wonder.cdc.gov/ 72

电子健康记录药物发现与化学临床电子病历真实世界数据药物安全

CGRD — 中国台湾最大多院区电子病历库

约 500 万门诊患者（2000）约 290 万住院患者（2000）2000 年起每年更新ICD-9/10-CM 编码院内申请审核获取约 500 万门诊与 290 万住院患者样本（2000 年口径）

中国台湾长庚体系约 790 万患者去标识化多院区电子病历研究数据库

长庚医疗财团法人（Chang Gung Medical Foundation, CGMH） url: https://www.cgmh.org.tw 74

医学影像电子健康记录乳腺影像病理图像肿瘤学乳腺癌

I-SPY — 乳腺癌新辅助治疗影像队列

985 例 DCE-MRI 队列约 2.4 TB DICOM纵向 4 时间点CC BY 4.0 开放公开下载985 例（ISPY2 Imaging Cohort 1）

985 例乳腺 DCE-MRI + 分子分型 + pCR 结局的自适应平台试验队列

The Cancer Imaging Archive (TCIA) / ACRIN / FNIH Biomarkers Consortium url: https://www.cancerimagingarchive.net/collection/ispy2/ 77

医学影像乳腺影像医学图像分割图像分类乳腺癌评测基准

Breast-Lesions-USG — 乳腺超声病灶策划基准数据集

256 例乳腺超声扫描256 名患者266 个病灶掩膜CC BY 4.0含 BIRADS 与病理标签256 名患者

256 例乳腺超声扫描 · 256 名患者 · 266 个病灶 · BIRADS 描述符与患者级临床标签

波兰科学院基础技术研究所 (IPPT PAN) / The Cancer Imaging Archive url: https://www.cancerimagingarchive.net/collection/breast-lesions-usg/ 31

电子健康记录药物发现与化学药物安全队列研究

CDARS — 全港临床 EHR 数据库

1,100 万+ 患者55 亿+ 条记录1995 年至今持续更新申请审核制ICD-9-CM 编码1,100 万+ 名患者（含 1993 年以来临床细节）

香港医管局全港性临床数据库 · 1,100 万患者 · 55 亿条记录

香港医院管理局（Hospital Authority, Hong Kong SAR） url: https://www3.ha.org.hk/data 107

药物发现与化学公共卫生与流行病学药物安全疾病监测真实世界数据

JADER 日本药品不良事件报告数据库 — 日本 PMDA 自发药物警戒库

PMDA 公开免费下载无需注册图片验证码MedDRAJ 编码四表病例编号关联全量覆盖更新（非增量）含 R2R3 混存结构逾 96.5 万例（2004-04~2025-01，J-STAGE 口径）；2025 年末约 90 万份（去重口径）

PMDA 药品副作用报告数据库 · 2004 年 4 月起逾 96 万例 · 四表关系结构 · 免费公开下载

Pharmaceuticals and Medical Devices Agency (PMDA), Japan url: https://www.pmda.go.jp/safety/info-services/drugs/adr-info/suspected-adr/0004.html 59

电子健康记录药物发现与化学临床电子病历分子生成

Synthea — 开源合成患者生成器

可无限生成100 万官方档案16 张 CSV 表FHIR R4Bulk FHIRCSVC-CDAApache 2.0 免费100 万（SyntheticMass 官方档案；生成器可按需无限生成）

百万级开源合成 EHR，Apache 2.0 无限制生成真实感患者记录

The MITRE Corporation url: https://synthetichealth.github.io/synthea/ 101

电子健康记录医学问答医疗NLP药物安全

DrugEHRQA：结构化与自由文本双模态用药问答

临床文本结构化表格问答对受限获取结构化部分覆盖 MIMIC-III 中 505 份出院小结所涉住院记录；问答对 70,381 条，其中两路均有答案 12,738 条

从 MIMIC-III 的处方表与出院小结同时取材，生成 70,381 条中文以外的用药问答三元组，每条含自然语言问题、可执行的 SQL 与两路答案，半数以上是含嵌套子查询的复杂 SQL

MIMIC-III 临床数据库 v1.4 的 PRESCRIPTIONS、DIAGNOSES_ICD、D_ICD_DIAGNOSES 三张表，以及 2018 n2c2 药物不良事件与用药抽取挑战赛标注的 505 份出院小结 22

电子健康记录临床电子病历医学问答评测基准医疗NLP临床文本

EHRSQL — 电子健康记录 Text-to-SQL 基准

24,411 问答对230 问题模板95MB+102MB SQLiteCC BY 4.0JSON 源文件222 名医院人员受访者（底层为 MIMIC-III 与 eICU 患者）

222 名医院人员问卷驱动的可信语义解析基准：24,411 问答对、230 模板、93.2% 时间敏感、含不可答问题

KAIST EdLab（KAIST AI 研究生院）联合 Konyang University Hospital、Seoul Women's University url: https://github.com/glee4810/EHRSQL 64

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