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医学影像 AI-Ready 数据集

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电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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共 628 个数据集

电子健康记录公共卫生与流行病学COVID-19临床电子病历医疗登记队列研究

ISARIC-CCP — 全球新冠住院队列

超70万例住院病例60+国全球队列受控申请获取CSV与PostgreSQL70 万+ 例住院病例

全球最大标准化新冠住院前瞻队列 · 70 万+ 例 · 60+ 国受控数据

ISARIC (International Severe Acute Respiratory and emerging Infection Consortium) & IDDO url: https://isaric.org/research/covid-19-clinical-research-resources/ 49

电子健康记录公共卫生与流行病学医疗登记临床电子病历流行病学重症监护

Swedish NPR — 瑞典国家患者登记

约 1,050 万人口覆盖约 150 万住院出院年1964 年起住院记录2001 年起专科门诊记录ICD-10-SE 与 KVÅ 编码申请审核获取约 1,050 万人口（瑞典全国居民，个体级链接）

1964 年至今覆盖约 1,050 万人口的瑞典全国住院与专科门诊登记

National Board of Health and Welfare (Socialstyrelsen), Sweden url: https://socialstyrelsen.se/en/statistics-and-data/registers/national-patient-register 63

电子健康记录公共卫生与流行病学COVID-19临床电子病历真实世界数据重症监护

N3C 美国新冠队列协作平台

OMOP CDM 5.3.1约 225 亿行700 万+ COVID 阳性84 个医疗系统飞地内 SQLPythonR 分析申请审核获取约 2,285 万名患者（Release 184，截至 2024-10）

美国最大新冠 EHR 队列 · 2,285 万患者 · OMOP 飞地协作分析

National Center for Advancing Translational Sciences (NCATS), NIH url: https://ncats.nih.gov/n3c 71

电子健康记录基因组学与多组学乳腺癌肿瘤学队列研究

METABRIC — 乳腺癌分子分型大队列

2,509 例原发性乳腺肿瘤mRNA + CNA + 突变 + 临床中位随访约 10 年cBioPortal 开放获取2,509 例原发性乳腺肿瘤患者

乳腺癌整合基因组+转录组开创性队列 · 2,509 例 · 引用 7,000+

University of Cambridge & British Columbia Cancer Agency（METABRIC Consortium） url: https://www.cbioportal.org/study/summary?id=brca_metabric 120

医疗NLP医学问答与基准医学考试医学问答评测基准

CMB 与 CMExam — 中文医疗评测双基准

合计 348,958 道题CMB 280,839 题CMExam 68,119 题JSON 与 CSV 格式Apache-2.0 开放下载非患者数据，考试题库

合计 348,958 道中文医学考试题，覆盖医师/护理/药师/医技全职业评测线

香港中文大学（深圳）FreedomIntelligence 团队与阿里巴巴集团等 url: http://cmedbenchmark.llmzoo.com/ 106

电子健康记录公共卫生与流行病学心血管疾病流行病学队列研究

Framingham Heart Study — 心血管流行病学奠基队列

- "约 15,000 名参与者（三代+Omni）" - "随访超 75 年" - "教学数据集免申请" - "dbGaPBioLINCC 申请获取" - "风险评分发源地"约 1.5 万名参与者

现代医学最长寿三代心血管队列 · 约 1.5 万人 · 随访 75 年+ · 风险评分发源地

name: "NHLBI & 波士顿大学弗雷明汉心脏研究" url: "https://www.framinghamheartstudy.org/" 60

电子健康记录基因组学与多组学GWAS医疗登记队列研究

BioBank Japan — 日本最大医院型生物银行

约 270,000 名患者 51 种疾病DNA 80 万管 · 血清 170 万管SNP 分型 27 万人 · WGS 1.6 万人NBDC 申请制受控获取约 270,000 名患者（51 种疾病，截至 2026-09）

27 万日本患者的基因组-临床随访医院队列 · 51 种疾病 220 深表型 GWAS

BioBank Japan（东京大学医科学研究所 IMSUT 主持，日本生物银行协作医院群） url: https://biobankjp.org/en/ 65

医学问答与基准医疗NLP临床文本医学问答

CliCR — 临床病例报告阅读理解

104,919 个查询11,846 份病例报告JSON（traindevtest 1.0）邮件申请研究用途约 1.2 万名患者（对应 11,846 份已发表病例报告）

10.5 万完形填空查询 · 1.2 万份病例报告 · 人机 F1 差距 20 点的临床 MRC 基准

安特卫普大学 CLiPS 研究中心（University of Antwerp） url: https://github.com/clips/clicr 66

公共卫生与流行病学全球健康时序数据

数据看世界 — 全球健康与发展开放统计汇编

13,914 个交互图表123 个主题页200+ 国家与地区时序CC BY 开放许可CSVJSONAPI 免费获取非患者数据，全球统计汇编

14,000+ 交互图表、120+ 主题的全球健康与发展开放统计数据汇编

Our World in Data（Global Change Data Lab / 牛津大学） url: https://ourworldindata.org 67

电子健康记录重症监护时序数据

MIMIC-IV-ED — 急诊科临床数据库

约 0.5GB CSV42.5 万次急诊就诊2011-2019 年数据星型 6 表结构需 CITI 培训Demo 免认证21 万名患者

全球最大公开急诊科 EHR 数据库 · 42.5 万就诊 · MIMIC-IV 官方急诊模块

MIT 计算生理学实验室 & 贝斯以色列女执事医疗中心 url: https://physionet.org/content/mimic-iv-ed/ 106

生理信号电子健康记录睡眠信号队列研究

SHHS — 睡眠心脏健康研究队列

356 GB 全库93.6 MB 开放子集6,441 例入组3,295 例二次 PSG1995-2011 年随访Compumedics 家庭 PSG需 NSRR 注册 + DUA6,441 名入组成人（NSRR 可共享 5,804）

家庭便携 PSG + 心血管随访 · 6,441 例 · NSRR 托管的睡眠呼吸金标准

Sleep Heart Health Study Research Group / National Sleep Research Resource url: https://sleepdata.org/datasets/shhs 87

医疗NLP电子健康记录临床电子病历医学问答

emrQA — 电子病历抽取式问答数据集

196 万问答对（终版）680 个问题模板2,425 份脱敏病历i2b2n2c2 DUA 授权免费申请获取2018 年后停更2,425 份临床病历

临床 QA 首个大规模社区语料 · 40 万+ 问答对 · i2b2 授权

UIUC & IBM Research & MIT-IBM Watson AI Lab（底层语料：i2b2/n2c2，哈佛 DBMI 托管） url: https://portal.dbmi.hms.harvard.edu/projects/n2c2-nlp/ 61

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