即取即用的 AI-Ready 医疗数据集库

致力于为医疗 AI 研究人员找到合适的数据集。已收录 1,956 个 AI-Ready 数据集,覆盖医学影像、电子病历与文本、病灶分割与标注等多模态数据。

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千方医数集 · 商业级 AI-Ready 数据集

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乳腺阳性影像数据集

乳腺钼靶阳性病例影像数据,覆盖肿块、钙化等典型征象,面向乳腺 AI 辅助筛查模型训练。

TCT 宫颈细胞学数据集

液基薄层细胞学(TCT)数字图像,含阴阳性判读结果,适配宫颈癌细胞学筛查模型。

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医学影像 AI-Ready 数据集

电子病历与文本数据集

病灶分割与标注数据集

共 1813 个数据集

CheXpert Plus — 带放射报告文本的胸部 X 光多模态数据集
医学影像X光影像医疗NLP临床文本影像-文本对齐

CheXpert Plus — 带放射报告文本的胸部 X 光多模态数据集

223,462 张胸片187,711 份报告64,725 名患者研究用途协议47 项 DICOM 元数据64,725 名患者

223,462 张胸片 · 187,711 份放射报告 · 6.47 万名患者 · 从图像标签走向图文对齐的下一代 CheXpert

Montgomery CXR — 肺结核 X 光基准集
医学影像医学问答与基准X光影像结核病评测基准

Montgomery CXR — 肺结核 X 光基准集

- "138 张 PA 胸片(单张 2.1-7.2 MB)" - "80 正常58 结核" - "12-bit PNG 约 0.6 GB" - "左右肺手工掩膜各 138 张" -138 名受检者(按影像计)

138 张 PA 胸片 + 双肺手工掩膜的肺结核筛查经典基准

ReXVal:放射报告六类错误的医师计数标注
医学影像影像-文本对齐评测基准临床文本

ReXVal:放射报告六类错误的医师计数标注

胸部X光报告生成错误标注多标注者人工评测50

五十项检查、四份高分候选报告、六位执业放射科医生,按六类错误逐个计数并区分临床意义,这份阶梯式样本把「报告哪错了」从一句评语变成可加总的向量

CXRGraph:给报告生成任务改造的实体关系标注
影像-文本对齐关系抽取命名实体识别X光影像

CXRGraph:给报告生成任务改造的实体关系标注

临床文本人工标注结构化表格受限获取手工标注 600 份报告(425 训练、75 验证、50 MIMIC-CXR 测试 + 50 CheXpert 测试);模型自动标注 227,835 份 MIMIC-CXR 报告

在 RadGraph 的四种实体、三种关系之上加一类位置属性实体、一类部分关系与三个实体属性,专门处理去标识后「与既往相比」这类无法还原的对照叙述,让结构化报告不再教模型编造间隔变化

EMDB — 电镜数据库:冷冻电镜三维密度图的 wwPDB 核心归档库
药物发现与化学基因组学与多组学蛋白质组学评测基准影像-文本对齐

EMDB — 电镜数据库:冷冻电镜三维密度图的 wwPDB 核心归档库

影像数据原始数据结构数据不适用(结构生物学归档库,非患者数据);截至 2026-10-15 累计 63,259 条密度图/断层图归档(2025 年底 52,921,2026 年内 10,338)

Electron Microscopy Data Bank 收录单颗粒分析/螺旋重构/电子断层/子断层平均/电子晶体学五类 cryo-EM 密度图与断层图,2026 年累计逾 6.3 万条、单年首破万条,CC0 1.0 公共领域奉献,REST API 免认证开放,与 PDB 原子坐标、EMPIAR 原始图像构成三方协作归档体系

REVA-PO — 胸片报告生成强化学习稳定化框架与 MIMIC-CXR/IU-Xray 复现包
医学影像多模态影像-文本对齐医疗NLP评测基准

REVA-PO — 胸片报告生成强化学习稳定化框架与 MIMIC-CXR/IU-Xray 复现包

文本数据影像数据派生数据上游规模:MIMIC-CXR 377,110 张 / 227,835 份报告 / 65,379 名患者(库内 rid=16 口径);IU-Xray 3,955 份报告(库内 rid=107 口径);R

以 Qwen2.5-VL-7B 为底座的三阶段流水线(连接层预热→分类器引导 SFT→无 Critic 的组相对策略优化),用响应加权正则与验证锚定策略重置驯服长期 RL 训练中的 KL 压力的开源复现包

BioStudies:EMBL-EBI 的通用研究归档底座
多模态基因组学与多组学医学图像分割公共卫生与流行病学

BioStudies:EMBL-EBI 的通用研究归档底座

元数据原始数据链接补充材料多组学不适用(记录级归档库,无统一患者计数)

341.99 万条记录 / ArrayExpress 8.10 万研究 / 三种接入方式

智利 ENS 全国健康调查:三轮横断面的体检与问卷
公共卫生与流行病学电子健康记录调查数据公共卫生统计

智利 ENS 全国健康调查:三轮横断面的体检与问卷

原始数据人工标注调查数据6,233 人(2016–17 轮);三轮合计 15,262 人(3,619 / 5,410 / 6,233)

1988–2017 / 三轮横断面 / 158 个 PSU / 1,165 个变量

ENPD 2018 — 阿根廷全国残疾人群画像调查的微观数据
公共卫生与流行病学公共卫生统计调查数据卫生服务研究

ENPD 2018 — 阿根廷全国残疾人群画像调查的微观数据

个体级微观数据抽样调查重复权重设计82,327 条个体记录,加权代表 39,922,669 人;其中 6 岁及以上有功能困难者 3,571,983 人

82,327 份个体记录 / 39,922,669 人加权 / 300 组 bootstrap 权重

MEROPS — 把蛋白酶切了什么、切在哪记下来的库
基因组学与多组学蛋白质组学药物-靶点相互作用

MEROPS — 把蛋白酶切了什么、切在哪记下来的库

酶分类体系切割位点表序列比对库不涉及患者数据;记录对象是蛋白质序列、切割事件与化合物

277 个家族 / 114 万个序列编号 / 91 次切割的位点偏好

BioSamples — 5,610 万条生物样本元数据的中枢登记处
基因组学与多组学变异与注释测序数据

BioSamples — 5,610 万条生物样本元数据的中枢登记处

样本元数据结构化注释表不直接涉及患者个体;但 56M+ 样本中包含大量人类样本(taxId 9606),其 age、cell_type、disease 等字段属可识别性敏感信息,使用须评估

把分散在 ENA、NCBI、ArrayExpress 的样本记录按一个键聚合,每条最多 50 个特征字段

Single Cell Expression Atlas — 正迁往 FENIX 的单细胞重处理库
基因组学与多组学单细胞基因组学转录组

Single Cell Expression Atlas — 正迁往 FENIX 的单细胞重处理库

表达矩阵细胞类型注释样本注释表不直接涉及患者个体;样本级元数据含年龄、性别、疾病、组织部位等公开信息

384 个实验、1,537 万个细胞,31% 有细胞类型标签;2026 年 11 月起分批迁移

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