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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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共 271 个数据集

脑神经公共卫生神经科学参考图谱单细胞基因组学

BICCN — 哺乳动物脑细胞普查多模态图谱 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

数百万细胞 · 多模态跨小鼠狨猴人类运动皮层CC BY 4.0 开放NeMOBILDANDI 档案biccn.org 门户浏览运动皮层细胞普查图谱（细胞级数据，非患者队列）：小鼠/狨猴/人类供体数百万细胞

NIH BRAIN 计划跨物种运动皮层细胞普查图谱 · 数百万细胞 · 多模态

BRAIN Initiative Cell Census Network (BICCN) / BRAIN Cell Data Center (BCDC), Allen Institute url: https://www.biccn.org 1

药物警戒自发不良事件报告上市后安全监测真实世界证据

FAERS — 全球最大自发药物警戒库 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

FDA 公开免费下载季度非累计 ASCIIXMLMedDRA 编码七表 PRIMARYID 关联含重复报告需去重去标识化公开数千万条报告（含重复，FDA 仪表盘 2026-03 约 3,282 万条）

FDA 不良事件自发报告系统 · 累计报告 3,000 万+ · 公开免费

U.S. Food and Drug Administration (FDA) url: https://fis.fda.gov/extensions/FPD-QDE-FAERS/FPD-QDE-FAERS.html 2

眼科外科手术视频医学多媒体手术阶段识别显微影像

Cataract-101 — 白内障手术视频阶段数据集 AI-Ready Wikipedia | 千方医数集

101 台手术视频10 阶段标注约 8.3 GB 压缩包CC BY-NC 4.0 免费下载720×540 显微视频101 台白内障手术（去标识视频）

101 台手术显微视频 · 10 阶段标注 · 4 名外科医生双经验级

Multimedia Systems Group, Institute of Information Technology (ITEC), Alpen-Adria-Universität Klagenfurt url: https://ftp.itec.aau.at/datasets/ovid/cat-101 1

生理信号与音频睡眠医学多导睡眠图时序信号基准

ISRUC-Sleep — 睡眠分期多导睡眠图基准 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

118 名受试者126 份整夜 PSG约 17.7 GB 下载包双专家 AASM 分期200 Hz 采样免费公开获取118 名受试者（126 份整夜 PSG 记录）

118 例受试者、126 份整夜 PSG 与双专家 AASM 分期基准

葡萄牙科英布拉大学系统与机器人研究所（ISR-UC） url: http://sleeptight.isr.uc.pt/ 2

皮肤眼科与骨骼专科影像眼底血管分割分割基准数据集眼科 AI

HRF — 45 幅高分辨率眼底血管分割基准 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

45 幅 3504×2336 眼底照健康DR青光眼各 15 幅单套专家共识血管金标准双专家视盘定位标注约 73 MB 开放直链下载45 幅眼底图像（健康、DR、青光眼各 15 幅；每幅独立病例）

45 幅 3504×2336 眼底照，健康/DR/青光眼三分组血管分割基准

Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg (FAU), Pattern Recognition Lab url: https://www5.cs.fau.de/research/data/fundus-images/ 2

医疗 NLP 与多模态病理图像视觉问答医学 AI 基准

PathVQA — 病理视觉问答基准数据集 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

4,998 张病理图像32,799 条问答对约 785 MB ParquetMIT 许证开放下载不适用（图像源自出版教科书与 PEIR 公共数字图书馆，不含患者信息）

4,998 张病理图像、32,799 条问答对的病理 VQA 开放基准

UCSD-AI4H（加州大学圣地亚哥分校 / 卡内基梅隆大学 / 北京工业大学） url: https://github.com/UCSD-AI4H/PathVQA 2

基因组学与多组学蛋白质组学肿瘤学泛癌分析

CPTAC — 癌症蛋白质基因组多组学 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 70 TB（PDC 全库）10 癌种 1,073 例肿瘤6,644 名受试者开放+受控申请获取6,644 名受试者（dbGaP CPTAC-3 v17）

10 大癌种 1,073 例肿瘤的蛋白组×基因组×影像配对多组学公共数据

美国国家癌症研究所（NCI）CPTAC 联盟 / 蛋白质组数据共享平台 PDC url: https://pdc.cancer.gov 2

病理图像乳腺癌语义分割数字病理学肿瘤学

BCSS — 乳腺癌语义分割数据集 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

151 张 H&E 全切片20,000+ 区域标注22 类像素级编码CC0 1.0 开放获取TCGA 三阴性乳腺癌151 名乳腺癌患者（每例 1 张全切片）

151 张 TCGA 乳腺癌 WSI · 20,000+ 区域标注 · 22 类语义分割基准

埃默里大学医学院（Emory University School of Medicine） url: https://bcsegmentation.grand-challenge.org/ 2

放射科影像断层扫描影像基因组学肺癌

NSCLC-Radiogenomics — 肺癌影像基因组学 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 98 GB DICOM 影像211 例 NSCLC 患者144 例肿瘤分割掩膜130 例 RNA-seqCC BY 3.0 开放下载211 例 NSCLC 患者

211 例 NSCLC 的 CT/PET-基因组-临床多模态配对数据集

The Cancer Imaging Archive（TCIA）／斯坦福大学医学院 url: https://www.cancerimagingarchive.net/collection/nsclc-radiogenomics/ 2

临床电子病历与重症监护初级保健 EHR药物警戒真实世界数据

THIN — 英国初级保健 EHR 数据库 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 1,970 万累计患者850+ 全科诊所5 张核心数据表Read code 层级编码申请审核 + 商业许可1994 年起纵向记录累计约 1,970 万患者（现役约 290 万）

覆盖约 6% 英国人口的 1,970 万人初级保健电子病历库

IQVIA（The Health Improvement Network / IQVIA Medical Research Data） url: https://www.the-health-improvement-network.com/ 2

公共卫生与脑神经脑影像影像遗传学多中心联盟荟萃分析

ENIGMA — 国际多中心脑影像遗传联盟 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

50 个活跃工作组43 国 200+ 机构GWAS 汇总 51,665 人26 种脑疾病协议公开共享汇总统计申请获取代表性 GWAS 汇总 30,717-51,665 名受试者

50 个工作组、43 国 200+ 机构的分布式脑影像遗传荟萃分析联盟

ENIGMA Consortium（USC Stevens 神经影像与信息学研究所） url: http://enigma.ini.usc.edu/ 2

药物发现药物警戒药物相互作用真实世界证据图学习基准

TWOSIDES — 药物相互作用副作用权威数据集 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

4,651,131 药物对-副作用关联63,473 个药物组合645 种药物1,301 种 MedDRA 副作用CSV 开放下载不适用（FAERS 自发报告聚合数据；覆盖 645 种药物）

645 药物 × 63,473 药物对，465 万药物对-副作用关联

Tatonetti Lab（斯坦福大学，后哥伦比亚大学，现 Cedars-Sinai） url: http://tatonettilab.org/resources/tatonetti-stm.html 2

定制数据集服务

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