医疗 AI-Ready 训练数据集库（上万即取即用）

致力于为医疗 AI 研究人员找到合适的数据集。已收录 2,043 个 AI-Ready 数据集，覆盖医学影像、电子病历与文本、病灶分割与标注等多模态数据。

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按工程化层级：

千方医数集 · 商业级 AI-Ready 数据集

官方自营 · 合规交易

乳腺阳性影像数据集

乳腺钼靶阳性病例影像数据，覆盖肿块、钙化等典型征象，面向乳腺 AI 辅助筛查模型训练。

TCT 宫颈细胞学数据集

液基薄层细胞学（TCT）数字图像，含阴阳性判读结果，适配宫颈癌细胞学筛查模型。

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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 1885 个数据集

药物发现与化学电子健康记录药物安全真实世界数据评测基准

TWOSIDES — 药物相互作用副作用权威数据集

4,651,131 药物对-副作用关联63,473 个药物组合645 种药物1,301 种 MedDRA 副作用CSV 开放下载不适用（FAERS 自发报告聚合数据；覆盖 645 种药物）

645 药物 × 63,473 药物对，465 万药物对-副作用关联

Tatonetti Lab（斯坦福大学，后哥伦比亚大学，现 Cedars-Sinai） url: http://tatonettilab.org/resources/tatonetti-stm.html 103

药物发现与化学电子健康记录药物安全疾病监测真实世界数据

FAERS — 全球最大自发药物警戒库

FDA 公开免费下载季度非累计 ASCIIXMLMedDRA 编码七表 PRIMARYID 关联含重复报告需去重去标识化公开数千万条报告（含重复，FDA 仪表盘 2026-03 约 3,282 万条）

FDA 不良事件自发报告系统 · 累计报告 3,000 万+ · 公开免费

U.S. Food and Drug Administration (FDA) url: https://fis.fda.gov/extensions/FPD-QDE-FAERS/FPD-QDE-FAERS.html 70

医学影像内窥镜影像目标检测结直肠癌

LDPolypVideo — 大规模结肠镜视频息肉检测数据集

160 段标注视频40,266 帧标注帧200 个息肉103 段未标注视频560×480 帧图像免费学术获取未披露——患者元数据已全部移除，仅提供视频与帧

263 段结肠镜视频、40,266 帧圆形标注、200 个息肉的视频息肉检测基准

中国科学技术大学 & 安徽医科大学第一附属医院 url: https://github.com/dashishi/LDPolypVideo-Benchmark 100

医学影像医学问答与基准内窥镜影像医学图像分割评测基准

CVC-ClinicDB — 结肠镜息肉分割基准数据集

612 帧专家标注掩膜31 序列23 患者约 50MB 大小免费下载（非商业）MICCAI 2015 官方训练集23 名患者 · 612 帧

息肉分割领域被引最多的公开基准 · 612 帧专家标注 · 引用 2,400+

巴塞罗那自治大学计算机视觉中心（CVC）& Hospital Clínic de Barcelona url: https://polyp.grand-challenge.org/CVCClinicDB 112

医学影像内窥镜影像图像分类目标检测

Kvasir-Capsule — 最大公开胶囊内镜视频数据集

约 89GB（含视频）521MB（仅标注帧）47,238 张标注帧14 类病灶标注含边界框免注册下载CC BY 4.047,238 张标注帧 / 117 段视频

全球最大公开胶囊内镜数据集 · 47,238 标注帧 · 14 类病灶

Simula 都会数字工程研究中心（SimulaMet）& Vestre Viken 医院集团 url: https://datasets.simula.no/kvasir-capsule 76

内窥镜影像医学图像分割结直肠癌

Kvasir-SEG — 胃肠道息肉分割数据集

46.2 MB 轻量数据集1,000 张图像 + 掩膜含边界框 JSON免注册直接下载商用需书面许可1,000 张息肉图像

息肉分割事实标准基准 · 1,000 张结肠镜图像 + 专家掩膜 · 引用 2,500+

Simula Research Laboratory & Vestre Viken Health Trust url: https://datasets.simula.no/kvasir-seg/ 143

医学影像医学问答与基准内窥镜影像医学图像分割手术视频评测基准

PolypGen 多中心息肉检测与分割数据集

8,037 帧结肠镜图像3,447 个像素级息肉实例300+ 名患者5 国 6 中心CC BY 4.0 免费获取300+ 名患者（6 中心每中心至少 50 名，官方未公布确切总数）

横跨 5 国 6 中心的 8,037 帧结肠镜息肉数据集，专为跨中心泛化评估而建

University of Oxford / SimulaMet / EndoCV2021 Consortium（Synapse 托管） url: https://www.synapse.org/#!Synapse:syn26376615/wiki/613312 88

医学影像医学问答与基准医学图像分割眼科影像评测基准

DRIVE — 视网膜血管分割金标准

40 张 768×584 眼底彩照训练测试各 20 张双标注者像素级血管掩码约 40 MB ZIP注册后免费获取40 张图像（源自 400 名糖尿病受试者筛查人群）

40 张眼底彩照双标注血管分割基准，25 年被引近 4,000 次

Image Sciences Institute, University Medical Center Utrecht url: https://drive.grand-challenge.org/ 91

基因组学与多组学测序数据转录组

FANTOM5 — 哺乳动物转录调控元件图谱

2,832 个 CAGE 样本201,802 个人类 CAGE 峰65,423 个增强子CC BY 4.0 开放获取核心表达表 4.1 GB2,832 个样本（1,816 人 + 1,016 小鼠，phase 1+2）

975 人类样本启动子图谱 + 43,011 增强子，CAGE 单碱基分辨率转录调控参考

FANTOM Consortium / RIKEN Center for Integrative Medical Sciences url: https://fantom.gsc.riken.jp/5/ 74

医学影像CT医学图像分割肿瘤学肺癌

LCTSC — 肺癌放疗 CT 正常器官勾画挑战

60 例胸部放疗 CT5 类正常器官勾画5.15GB DICOMCC BY 3.0 公开60 例患者

60 例胸部放疗 CT + 5 类正常器官勾画，TCIA 公开基准

The Cancer Imaging Archive (TCIA) url: https://www.cancerimagingarchive.net/collection/lctsc/ 84

医学影像病理图像乳腺影像图像分类肿瘤学乳腺癌

BACH — 乳腺癌组织学图像挑战赛数据集

约 13.4 GB（Zenodo 两包）500 张显微图像 + 40 张 WSI四分类完全均衡像素级 WSI 标注CC BY-NC-NDZenodo 免费下载500 张显微图像 + 40 张全切片

ICIAR 2018 乳腺癌组织学挑战赛 · 500 张 H&E 显微图像 + 40 张 WSI

INESC TEC & i3S（IPATIMUP/INEB），葡萄牙波尔图大学 url: https://iciar2018-challenge.grand-challenge.org/ 129

医学问答与基准医疗NLP医学考试医学问答

HeadQA — 西班牙医学考试问答数据集

6,765 道多选题西英双语约 159MB（含图像）MIT 许可含图像题免费获取6,765 道考题

6,765 道西班牙医疗国考真题 · 西英双语 · 多语言 LLM 基准

拉科鲁尼亚大学 CITIC（Vilares & Gómez-Rodríguez） url: http://aghie.github.io/head-qa 69

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