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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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共 796 个数据集

医学影像MRI挑战赛数据集脑影像评测基准

RealNoiseMRI 运动退化脑MRI挑战赛数据集

影像数据原始数据健康志愿者：挑战赛设计 25 名，OpenNeuro 公开版 22 名（单次访视）

丹麦哥本哈根 NRU 主办的 fastMRI 式鲁棒性挑战赛数据集：25 名志愿者设计、22 人公开，静卧真值与预设运动退化成对采集的轴位 T1-STIR 与 T2-TSE 脑 MRI，配 k-space 与运动轨迹，SSIM 加放射科目视评测，OpenNeuro CC0 公开

Rigshospitalet（哥本哈根）采集的健康志愿者脑 MRI：轴位 T1 加权 STIR（0.9×0.9×5.0 mm，GRAPPA PE=2）与轴位 T2 加权 TSE（0.4×0.4×5.0 mm，GRAPPA PE=2，两次平均），每序列含静卧真值与预设运动退化成对采集，配对应 k-space 与运动数据；图像轨 BIDS 格式，k-space 轨 vendor-neutral HDF5 28

医学影像MRI医学图像分割挑战赛数据集心血管疾病

COSMOS 2022 颈动脉血管壁分割挑战赛数据集

影像数据原始数据人工标注75 例颈动脉 MRI 受检者（训练与验证 50 例、测试 25 例），每例含双侧颈动脉；单一医院（仁济医院）3T Philips 扫描仪采集

清华大学 Xihai Zhao 团队联合上海仁济医院与华盛顿大学主办的 MICCAI 2022 挑战赛数据集：3T Philips 3D VISTA 黑血 MRI 颈动脉双侧成像，50 例训练验证、25 例测试，专家勾画内膜与外壁轮廓，Dice 评测，Zenodo 三段分发

上海交通大学医学院附属仁济医院 3T Philips MRI 的 3D VISTA（volume isotropic turbo spin-echo acquisition）黑血序列，冠状采集、亚毫米各向同性分辨率（约 0.53 至 0.58 毫米平面内、0.6 毫米层向），DICOM 格式，附专家以专用血管壁标注软件勾画的内膜与外壁轮廓（QVS 格式） 16

医学影像挑战赛数据集评测基准

USenhance 2023 超声图像增强挑战赛数据集

影像数据原始数据109 名患者（官方 Zenodo 描述口径）；成对图像 1,500 对共 3,000 张；官方测试集 210 张（第三方复现记录口径）

MICCAI 2023 附属挑战赛公开的成对手持低质-临床级高质超声图像集：甲状腺、颈动脉、肝脏、乳腺、肾脏多器官，LNCC/SSIM/PSNR 平均秩评测，grand-challenge.org 双阶段提交

手持超声设备采集的低质量 B 模式图像与临床级超声系统的配对高质量参考图像，覆盖甲状腺、颈动脉、肝脏、乳腺、肾脏多器官，256×256 灰度图 44

医学影像CT挑战赛数据集评测基准

低剂量CT感知图像质量评估挑战赛数据集

人工标注影像数据原始数据1,000 张 512×512 CT 切片（训练集口径）；患者级数量与身份信息未随数据发布

低剂量腹部 CT 切片图像（512×512）+ 多名放射科医生感知质量评分（0-4 分制均值）+ 挑战赛官方评测指标定义（|PLCC|/|SROCC|/|KROCC|） 28

医学影像挑战赛数据集评测基准

AI4Life 显微图像去噪挑战赛 2024

原始数据影像数据非临床数据：荧光显微图像与电压成像数据，不含人体受试者个体信息

AI4Life 联盟主办的首届生物影像公开挑战赛：无监督显微图像去噪任务，四个数据集横跨结构化与非结构化噪声，grand-challenge.org 平台评审，SI-PSNR 与 SSIM 双指标排行

四个挑战用数据集：JUMP Cell Painting datasets（GitHub）、W2S 宽场到 SIM 映射数据（GitHub IVRL/w2s）、Hagen et al. 荧光显微训练数据（GigaScience Database 100888）、SUPPORT 电压成像数据（Nature Methods 2023 附属），测试集隐藏托管于 grand-challenge.org 23

医学影像MRI医学图像分割脑肿瘤挑战赛数据集肿瘤学

BrainPTM 2021 脑术前白质纤维束映射数据集

影像数据原始数据人工标注75 例脑肿瘤术前患者（训练 60 例、测试 15 例），单一中心采集

以色列 Sheba 医学中心单中心 75 例脑肿瘤术前 T1 与扩散加权 MRI，60 例训练集附皮质脊髓束与视辐射共四束半自动体素掩码，4 例缺 CST；Dice 与 Jaccard 评测，禁止再分发与商用

Sheba 医学中心 3T Signa 扫描仪采集的无增强 T1 加权像（原始 1 mm 各向同性）与 64 方向扩散加权像（原始 1×1×2.6 毫米），经 MrDiffusion 配准、BET 颅骨剥离后统一重采样至 1.25 毫米各向同性、128×144×128 体素，配套半自动标注的皮质脊髓束与视辐射左右共四束二值掩码 18

医学影像手术视频内窥镜影像图像分类评测基准

CholecTriplet2022 手术动作三元组检测挑战赛

人工标注影像数据视频数据50 段腹腔镜胆囊切除术视频（挑战赛划分：45 训练 + 5 私有测试；患者数未逐段披露）

MICCAI EndoVis 2022 内镜视觉挑战赛：以 CholecT50 为官方基准，在仅给帧级二元标签的弱监督下同时完成手术动作三元组识别、器械尖端定位与框-三元组关联检测

CholecT50 挑战赛版：1 fps 抽帧视频与帧级三元组/器械/动词/目标/阶段二元标签（.txt）+ 自验证片段与私有测试集的器械尖端边界框及 box-triplet 配对标注 20

医学影像神经科学挑战赛数据集评测基准

AI4Life 钙成像去噪挑战赛 2025

原始数据合成数据影像数据非临床数据：5 个合成钙成像样本（训练 4 + 验证 1），不含人体受试者

AI4Life 联盟主办的钙成像去噪公开挑战赛：合成双光子视频栈配精确 ground truth 与受控噪声注入，双赛道评估空间重建与时间动态保真，Zenodo 公开、CC BY

AI4Life-CIDC25 训练集（Zenodo 15799506，4 个 in-silico 样本 A1/B1/C2/D2，两种噪声强度）+ 验证集（Zenodo 15807610，1 个样本的 clean 版 F0 与三个噪声级 F1/F2/F3），单栈形状 [1500, 490, 490]，TIFF 格式 28

医学影像医学图像分割病理图像挑战赛数据集评测基准

NeurIPS 2022 细胞分割挑战赛数据集

影像数据人工标注原始数据基准数据无患者级临床数据；图像来自体外培养细胞、外周血涂片、骨髓涂片、组织切片与细菌/酵母培养等 50 余个生物学实验，仅保留细胞级实例标注

四十家实验室、五十余个生物学实验拼出的多模态显微图像细胞实例分割基准——1000 张有标注加 1725 张无标注训练图、422 张跨实验测试图，以「弱监督 + 准确率与耗时双指标」逼出可直接部署的通用分割器，冠军方案 Nature Methods 2024 发表

grand-challenge.org 赛事官方发布的四类显微模态图像（明场 300 张、荧光 300 张、相差 200 张、DIC 200 张有标注训练图，另 1725 张无标注训练图，101 张调优图，422 张私有测试图），Zenodo 记录 10719375 为 21.3 GB 归档 23

医学影像手术视频视觉问答挑战赛数据集评测基准

创伤 THOMPSON 挑战赛

影像数据人工标注视频数据录像 220 段（其中 177 段常规操作、43 段即需变通操作）；按片段计为 3,717 段；参与者为受训人员与临床医师，人数未公开

第一人称视角的急救操作视频理解赛事——五类战伤与灾害现场救命操作的 220 段无脚本录像，标注动作、手势、器械与问答，2023 年起随 MICCAI 举办，数据托管于 Harvard Dataverse

头戴式第一人称摄像头录制的五类救命操作视频 + 动词-名词动作时段标注 + 左右手边界框 + 12 类器械框 + 医学视觉问答问答对；托管于 Harvard Dataverse（doi:10.7910/DVN/V5BTRU） 18

医学影像挑战赛数据集图像分类医学图像分割心血管疾病

超声心动图去雾挑战赛 2025

影像数据原始数据人工标注提案口径 125 人（易成像 75 + 难成像 50）；官网现行口径 115 人（75 + 40）；另有 10 名难成像患者构成测试集

MICCAI 2025 挂靠的单帧去雾挑战：复旦联合 Vinno 用 ULTIMUS 9E 采集易/难成像两组四腔心图像，以 FID、gCNR、KS 与左心室分割指标评测，数据签署协议后按需发放

复旦大学与 Vinno（苏州）联合采集：ULTIMUS 9E 设备四腔心经胸超声心动图，易成像组洁净图像作训练先验，难成像组含噪图像按 8:2 划分训练与测试 27

医学影像病理图像医学图像分割图像分类挑战赛数据集结直肠癌

CoNIC 结肠细胞核识别与计数挑战赛

人工标注影像数据原始数据未按患者披露；图像区域来自 Lizard 的六个数据源（病理切片级联），训练发布剔除 TCGA 部分

4,981 张 256×256 结肠 H&E 切块、六类细胞核、分割+分类+计数双任务的 ISBI 2022 挑战赛

Lizard 数据集派生的 4,981 张 256×256 结肠 H&E 切块（.npy 图像与双通道标注数组）+ counts.csv 六类计数表 + Lizard 原始 .mat 标注 27

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