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数据标签

医学影像 AI-Ready 数据集

电子病历与文本数据集

病灶分割与标注数据集

共 785 个数据集

Human Liver Single-cell Atlas of Chronic Liver Disease — 77 例 64.9 万细胞人肝图谱与 OLR1+ 瘢痕相关巨噬细胞
基因组学与多组学单细胞基因组学转录组表观基因组测序数据

Human Liver Single-cell Atlas of Chronic Liver Disease — 77 例 64.9 万细胞人肝图谱与 OLR1+ 瘢痕相关巨噬细胞

原始数据基因表达矩阵细胞注释空间数据77 例供肝者(42 例健康 + 35 例慢性肝病患者);另 46 例空间蛋白组队列、632/663 例 SteatoSITE bulk 队列、小鼠模型若干

42 例健康 + 35 例慢性肝病患者、649,295 个肝细胞、125 种转录状态:把人肝纤维化微环境拆到单个细胞状态,并锁定 OLR1(LOX-1)作为可成药靶点的一体化图谱资源

PsychAD — 1,494 例供体 632 万核背外侧前额叶单核转录组跨疾病图谱
基因组学与多组学神经科学单细胞基因组学转录组测序数据阿尔茨海默病

PsychAD — 1,494 例供体 632 万核背外侧前额叶单核转录组跨疾病图谱

原始数据受控访问数据组学数据1,494 例已故供体(MSSM 1,042 + HBCC 300 + RADC 152);6,320,459 个细胞核

NIA 资助 PsychAD 联盟 2019 年启动,以 10x 3′ v3.1 + 核哈希多重标记产出的 DLPFC snRNA-seq 图谱:1,494 例供体、632 万核、8 大类 27 亚类 67 亚型,21% 供体为跨诊断共病;本体走 Synapse 受控访问,CELLxGENE 只给可视化聚合,AWS Open Data 提供管控 S3 桶

CURVAS-PDACVI — 五位专家各自标注的胰腺癌血管侵犯基准
医学影像CT医学图像分割评测基准挑战赛数据集肿瘤学

CURVAS-PDACVI — 五位专家各自标注的胰腺癌血管侵犯基准

人工标注影像数据原始数据125 例 PDAC 增强 CT 初筛(PANORAMA 子集);论文最终可用 109 例,公开训练 40 / 验证 5 / 测试 64(Zenodo v3 与挑战赛页另一口径写测试 85,详见 §1

MICCAI 2025 CURVAS 第二届:从 PANORAMA 挑 125 例胰腺导管腺癌增强 CT,40 例公开训练集含 5 位独立放射科医生逐例标注,人-人 Dice 仅 58.4%±25.7%;评价框架以 MR-ECE、CRPS 与逐血管 Wasserstein 距离取代单一 ground truth 打分。

Multiscale Spatial Transcriptomics Atlas of the Human Amygdala — 9 例神经典型供体、三平台、110 万细胞级的人杏仁核空间图谱
神经科学转录组单细胞基因组学测序数据脑影像

Multiscale Spatial Transcriptomics Atlas of the Human Amygdala — 9 例神经典型供体、三平台、110 万细胞级的人杏仁核空间图谱

原始数据衍生数据公开数据库9 名神经典型供体(5 男/4 女;方法节另写采集 N=10);GEO 样本 51+4+5=60,去重后 9 供体

同一研究的三个技术子集:Visium(GSE342709,51 样本/7 供体)+ Xenium(GSE342289,4 样本/4 供体)+ Visium HD(GSE342738,5 样本/2 供体),9 名供体并集、13 个空间域、366 基因 Xenium panel——不是单次大规模测序,也不是疾病队列

OpenPros — 首个有限角前列腺超声计算机断层大规模基准
医学影像评测基准医学图像分割

OpenPros — 首个有限角前列腺超声计算机断层大规模基准

仿真数据影像数据原始数据4 例临床 MRI/CT 患者解剖(患者级 ID 3_01-3_04)+ 62 例离体前列腺标本,共 66 个解剖来源;280,080 个 2D 配对仿真样本

ICLR 2026 发布的 28 万+ 配对样本前列腺 USCT 基准:真实临床 MRI/CT 专家分割与 62 例离体前列腺实测声速构建解剖逼真 3D 数字体,经开源 FDTD 与 Runge-Kutta 声波求解器仿真生成全波形数据,6.8 TB 公开下载

OpenTME — TCGA H&E 切片的 AI 肿瘤微环境特征集
病理图像多模态肿瘤学图像分类评测基准

OpenTME — TCGA H&E 切片的 AI 肿瘤微环境特征集

合成派生数据影像数据结构化表格4,696 张 H&E 全切片(2026-07 版,8 癌种 / 8 个 TCGA 项目;论文 v1 口径为 5 癌种 3,634 张、3,424 例);病例数未逐癌种复算

Aignostics 用 Atlas H&E-TME 把 TCGA 的 4,696 张 H&E 全切片压成每张 4,500+ 列结构化的 TME 特征表:7 类组织/9 类细胞/20µm 与 40µm 邻域共现,机构邮箱申请、禁用于 AI 训练、禁再分发

HISTAI — 11 万张全切片+47,279 例临床元数据的研究用非商用病理语料
医学影像病理图像多模态影像影像-文本对齐队列研究肿瘤学

HISTAI — 11 万张全切片+47,279 例临床元数据的研究用非商用病理语料

影像数据临床文本原始数据论文口径 26,142 例;仓库现状 47,279 例(第三方核账为 44,564 唯一病例,人口学字段仅 55% 可得)

HISTAI:商业机构 hist.ai 以 CC BY-NC 4.0 发布的多器官 WSI 语料,覆盖皮肤/结直肠/乳腺/胸科/胃肠/血液八子集与 ICD-10 临床文本;全部 gated 申请制,论文宣称 60,110 张 26,142 例、仓库现状 112,801 张 47,279 例

ChestPathCT5-S100 — 洛桑大学医院 87 例真实世界胸部 CT 的五病变开放数据集
医学影像CT图像分类目标检测真实世界数据

ChestPathCT5-S100 — 洛桑大学医院 87 例真实世界胸部 CT 的五病变开放数据集

87 例胸部 CT(NIfTI)五类病变单标签 + 87×5 共现矩阵三种对比剂期相(动脉静脉平扫)Zenodo 直下 · 9.4 GB87 例检查(初始 100 例,排除 13 例);男 49 / 女 38;年龄中位 64 岁

十年单中心回顾性队列压缩成 9.4 GB 的 NIfTI 大礼包——肋骨骨折、胸腔积液、肺肿块、肺栓塞、气胸各成一包,刻意保留动脉期/静脉期/平扫三种采集异质性,配一张 87×5 共现矩阵撑起多标签研究,CC0 1.0 零门槛直下

BronchoAccess — 438 例术前 CT 联结支气管镜真实取材转归的可达性预测数据集
医学影像CT图像分类内窥镜影像肺癌评测基准

BronchoAccess — 438 例术前 CT 联结支气管镜真实取材转归的可达性预测数据集

影像数据临床结局标注公开数据438 例患者(3 家临床中心),每例 1 个目标病灶;279 例诊断成功 + 159 例非诊断

三中心 438 例 3D CT 配对「活检是否取得诊断性组织」的术后硬结局,把「这支镜子能不能到」从术者主观阅片变成可监督的二分类任务,并以解剖感知专家混合模型(AUROC 0.8052)确立首个基准

AortaSeg-60 — 60 例真实世界胸腹主动脉 CTA 与 TotalSegmentator 自动分割掩膜
医学影像CT医学图像分割心血管疾病真实世界数据评测基准

AortaSeg-60 — 60 例真实世界胸腹主动脉 CTA 与 TotalSegmentator 自动分割掩膜

影像数据原始数据自动标注60 例检查(6 类 × 10 例;单中心回顾性 2014–2024)

瑞士洛桑 CHUV 单中心回顾性 60 例、六类各 10 例均衡分组(年轻正常/老年正常/动脉瘤/夹层/静脉期/平扫),TotalSegmentator 2.12.0 任务 52 全自动出膜且零人工修正,Zenodo CC0 直链 15.9 GB

DBT-TU-JU Breast Thermogram Database — 印度 100 例 1100 张带热点标注的乳腺红外热图库
医学影像乳腺影像图像分类医学图像分割乳腺癌评测基准

DBT-TU-JU Breast Thermogram Database — 印度 100 例 1100 张带热点标注的乳腺红外热图库

影像数据人工标注原始数据100 名受试者(1100 张乳腺热图;健康/疾病两档,疾病档再分良性囊肿与恶性肿瘤,各类确切张数论文未披露)

印度生物技术部资助、特里普拉大学红外实验室 2014-2017 采集的乳腺热成像库:100 名受试者 1100 张热图,按钼靶与细针穿刺定标为健康/良性/恶性三档,并为可疑高温区逐张生成像素级 ground truth,配套 6 种分割方法与 5 项有监督指标的横向评测

ACL Jump-Landing MoCap — 43 人 2199 次试次疲劳前后六种跳跃落地的三维动捕与测力台数据
生理信号步态与运动骨骼肌肉影像队列研究时序数据

ACL Jump-Landing MoCap — 43 人 2199 次试次疲劳前后六种跳跃落地的三维动捕与测力台数据

原始数据时序数据实验测量数据43 名受试者(ACL 伤史组 21 + 健康对照 22;初始纳入 44,剔除 1);共 2199 次可用试次(原始 c3d 2201,计划上限 2236)

因斯布鲁克大学 Science Data 数据描述符:21 例 ACL 伤史 + 22 对照,单/双腿六任务 × 疲劳/非疲劳,Vicon 十相机 250 Hz 与双测力台 1000 Hz 同步,OpenSim 4.3 逆运动学关节角 + 原始 c3d 全公开

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