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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 785 个数据集

医学影像CT脑影像儿科

A Normative Dataset of Healthy Pediatric Cranial Computed Tomography (CT) Images — FDA 健康儿童颅脑 CT 规范参考库

影像数据原始数据人口学数据100 例健康儿童（1 个月-10 岁；女 45 / 男 55）；100 studies / 100 series（1:1:1，每人一次扫描）

FDA CDRH 监管科学工具 RST26PD01.01 配套发布的正常参考图像库：100 例健康儿童颅脑平扫 CT（1 个月-10 岁，3.2 GB MHA，无对比剂），供医疗器械与 AI/ML 使能软件研发、验证、评估作 normative reference；图像、人口学表与脚本全组件 CC BY 4.0，经 TCIA 分发

Children's National Hospital 健康儿童颅脑平扫 CT 100 例（MHA 3.2 GB，无对比剂，层厚 0.625-5.4 mm）+ TCIA 分发人口学 TSV（age in days/生物学性别/种族族裔）+ v7 comprehensive metadata 报告 TSV（45.4 kb）+ FDA RST 附属 Python 脚本 2 件 36

眼科影像真实世界数据时序数据青光眼评测基准医学图像分割

UWHVF — 华盛顿大学 Humphrey 视野纵向数据集

真实世界数据时序数据临床测量3,871 名患者 / 7,428 只眼 / 28,943 次视野测试（进展分析子集 1,579 名患者 / 2,985 只眼）

28943 次 Humphrey 视野分析仪 24-2 逐点敏感度测试 · 7248 眼 3871 例 · 1998-2018 单中心真实世界常规护理 · BSD-3-Clause GitHub 公开直链 · 附 TD/PD/GH/MTD/PSD/MS 全套派生指标与进展回归

华盛顿大学眼科系常规临床护理中 Humphrey Field Analyzer II（HFA II, Carl Zeiss Meditec）24-2 白-白 Goldmann 刺激 III 号视野测试；逐点敏感度（dB）加 TD/PD/GH/MTD/PSD/MS 及 Garway-Heath 分簇指标与进展回归，JSON（长格式向量加 8×9 矩阵）与长格式 CSV 45

医学影像内窥镜影像图像分类挑战赛数据集肿瘤学

Intel & MobileODT Cervical Cancer Screening — Kaggle 十万美元宫颈癌筛查竞赛 — EVA System 阴道镜图像三分类，512 张公开测试标签被 98 轮 logloss 逆推全中

人工标注影像数据原始数据6733 张标注宫颈图像（train+additional：Type 1 为 1191 张、Type 2 为 3565 张、Type 3 为 1976 张）；Stage 1 公开测试 512 张；St

Intel 与 MobileODT 联合主办的 10 万美元 Kaggle 竞赛数据集——6733 张宫颈图像按转化区分型三分类（Type 1/2/3），multi-class logloss 评测，Stage 1 全部 512 个测试标签被 AAAI 论文算法 98 轮逆推，组织者以 87% private 集冻结管线应对

MobileODT EVA System（Enhanced Visual Assessment，便携式阴道镜设备）拍摄的宫颈图像，转化区分型标注由阴道镜专家 Prof. Albert Singer 完成；配套 fixed_labels_v2.csv 标注修正包、solution_stg1_release.csv Stage 1 答案、test_stg2.7z Stage 2 测试包 68

医学影像CT图像分类挑战赛数据集COVID-19评测基准

STOIC2021 新冠重症预测挑战赛

影像数据人工标注临床结局标签队列 10,735 例；挑战公开训练 2,000 例 / 测试约 1,000 例 / 私有训练 7,000+ 例（每例 1 次 CT）

2,000 次公开训练 CT / 1,000 次封闭测试 CT / 7,000 余次私有 CT：从一次胸部 CT 预测谁会在一个月内插管或死亡

20 所法国大学医院急诊科 2020 年 3–4 月收治的疑似 SARS-CoV-2 感染者的胸部 CT（.mha）+ reference.csv 双标签（RT-PCR 阳性、1 个月内重度） 66

医学影像MRI挑战赛数据集图像分类肿瘤学

PROSTATEx-2 前列腺 MR 分级组挑战

影像数据人工标注原始数据162 例检查（每例来自不同患者），共 182 处病灶（训练 112 / 测试 70）

162 例多参数前列腺 MRI、182 处病灶的独立 TCIA 集合，用治疗前影像预测 2014 ISUP 五级 Gleason 分级组，测试集二次加权 kappa 上限仅 0.27

TCIA SPIE-AAPM-NCI PROSTATEx Challenges 集合的 PROSTATEx-2 子集：Radboudumc 采集的 162 例前列腺 MRI（T2W 轴位与矢状位 DICOM、Ktrans .mhd/.zraw、ADC DICOM），配病灶质心坐标、参考缩略图与 2014 ISUP 分级组真值表 61

医学影像病理图像医学图像分割肿瘤学肺癌评测基准

LUAD-HistoSeg — 肺腺癌组织学弱监督语义分割数据集

H&E 染色全切片图像病理 patch弱监督标签像素级分割掩码多类别组织注释54

广东省人民医院团队发布的肺腺癌 H&E 全切片弱监督组织分割数据集：54 位患者的 224×224 病理 patch，仅凭 patch 级分类标签即可训练出 MIoU 0.751 的四类组织分割模型。

广东省人民医院病理科（Guangdong Provincial People's Hospital, GPPH）经 Google Drive 公开分发 url: https://github.com/ChuHan89/WSSS-Tissue 64

医学影像乳腺影像图像分类医学图像分割评测基准乳腺癌

MIAS / Mini-MIAS — 乳腺 X 线数字图像分析学会数据库

X光影像图像分类图像分割医学影像161

The Mammographic Image Analysis Society Digital Mammogram Database（英国乳腺图像分析学会数字乳腺 X 线数据库）——1994 年影像组学时代的活化石

MIAS / Mini-MIAS Digital Mammogram Database url: https://www.repository.cam.ac.uk/handle/1810/250394 56

医学影像内窥镜影像医学图像分割挑战赛数据集结直肠癌

GIANA 胃肠道图像分析挑战数据集

grand-challenge.orgMICCAI-EndoVis注册墙获取结肠镜视频胶囊内镜息肉分割血管扩张检测多任务挑战未按患者口径统计：数据以视频帧/静态图像级发放，2018 版六赛道合计逾 8,000 帧/张（视频 18+ 条、SD 分割 912 张、HD 分割 >150 张、WCE 检测/定位各 1,200 张、

MICCAI EndoVis 子挑战系列：结肠镜息肉检测/分割与小肠胶囊内镜血管扩张识别（ISBI 2015 至 MICCAI 2021 赛季沿革与六赛道全景）

GIANA — Gastrointestinal Image ANAlysis Challenge（giana.grand-challenge.org） url: https://giana.grand-challenge.org/ 36

医学影像医学问答与基准皮肤影像评测基准

Fitzpatrick 17k — 皮肤病诊断公平性基准数据集

16577 张临床照片114 种皮肤状况Fitzpatrick I-VI 肤色标签公开图集来源，无患者级元数据

MIT Media Lab (github.com/mattgroh/fitzpatrick17k) 113

医学影像PETCT医学图像分割挑战赛数据集肿瘤学

autoPET/CT IV 交互式病灶分割挑战

人工标注原始数据影像数据PET/CT 1,611 项研究（1,278 名患者）+ 纵向 CT 300 名患者

MICCAI 2025 第四届 autoPET：双示踪剂全身 PET/CT 点击交互分割与黑色素瘤纵向 CT 随访追踪，两任务 1,611 + 300 例训练、200 + 140 例测试

Tübingen 大学医院 MIDAS.lab（UKT）与慕尼黑大学医院（LMU）联合发布；纵向 CT 队列由 UKT 采集、美因茨大学医院（UM Mainz）提供外中心测试 16

基因组学与多组学转录组单细胞基因组学测序数据

人与小鼠肾上腺单细胞与空间转录组图谱

原始数据测序数据多组学数据人 11 例成人供体（6 男 5 女，18-73 岁）+ Stereo-seq 独立 3 例（13/20/40 岁）；小鼠 6-8 周龄多例，雌雄分别分析

11 例成人供体 scRNA-seq + Visium/Stereo-seq + 小鼠 Visium HD：种属特异的类固醇合成状态与组织更新路径

成人肾上腺（维也纳医科大学器官捐献者队列，单侧腺体）scRNA-seq + 10x Visium + STOmics Stereo-seq；小鼠肾上腺 10x Visium HD + scRNA-seq；整合人胎儿肾上腺公开 scRNA-seq、GTEx 肾上腺 bulk、TCGA-ACC bulk 43

基因组学与多组学单细胞基因组学转录组表观基因组眼科影像评测基准

Human RPE and Choroid Atlas — 人视网膜色素上皮与脉络膜 v1 多组学单细胞图谱（GSE312791）

原始数据测序数据公开数据成人/出生后供体按模态分列：scRNA-seq 67 位、snRNA-seq 54 位；论文整合口径 102 位（0-99 岁，含发育期与外部 AMD 队列）

斯坦福 Rui Chen 组牵头、30 位作者跨 10 余家机构共建的 HCA 眼生物学网络核心资源：scRNA-seq 205,925 细胞 / 67 供体 + snRNA-seq 742,625 核 / 54 供体 + 发育期 136,555 核（PCW 10-23）+ snATAC-seq 234,007 核，收束为 15 大类 25 细胞类型的 v1 参考图谱

GEO GSE312791（150 个 GSM 样本：85 个 RNA 表达矩阵 + 65 个 snATAC-seq 样本）｜CELLxGENE Discover 集合 48c15b0c-6039-4e0f-9668-b6b3c0b830ad（9 个 H5AD）｜论文 bioRxiv doi:10.64898/2026.07.23.740352 35

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