即取即用的 AI-Ready 医疗数据集库

MIMIC-CXR-JPG 全量 377,110 张胸片的两轮长尾重标注（14→26→45 类）：ICCV 2023 CVAMD 与 MICCAI 2024 两届挑战赛、zero-shot 5 未见类赛道、mAP 主指标、96 队申请 61 队获批、PhysioNet credentialed 1.5.0

MIMIC-CXR-JPG v2.0.0 全量 377,110 张胸片（图像本体不在本包）+ 规则法报告解析标签（45 类含 Normal；45=14 原始+12+19 rare 两轮扩展）+ 406 张 6 人共识 gold standard 子集 + 三任务 train/development/test 划分 CSV 44

医学影像医学图像分割挑战赛数据集评测基准脑影像

MITOEM

人工标注影像数据原始数据2 个 volume（MitoEM-H 成人脑皮层 + MitoEM-R 成年大鼠脑皮层；供体级数量与人口学信息未在一级来源披露）；测试半卷 GT 私有

ISBI 2021 大规模三维线粒体实例分割挑战赛数据集：人+大鼠皮层 EM 两卷各 1,000×4,096×4,096 体素（8×8×30 nm）、约 4 万实例真值、AP-75→accuracy 双轨评测、IIPPR 夺冠、挑战至今开放提交

两卷连续切片电子显微镜（EM）三维图像栈：每卷 1,000×4,096×4,096 voxels、8×8×30 nm（物理 32.8×32.8×30 µm），人/大鼠脑皮层各一；线粒体实例真值：每卷前 500 slices（train 400 + val 100），v1 H 24.5K/R 14.4K、v2 H 19K/R 10.8K 实例，实例≥2,000 voxels；后 500 slices 私有测试 29

医学影像PETCT医学图像分割肿瘤学

CALGB50303 — Alliance/CALGB 50303 一线弥漫大 B 细胞淋巴瘤 III 期随机试验 PET/CT 影像与衍生肿瘤病灶 RTSTRUCT 标注双层资源

人工标注影像数据原始数据155 名 DLBCL 患者（TCIA 主影像与标注同规模）；母试验口径链：524 登记 / 491 试验合格 / 169 同意 PET 子研究 / 158 子研究合格

TCIA 受控主影像（155 例/610 检查/1,944 series/513,669 幅/138.84 GB，NIH Controlled）与 CC BY-4.0 公开肿瘤病灶 RTSTRUCT 标注（155 例/3,073 series，CapeStart 双级放射医生流水线）双层结构；母试验 DA-EPOCH-R 未优于 R-CHOP（PFS HR 0.93，P=.65），PET 子研究确立 Deauville 5-PS 加 ΔSUV≥66% 的前瞻阴性判据

FDG-PET/CT 影像（CT+PT+OT 三模态，多中心 Siemens Biograph / Philips GEMINI / GE Discovery）+ 衍生肿瘤病灶 RTSTRUCT 标注（CapeStart 双级放射医生流水线，PERCIST/RECIST 1.1 规则，SNOMED-CT 编码）+ NCTN/NCORP 临床与结局数据（另行受控申请） 36

眼科影像医学图像分割图像分类青光眼

PAPILA — 同一患者双眼配对眼底图与临床数据的青光眼评估数据集

人工标注影像数据临床数据原始数据244 患者 / 488 眼（每位患者左右眼各 1 张眼底图，共 488 张）

244 患者 / 488 眼配对彩色眼底图 + 结构化临床指标 + 双专家逐像素视杯/视盘分割，西班牙 UPCT 与 Reina Sofía 医院联合出品：首份把「配对双眼、临床表格、双标分割」三合一的青光眼评估数据集，观察者间 Dice 视盘 0.935 / 视杯 0.823，且 suspect 类被证明不是 healthy 与 glaucoma 之间的中间态

西班牙 Hospital General Universitario Reina Sofía 采集：Topcon TRC-NW400 非散瞳眼底相机拍摄的 2576×1934 JPEG 眼底图（30° 孔径、以视乳头为中心）× 488 眼 + 结构化临床表格（年龄/性别/诊断/IOP/角膜厚度/眼轴长/MD 等）+ 两位眼科专家逐像素勾画的视杯与视盘轮廓坐标（2 专家 × 2 眼 × 2 结构 × 244 患者 = 1952 文件） 91

医学影像内窥镜影像图像分类评测基准肿瘤学

MIQR-CC ERCP 精选图像数据集 — 内镜逆行胰胆管造影荧光图像的 5 类临床所见分类库

人工标注影像数据原始数据1,602 例患者

1,602 例患者、19,018 张原始 ERCP 荧光透视帧、5,519 张专家标注图像，2 名消化内科医师独立标注并由 20 年经验高年资医师裁定终审；5 类临床所见（胆道结石/胆漏/良性狭窄/恶性狭窄/正常），双机型（Ziehm Vision RFD 3D + Philips PCR Eleva）单中心连续收案，70-15-15 按检查分层划分防泄漏，附 EfficientNet/DenseNet/ResNet/MobileNet/DeiT 五基线评测

葡萄牙 ULSAM 消化内镜中心单中心连续收案的 ERCP 荧光透视原始图像（Ziehm Vision RFD 3D 与 Philips PCR Eleva 双 C 臂机型），去标识化 + PNG 转码 + 预处理流水线产出，专家图像级 5 类标注子集 39

医学影像CT图像分类COVID-19

SARS-CoV-2 CT Scan Collection

影像数据原始数据人工标注2482 张 CT 轴位切片（COVID 阳性 1252 + 阴性 1230；主版本无患者 ID）；扩展版 210 例患者（80+50+80）4173 张

Angelov 与 Soares 2020 年 4 月发布的新冠胸部 CT 二分类图像集：医院真实患者轴位切片 2482 张（阳性 1252/阴性 1230），配套可解释分类器 xDNN 报 F1 97.31%，另有患者级三分类扩展版 4173 张，是 2020 年下载量最大的 COVID-CT 数据集之一

多家医院真实患者胸部 CT 轴位切片（PNG）：COVID 阳性 1252 张（文件名 Covid (N).png）+ 非阳性 1230 张（文件名 1-N.png）；Kaggle V2 242.23 MB；另有后续研究者重组的患者级三分类扩展版（COVID-19/Healthy/Others，4173 张） 41

医学影像MRI医学图像分割挑战赛数据集心血管疾病评测基准

LAScarQS 2022 — 左心房与瘢痕定量分割挑战赛

影像数据专家标注原始数据194 例 3D LGE MRI（官网一口径；文献另有 200/200+ 口径）；训练集 LA 130 例 / scar 60 例（二手来源划分）

MICCAI 2022 首届左心房 LA 与左心房瘢痕联合分割挑战赛——194 例多中心多厂商 LGE MRI（Utah/BIDMC/KCL 三家），两项赛道（LA+scar 联合分割、多中心 LA 分割），scar 中位仅 3.18 cm³ 构成极端类别不平衡，官方已停更并演化为 CARE-Left Atrium

三家中心多厂商 3D LGE MRI：University of Utah（Siemens 1.5T/3T，0.625×0.625×2.5 mm）、Beth Israel Deaconess Medical Center（Philips Achieva 1.5T，1.4×1.4×1.4 mm）、King's College London（Philips Achieva 1.5T，1.3×1.3×4.0 mm）；含 LA 血池与瘢痕金标准掩码（NIfTI） 44

医学影像X光影像乳腺影像医学图像分割乳腺癌评测基准

3D Mammogram Dataset — 数字乳腺断层摄影（DBT）开放标注库

人工标注影像数据原始数据558 例女性患者（558 个 DBT 检查；每例双侧 CC+MLO 至少 4 个三维体数据）

558 例 DBT 筛查检查、48.6% 活检证实恶性：iMerit × Segmed × Advocate Health 三方联合发布的专家分割标注乳腺断层数据集——DICOM 三维体数据、自由文本放射报告与活检 ground truth 三合一，非商业研究免费获取

美国中西部单一医院 DBT 筛查 DICOM 检查（每 view 一个压缩 DICOM 三维体文件）+ 专家分割与病灶框标注 JSON + 活检病理结果（四组 271/140/115/32）+ 自由文本放射报告（OCR+NLP+LLM 去标识）+ 人口学与 BI-RADS CSV 39

医学影像MRI医学图像分割挑战赛数据集心血管疾病

LVQuan 2018

人工标注影像数据原始数据cine-MRI 序列175 例受试者（训练 145 + 测试 30），每例 20 帧，共 3,500 帧心中部短轴 cine-MRI

MICCAI 2018 STACOM 首个左心室全量化挑战——Cardiac-DIG 175 例 cine-MRI、逐帧心肌掩码与 12 项量化指标（2 面积 + 3 径线 + 6 壁厚 + 1 时相），12 队基准，直接回归与分割等价结论的官方出处

Cardiac-DIG：加拿大安大略省伦敦市三所医院（隶属 London Healthcare Center 与 St. Joseph's HealthCare）心中部短轴 cine-MRI，统一预处理为 80×80 ROI，逐帧心肌掩码 + 12 项量化指标全心动周期标注 41

医学影像乳腺影像病理图像多模态肿瘤学乳腺癌

Cancer Moonshot Biobank — Invasive Breast Carcinoma Cancer Collection — 美国 NCI 癌症登月生物样本库乳腺癌多模态影像集合

影像数据原始数据多模态101 受试（集合级去重；放射 50 受试 + 病理 99 受试，含跨分区重叠）

NCI Cancer Moonshot Biobank 浸润性乳腺癌队列的放射影像+组织病理整片图像集合——托管 TCIA，Version 6 共 101 受试、203.94GB，放射 50 受试/139,173 图（MR/CT/MG/US/PT）与病理 99 受试/136 切片，公开部分 CC BY 4.0，DICOM 内嵌入组天数可对齐临床事件

NCI Cancer Moonshot Biobank 浸润性乳腺癌队列采集的放射影像（MR/CT/MG/US/PT DICOM）与组织病理整片图像（SVS）+ 病理元数据（JSON）；关联基因组/临床数据托管于 dbGaP(phs002192) 与 Clinical Commons(NCT04314401) 36

医学影像MRI医学图像分割脑影像挑战赛数据集

AIMS-TBI — T1w MRI 中重度颅脑创伤病灶分割挑战赛

人工标注影像数据原始数据1,100 例 T1w MRI（12 站点汇集）；764 例手动病灶分割（训练 388 + 验证 101 + 测试 275）；受试者年龄 5-85 岁

MICCAI 2024 挑战赛数据集：ENIGMA 脑损伤工作组 12 站点汇集 1,100 例中重度 TBI 的 T1w MRI，764 例经 12 人标注团队手动 3D 病灶分割，388/101/275 三分发放，Dice/体积差/病灶计数差/病灶级 F1 四指标累计排名，最佳平均 Dice 0.61，数据经 grand-challenge 平台注册制发放

ENIGMA 联盟 TBI 工作组 12 个站点汇集的中重度颅脑创伤 T1w MRI（联盟两子组近 1,300 例池 → 实际汇集 1,100 例）+ 12 人标注团队手动 3D 病灶掩码（764 例，病灶涵盖挫伤/出血/血肿/脑软化/胶质增生/白质病变/手术引流道七类结构性损伤，二值掩码不分型） 41

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