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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 780 个数据集

生理信号心电信号评测基准医学问答与基准心血管疾病

OpenECG — 公开九中心 120 万条 12 导联心电基础模型基准

波形数据原始数据人工标注483,837 名患者（论文口径）；对应 1,233,337 条 12 导联 ECG 记录

把全部公开 12 导联 ECG 数据集统一进单一基准：1,233,337 条记录 / 483,837 患者 / 9 中心，以 SimCLR、BYOL、MAE 三种自监督方法配 ResNet-50 与 ViT 骨干，用留一数据集与数据规模缩放实验证明公开数据可匹敌专有数据

九中心公开 12 导联 ECG 数据集聚合：MIMIC-IV-ECG（800,035 记录）+ CODE-15（341,292）+ PhysioNet/CinC Challenge 2020 五子集（CPSC/Georgia/PTB/PTB-XL/INCART）+ Chapman-Shaoxing（45,152），统一重采样为 (n, 12, 1000) 并配 SNOMED CT 24 类标签 56

医学影像CT医学图像分割挑战赛数据集肿瘤学

StructSeg 2019 — 头颈部与胸部 CT 危及器官分割挑战赛数据集

CTNIfTIOrgan-at-RiskSegmentation MaskHead & NeckThorax60

MICCAI 2019 官方挑战赛 · 4 个分割任务 · 50 例训练 + 10 例测试 · 22/6 类危及器官 · NIfTI 格式

StructSeg 2019 Challenge (MICCAI) / Zhejiang Cancer Hospital url: https://structseg2019.grand-challenge.org/ 50

医学影像眼科影像图像分类青光眼评测基准医学问答与基准

ACRIMA — 青光眼视盘眼底分类基准数据集

人工标注影像数据原始数据患者级数量未披露（NR，Lancet Digital Health 综述口径）；数据集层面共 705 张图像，其中青光眼 396 张、正常 309 张

705 张视盘居中的彩色眼底照片（396 青光眼 + 309 正常），西班牙 Valencia 单中心、双专家 8 年经验标注、Topcon TRC 35° 视场，2019 年 Figshare CC BY 4.0 公开——曾自述为当时「最大的公开青光眼诊断数据库」，CNN 交叉库泛化评测的经典试炼场

西班牙 Valencia 单中心采集的视盘（optic disc）居中彩色眼底照片：Topcon TRC 眼底相机 + IMAGEnet® 采集系统，35° 视场，2048×1536 px，多数取自散瞳后的左右眼；每张配二分类标签（青光眼/正常），无分割掩码；官方 Figshare 包另附复现论文的 Python 脚本与五种 CNN 权重 50

医学影像CTMRI医学图像分割挑战赛数据集心血管疾病

MM-WHS — 多模态全心分割挑战赛 120 例 3D 心脏 CT/MRI 与七结构手工标注

人工标注影像数据原始数据120 例 3D 心脏影像（60 CT/CTA + 60 MRI）；训练集 20 CT + 20 MRI（含标注），测试集 40 CT + 40 MRI（无公开标注）

MICCAI-STACOM 2017 首届多模态全心分割挑战赛数据集：60 CT + 60 MRI 全心 3D 影像，训练集 20+20 例逐体素手工分割七类心内结构（LV/RV/LA/RA/Myo/AO/PA，官标 205-850），评测服务长期运行，衍生官方续作 CARE-Whole Heart，全心分割领域标准基准

多中心真实临床环境采集的匿名化心脏 CT/CTA（常规 cardiac CT angiography，覆盖腹上部至主动脉弓，面内约 0.78×0.78 mm、层厚约 1.60 mm）与心脏 MRI（3D b-SSFP，采集约 2 mm 重采样约 1 mm）+ 训练集七类全心亚结构逐体素手工分割（LV=500/RV=600/LA=420/RA=550/Myo=205/AO=820/PA=850） 57

医学影像MRI医学图像分割神经科学脑肿瘤肿瘤学

CFB-GBM

影像数据原始数据临床数据264 例（治疗前/后 MRI＋放疗计划纵向队列；时间点 t0 治疗前 / t1 治疗前 MRI 后 4 个月 / t2 6 个月）

法国卡昂 Centre François Baclesse 单中心 264 例胶质母细胞瘤治疗前/后 MRI 与放疗计划纵向队列——t0/t1/t2 三时间点 GTV 从 35% 补到 97%（nnU-Net+5 位放射肿瘤学家核验），附 RANO 2.0 体评分级与 PyRadiomics 特征，CC BY 4.0 于 TCIA 直链公开

TCIA 集合 cfb-gbm（https://www.cancerimagingarchive.net/collection/cfb-gbm/）：SIEMENS 1.5/3T 脑 MRI（T1Gd/T1/T1 GRE/T2/T2-FLAIR/T2*/DWI）+ 放疗 CT 与 RTDOSE 剂量分布，NIfTI 格式；附 GTV 分割、HD-BET 脑掩码、PyRadiomics 特征表、RANO 2.0 体评分级与临床/治疗/可用性 TSV 40

医学影像CTMRI医学图像分割挑战赛数据集心血管疾病

CARE 2026 — 面向真实世界医学图像的综合分析与计算

影像数据人工标注原始数据目标逾 2000 例、来自 18 个中心、跨 3 大洲；本轮新增采集 710 例（LA 回填 300 CT + Liver 190 MRI + Myocardium 200 心脏 MRI + Whol

MICCAI 2026 卫星挑战赛 CARE 2026：4 条赛道 7 个可评测子任务、逾 2000 例多中心真实世界医学影像的跨模态评测基准，覆盖左心房瘢痕/腔室、肝脏纤维化分期与分割、心肌病理、全心 7 亚结构——以 Docker 盲评覆盖 MRI 与 CT 两类模态

四个赛道数据的多中心真实世界医学影像：CARE-Left Atrium（LGE MRI 200+ 例 + CT 300 例，4 中心）、CARE-Liver（800 患者，T2WI/DWI/Gd-EOB-DTPA 动态 MRI）、CARE-Myocardium（LGE/T2/bSSFP 与 cine CMR，MyoPS+CineMyoPS）、CARE-Whole Heart（246 例 CT+MRI 混合，8 中心，7 亚结构），经官网注册获取训练/验证集、测试集 Docker 盲评 44

医学影像眼科影像医学图像分割评测基准糖尿病视网膜病变

IOSTAR — SLO 视网膜血管与视盘分割数据集

影像数据人工标注原始数据30 张 SLO 图像（1024×1024，EasyScan 相机，45° FOV）；患者数量未披露（源自 RetinaCheck 中国糖尿病筛查队列）

30 张 EasyScan 扫描激光检眼镜 1024×1024 眼底图，专家标注血管二值掩码 + 视盘 + 动静脉分离与 A/V 比——RetinaCheck 中国糖尿病筛查项目衍生的 SLO 模态血管分割基准，bob/mednet 工具链封装为 20/10 可复现划分

RetinaCheck 项目采集的 EasyScan（i-Optics，荷兰）扫描激光检眼镜视网膜图像 30 张 + 专家血管二值掩码 + 视盘标注 + 动静脉分离标注与 A/V 比；经 Idiap bob.ip.binseg / mednet 工具链封装为 20/10 划分 57

医学影像眼科影像医学图像分割图像分类挑战赛数据集青光眼

REFUGE2 — MICCAI 2020 四相机青光眼眼底挑战赛 2000 张多域数据集

影像数据人工标注原始数据2000 张彩色眼底照片（Training 1200：Zeiss 400 + Canon 800｜Online 400：KOWA｜Onsite 400：TOPCON）；患者级数量未披露，左右眼均可纳入

REFUGE1 全部 1200 张复用为训练集 + 新增 800 张 KOWA/TOPCON 图，2 相机扩为 4 相机、新增黄斑中心凹定位任务——首个多设备多任务彩色眼底青光眼基准，CC BY-NC-ND

中山大学中山眼科中心暗室采集的四相机彩色眼底照片（Zeiss Visucam 500 / Canon CR-2 / KOWA / TOPCON TRC-NW400），含青光眼分类标签、视盘/视杯逐像素掩码与黄斑中心凹坐标；7 名眼科医师初标 + 1 名资深专家复核 56

生理信号医学影像乳腺影像图像分类肿瘤学评测基准

OASBUD — 200 条乳腺病灶原始射频超声信号开源库

原始数据人工标注信号数据78 名女性患者（100 个病灶：52 恶性 + 48 良性；每病灶 2 条正交切面 = 200 条扫描/信号）

波兰科学院 IPPT 公开的乳腺病灶原始射频（RF）超声信号数据集：78 名女性、100 个病灶（52 恶性/48 良性）、每病灶 2 条正交切面共 200 条扫描，含 ROI 掩码与 BI-RADS 标签，是定量超声（QUS）与射频信号处理研究的经典小型参考库

波兰华沙肿瘤研究所（Institute of Oncology, Warsaw）78 名女性乳腺病灶的原始射频（RF）超声回波，Ultrasonix SonixTouch Research 系统 + L14-5/38 线阵探头（中心频率 10 MHz）采集，2013-11 至 2015-10；含 RF1/RF2 正交切面、ROI1/ROI2 掩码、BI-RADS 类别、良恶性二分类标签，存为单一 MATLAB 文件 OASBUD.mat（296.8 MB） 42

医学影像医学问答与基准X光影像挑战赛数据集目标检测

DENTEX — 牙科全景片异常检测基准

2,332 张标注全景牙片1,571 张无标注 X 光Zenodo 11.1 GB 下载四类异常诊断官方未披露精确患者数（3,903 张图像来自 ≥12 岁患者，随机抽取自三所医院数据库）

3,903 张全景牙片、四类异常检测，MICCAI 2023 挑战基准

DENTEX Challenge Organizing Committee url: https://dentex.grand-challenge.org/ 76

医学影像皮肤影像图像分类评测基准皮肤癌肿瘤学

DERM12345

公开数据集影像数据人工标注1,627 名患者（12,345 张图像；train 9,860 / test 2,485，按患者划分）

土耳其三机构跨 2008-2021 的 12,345 张皮肤镜图像集：5 super classes→15 main classes→40 subclasses 三级分类树，论文宣称 40 子类粒度属科学文献首次，CC BY 4.0 经 Harvard Dataverse 与 ISIC 双通道公开

土耳其三机构回顾性皮肤镜图像（Celal Bayar University Manisa / Istinye University / University of Health Sciences Haydarpasa Numune, Istanbul），MoleMax 3 / MoleMax HD / FotoFinder / 3gen DermLite DL4+iPhone 等设备，2008-2021，40 子类 + 11 项元数据 35

医学影像病理图像图像分类评测基准

BBBC051 (Human kidney cortex cells)

人工标注影像数据原始数据三口径并存：BBBC 总表口径 690,000 images（细胞）｜论文口径 ~230,000 cells 完成八类分类｜TissueMNIST 衍生口径 236,386 样本；组织来源为 3 例

Broad Bioimage Benchmark Collection 第 051 号：3 例人体肾皮质组织的 DAPI 单通道共聚焦荧光显微图像（3D 体积 / 2D 投影 / 2D 切片三形态），VTEA 半自动流水线标注 8 类肾皮质细胞类型，NephNet3D 仅凭细胞核 DAPI 特征即达 balanced accuracy 80.26%，衍生 MedMNIST 轻量基准 TissueMNIST

Broad Bioimage Benchmark Collection 官方直链 Images.zip（2.9 GB，data.broadinstitute.org/bbbc/BBBC051/）+ groundtruthlabels.txt；人肾皮质 DAPI 单通道共聚焦 z-stack（3 例 deceased donor nephrectomy 标本、50 μm 切片）+ VTEA 半自动流水线八类细胞标注 78

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