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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 770 个数据集

医学影像眼科影像医学图像分割图像分类

OIMHS — 黄斑裂孔 OCT 四结构人工分割数据集

人工标注影像数据原始数据3,859 张 OCT B-scan，来自 125 只眼 / 119 例黄斑裂孔患者（女 89 / 男 30，平均 64.1 岁）

3,859 张黄斑裂孔 OCT B-scan 的视网膜/裂孔/囊泡/脉络膜四结构人工分割——3 名初级医师 Clip Studio Paint 独立勾画 + 1 名专家复核生成 ground truth，标注者内 IoU 最高 0.957，数据集 CC0 论文 CC BY-4.0 双许可

浙江省人民医院 2017-01 至 2022-01 采集的黄斑裂孔患者视网膜 OCT B-scan（384×496 / 512×496 / 768×496 三种分辨率）+ 三类解剖结构的像素级人工分割掩码（retina / MH / IRC / choroid，Clip Studio Paint 勾画）+ 患者年龄/性别/MH 分级文本 56

医学影像眼科影像医学图像分割青光眼

485 幅统一版青光眼眼底图像与视盘视杯分割金标准

拉拉古纳大学（University of La Laguna）与圣克鲁斯-德特内里费大学医院（HUC） url: https://github.com/miag-ull/rim-one-dl 71

医学影像CT多模态影像-文本对齐挑战赛数据集评测基准

VLM3D 2025

人工标注影像数据原始数据训练/验证 21,304 位独立患者（25,692 个 study / 50,188 个 volume / 超 1,430 万张 slice）；评测集 2,000 例内部 + 1,024 例波士顿大学

MICCAI 2025 官方注册的 3D 医学影像视觉语言建模挑战赛——基于 CT-RATE 25,692 例胸部 CT 与配对放射学报告，设 CT 报告生成、多异常分类、自监督多异常定位、文本条件 3D CT 生成四大任务，Docker 容器服务端评测封闭测试集，冠军方法发表于 ICCV 2025 Workshop，2026 届扩展 MR-RATE 脑 MRI 赛道

CT-RATE 非增强胸部 CT（土耳其伊斯坦布尔梅迪波尔医院单中心，3 家厂商扫描仪，年龄 18-102 岁，性别均衡）+ 放射科医生撰写的 impression/findings 配对报告 + 微调 RadBERT 从报告自动抽取的 18 种胸部异常多标签 67

医学影像MRI医学图像分割脑影像挑战赛数据集儿科

BONBID-HIE 2024

ADC 图Z-ADC 图病灶分割掩膜NICU 结局Bayley-III 结局脑图谱237

第二届波士顿新生儿脑损伤数据集挑战赛：新生儿缺氧缺血性脑病病灶分割与神经发育结局预测

Zenodo（BONBID-HIE 2024 官方发布） url: https://zenodo.org/records/10978874 44

医学影像MRI医学图像分割心血管疾病挑战赛数据集

CMRxMotion 呼吸运动极端心脏MRI挑战数据集

人工标注影像数据原始数据40 例健康志愿者（24 男/16 女，19-48 岁）共 320 个 cine 影像 volume：训练 20 人 160 / 验证 5 人 40 / 测试 15 人 120（志愿者不跨集）

MICCAI 2022 STACOM 官方挑战：40 名志愿者 320 例 cine、同机 3T 单变量压力测试、4 种呼吸协议三级伪影、双任务质量评估+鲁棒分割，nnU-Net 主导，并列冠军 UA-SVCC 与 Med-Air，22 套算法全开源

复旦大学张江国际脑影像中心 Siemens MAGNETOM Vida 3T 前瞻采集（TrueFISP bSSFP cine 短轴，ED/ES 两时相，2.0×2.0 mm² 面内分辨率/8 mm 层厚/4 mm 层间隔）；40 名志愿者 × 4 种呼吸协议；LV/RV/MYO 三结构 NIfTI 标注 + 三级图像质量标签 44

医疗NLP医学影像多模态病理图像影像-文本对齐挑战赛数据集

REG²

人工标注原始数据影像数据文本数据~12,000 训练例（官网 'about 12K' 口径，官网与 AWS 均注明挑战期内确切数可变）+Test1 350+Test2 70——6 机构 5 国

第二届病理报告生成挑战赛——H&E 全切片→结构化报告+显式诊断推理链、~12K 例 7 器官 6 机构、Qwen3-8B 裁判评分、CC BY-NC-SA、S3 公开下载

多机构 H&E 染色 WSI（TIFF，20x，匿名化）+CAP 协议结构化病理报告+思维链 CoT 问答标注+Metric B ROI 标注（tissue/background 与 original/perturbed 配对） 65

医学影像乳腺影像医学图像分割图像分类乳腺癌肿瘤学

UDIAT — 乳腺 B 型超声病灶检测与良恶性分类数据集

超声B-mode2D静态图像分割掩码二分类标签PNG163

UDIAT Breast Ultrasound Dataset B：西班牙 Parc Taulí 的 163 张专家描边乳腺超声图像

UDIAT Breast Ultrasound Dataset B（Yap et al., IEEE JBHI 2017；MMU 官方请求制入口） url: http://www2.docm.mmu.ac.uk/STAFF/m.yap/dataset.php 70

医学影像目标检测挑战赛数据集评测基准

3DTeethLand

人工标注专家验证影像数据原始数据340 例口内 3D 扫描（240 训练 + 100 私有测试）；上游底座 Teeth3DS 为 1800 例扫描 / 900 名患者（上下颌分开采集，患者以 uuid 匿名）

3DTeethLand: 3D Teeth Landmarks Detection Challenge——MICCAI 2024 旗下首个公开的口内 3D 扫描牙齿标志点检测挑战赛数据集：340 例（240 训练+100 私有测试）、6 类解剖标志点、49 队注册 6 队决赛，Radboud 两阶段方案 mAP 0.78 夺冠；数据本体经 Synapse 注册制发放，Zenodo 仅存任务说明书（CC BY-4.0）

上游 Teeth3DS 数据集（1800 例口内 3D 扫描，OBJ 网格 + 逐顶点牙齿分割标签）派生的 340 例标注子集；挑战赛发放 STL 网格；标注含逐牙 6 类标志点坐标（单 JSON 文件）与牙齿分割标签；训练 240 例全标注，测试 100 例标签保密 33

医学影像MRI脑影像挑战赛数据集评测基准

ULF-EnC 2025

影像数据原始数据人工采集75 例（50 训练 + 10 验证 + 15 测试；每例为单个健康参与者的配对 64mT+3T 扫描）

MICCAI 2025 首届超低场 MRI 图像增强挑战赛——75 例配对 64mT/3T 脑 MRI（T1/T2/FLAIR），Hyperfine Swoop 便携设备到 Siemens 3T 的跨场强图像翻译，官方评分 SSIM 加权 70%，18 队 26 份提交，LNCS 16293 论文集收录 19 篇

Monash Biomedical Imaging 配对采集：Hyperfine Swoop 64mT 便携 MRI 与 Siemens 3T 脑 MRI 各 T1/T2/FLAIR 三序列，co-registered，统一面部去除掩码；Synapse（syn65485242）注册制分发 62