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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 759 个数据集

基因组学与多组学药物发现与化学蛋白质组学分子对接

52 万 DICOM 影像 · 20.6 万次超声检查 · 可关联 MIMIC-IV 全院 EHR

MIT Laboratory for Computational Physiology / PhysioNet（BIDMC 采集） url: https://physionet.org/content/mimic-iv-echo/1.0.1/ 32

基因组学与多组学变异与注释知识图谱生物医学文献

Sequence Ontology — 基因组注释的序列本体受控词表

ontologycontrolled-vocabularygenome-annotationgff3owlobosequence-featurevariant不适用（本体/受控词表，无患者数据）

约 2,752 个类、50 个对象属性的开放本体，是 GFF3 规范与 Chado 数据库的术语底座

Sequence Ontology（官网 http://www.sequenceontology.org/ 与 OBO Foundry 条目 obofoundry.org/ontology/so.html） url: http://www.sequenceontology.org/ 29

医学影像基因组学与多组学MRIX光影像脑肿瘤

REMBRANDT — 胶质瘤影像与基因组配对数据集

110,020 张 MR 图像130 例 MRI 患者671 例基因组临床患者10.59 GB DICOM874 例分子标本受控影像+公开组学130 例（MRI）；671 例（基因组/临床）

130 例胶质瘤 MRI 配对 671 例基因组临床数据的放射组学奠基数据集

National Cancer Institute（现由 Georgetown University ICBI 与 TCIA 托管） url: https://www.cancerimagingarchive.net/?p=43429 66

睡眠信号临床电子病历队列研究儿科生理信号电子健康记录

NCH Sleep DataBank — 全美儿童医院儿科睡眠 PSG 与 560 万条纵向 EHR

3984 份儿科 PSG3673 名唯一患者560 万条 EHR 记录2017–2019资质访问Natus Sleepworks3673 名唯一儿科患者（3984 份 PSG 睡眠研究）

3984 份儿科多导睡眠图研究、3673 名唯一患者，2017–2019 年真实临床采集，附 560 万条纵向临床数据

Nationwide Children's Hospital（全美儿童医院）Abigail Wexner Research Institute url: https://physionet.org/content/nch-sleep/ 39

生理信号语音信号COVID-19

COUGHVID — 全球最大众包咳嗽音数据集

超过 30,000 条咳嗽录音（v3）约 2.3 GB ZIP4 位医师标注 2,800+ 条125 个国家地区CC BY 4.0 开放下载超过 25,000 条录音提交（Sci Data 论文口径），Zenodo v3 累计超过 30,000 条

超过 25,000 条众包咳嗽录音，4 位医师标注 2,800+ 条专家子集

EPFL Embedded Systems Laboratory (ESL) url: https://zenodo.org/records/7024894 92

医学影像医学问答与基准内窥镜影像医学图像分割评测基准

CVC-ColonDB — 结肠镜息肉分割经典基准

380 帧结肠镜图像15 段检查序列574×500 像素像素级二值息肉 mask原始版含 1,706 个文件（4 组）研究用途免费获取15 例结肠镜检查（各文献记载 13–15 例不一）

380 帧专家标注结肠镜息肉分割图像，源自 15 段检查序列的单中心经典基准

Computer Vision Center, Universitat Autònoma de Barcelona（CVC-UAB） url: http://mv.cvc.uab.es/projects/colon-qa/cvc-colondb 99

医学影像手术视频医学图像分割

AutoImplant — 颅骨植入体自动设计挑战

630 个 NRRD 文件（2020 届）570+100 个三元组（2021 届 SkullBreak）512×512×Z 二值体素CC BY-NC-SA 4.0 免费获取非患者队列：合成数据共 344 个颅骨（2020 届 210 + 2021 届 134），不含人口学信息

CQ500 合成颅骨缺损基准：210 颅骨 + 670 三元组，MICCAI 两届挑战

Graz University of Technology (TU Graz) — Institute of Computer Graphics and Vision url: https://autoimplant.grand-challenge.org/ 45

医学影像病理图像医学图像分割肿瘤学

CryoNuSeg — 冷冻切片 H&E 核实例分割数据集

10 器官 30 张 512×512 patch三套标注 7,596/8,044/8,251 核Kaggle V7 416.43 MBMIT 许可开放下载官方 10 折器官外推协议30 张冷冻切片 WSI 均来自不同 TCGA 患者（每器官 3 张、不同患者与组织中心）

首个全手工标注冷冻切片核分割数据集：10 器官 30 张 512×512 patch · 三套独立标注 7,596/8,044/8,251 核 · 官方 10 折器官外推基准 Dice 80.3%

Medical University of Vienna / Loughborough University / TissueGnostics GmbH（CryoNuSeg 官方，Kaggle ipateam 团队发布） url: https://www.kaggle.com/ipateam/segmentation-of-nuclei-in-cryosectioned-he-images 36

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