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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 759 个数据集

医学影像病理图像乳腺癌医学图像分割肿瘤学

BCSS — 乳腺癌语义分割数据集

151 张 H&E 全切片20,000+ 区域标注22 类像素级编码CC0 1.0 开放获取TCGA 三阴性乳腺癌151 名乳腺癌患者（每例 1 张全切片）

151 张 TCGA 乳腺癌 WSI · 20,000+ 区域标注 · 22 类语义分割基准

埃默里大学医学院（Emory University School of Medicine） url: https://bcsegmentation.grand-challenge.org/ 72

生理信号电子健康记录睡眠信号队列研究

SHHS — 睡眠心脏健康研究队列

356 GB 全库93.6 MB 开放子集6,441 例入组3,295 例二次 PSG1995-2011 年随访Compumedics 家庭 PSG需 NSRR 注册 + DUA6,441 名入组成人（NSRR 可共享 5,804）

家庭便携 PSG + 心血管随访 · 6,441 例 · NSRR 托管的睡眠呼吸金标准

Sleep Heart Health Study Research Group / National Sleep Research Resource url: https://sleepdata.org/datasets/shhs 86

医学影像基因组学与多组学CT肺癌

NSCLC-Radiogenomics — 肺癌影像基因组学

约 98 GB DICOM 影像211 例 NSCLC 患者144 例肿瘤分割掩膜130 例 RNA-seqCC BY 3.0 开放下载211 例 NSCLC 患者

211 例 NSCLC 的 CT/PET-基因组-临床多模态配对数据集

The Cancer Imaging Archive（TCIA）／斯坦福大学医学院 url: https://www.cancerimagingarchive.net/collection/nsclc-radiogenomics/ 90

医学影像病理图像乳腺癌肿瘤学

NuCLS — 乳腺癌病理核分类数据集

222,396 条核标注125 张 TCGA H&E WSI13/7/4 三级核分类CC0 1.0 开放获取官方五折划分125 名患者（每人 1 张 TCGA H&E 全切片）

TCGA 222,396 条核标注 · 三级分类 · CC0 开放

Northwestern University Department of Pathology（NuCLS 研究团队） url: https://sites.google.com/view/nucls/home 76

医学影像CT肺癌

NSCLC-Radiomics — 肺癌影像组学队列

422 名患者52,073 张 CT 切片35.78 GB DICOM7 项临床字段CC BY-NC 3.0 开放下载422 名 NSCLC 患者

422 例 NSCLC 患者的 CT 影像组学与生存随访金标准队列

MAASTRO Clinic / The Cancer Imaging Archive (TCIA) url: https://www.cancerimagingarchive.net/collection/nsclc-radiomics/ 67

医学影像乳腺癌图像分类挑战赛数据集病理图像

BreastPathQ — 乳腺癌细胞增殖定量挑战

3,698 patch96 WSI55 名 NAT 后患者H&E 20X 扫描0-1 连续 TC 标签需申请下载55 名乳腺癌新辅助治疗后患者（NAT 后残余病变）

新辅助治疗后乳腺癌 H&E patch 肿瘤细胞占比回归 · 3,698 patch · 55 患者

SPIE BreastPathQ Grand Challenge（官方组织方） url: https://breastpathq.grand-challenge.org/ 72

医学影像电子健康记录临床电子病历皮肤影像

PAD-UFES-20 — 智能手机皮肤癌筛查数据集

2,298 张临床照片1,373 名患者6 类诊断3.35 GB PNG+CSVCC BY 4.0 开放1,373 名患者

2,298 张智能手机临床照片 + 1,373 名患者临床特征，6 类皮肤病变多模态基准

Universidade Federal do Espírito Santo (UFES) — LABCIN & PAD url: https://data.mendeley.com/datasets/zr7vgbcyr2 82

公共卫生与流行病学神经科学转录组

Allen Brain Atlas — 多模态脑图谱

约 20,000 个基因 ISH3,702 个人脑微阵列样本非商业免费须引用非患者队列（脑组织转录组/连接组研究图谱）

全脑基因表达+连接组+细胞类型多模态公共图谱

Allen Institute for Brain Science url: https://portal.brain-map.org/ 65

医学影像手术视频内窥镜影像医学图像分割结直肠癌

HeiCo — 结直肠腹腔镜手术器械分割

30 段结直肠腹腔镜视频14 类手术相位10,040 帧实例分割掩码CC BY-NC-SASynapse 申请获取30 例结直肠腹腔镜手术视频

30 段结直肠腹腔镜视频 + 14 相位 + >10,000 帧实例分割标注

DKFZ / Heidelberg University Hospital url: https://link.springer.com/article/10.1038/s41597-021-00882-2 71

药物发现与化学虚拟筛选肿瘤学

PRISM — 池化条码肿瘤细胞系药敏数据集

4,518 化合物 × 578 细胞系非患者细胞系数据CSV 免费下载DepMap 持续更新非患者数据，细胞系药敏数据

分子条码池化测活 · 4,518 化合物 × 578 细胞系 · 药物重定位

Broad Institute — Cancer Dependency Map (DepMap) url: https://depmap.org/repurposing/ 84

电子健康记录多模态时序数据重症监护

MIMIC-IV 全球规模最大的重症监护公开数据集 · 36.4 万患者 EHR

约 7GB（CSV）约 450GB（含影像）36.4 万名患者

MIT 计算生理学实验室 & 贝斯以色列女执事医疗中心 288

医学影像药物发现与化学病理图像虚拟筛选评测基准

BBBC — Broad Bioimage Benchmark Collection 显微图像分析基准集

TIFFPNG荧光明场DICCC0 为主CellProfiler 兼容细胞/显微结构图像

Broad Institute Imaging Platform (Anne Carpenter Lab) 128

定制数据集服务

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