皮肤T细胞淋巴瘤综合基因组数据资源
这是一个整合了139例皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL)病例的基因组数据集,包含基因突变和拷贝数变异两种模态的分子数据,主要用于研究CTCL的驱动突变、关键通路(如NFkB和p53)的互斥性模式以及突变负荷与临床预后的关联,为肿瘤基因组学和精准医疗提供重要数据支持。
基本信息
资源简介
该数据集是一个专门整合了多个皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL)队列的综合基因组数据资源,旨在为CTCL的疾病驱动突变识别和基因组分类研究提供支持。数据集包含139例CTCL病例的匹配基因组突变和拷贝数变异数据,这些数据来源于已发表的多项测序研究。通过对该数据集的分析,研究者可以探索NFkB通路基因(如PLCG1、CARD11、TNFRSF1B)与p53基因突变之间的互斥性,以及突变负荷与患者生存率之间的关系。该资源主要应用于肿瘤基因组学、癌症通路分析和精准医学研究领域。
下载信息
注册下载
Tips: 该数据集需要在对应的数据源网站注册通过后,才能进行数据下载,注册有对应要求,或者需要收费。
暂未开放公开下载
Tips: 该数据集属于公开下载,应该可以免费公开下载。
暂未开放有偿下载
Tips: 该数据集 Qianfanghub 可以协助提供有偿下载服务,注意,服务不针对数据相关产权,只是技术服务费。
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使用方式
数据集获取
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是一个专门整合了多个皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL)队列的综合基因组数据资源,旨在为CTCL的疾病驱动突变识别和基因组分类研究提供支持。数据集包含139例CTCL病例的匹配基因组突变和拷贝数变异数据,这些数据来源于已发表的多项测序研究。通过对该数据集的分析,研究者可以探索NFkB通路基因(如PLCG1、CARD11、TNFRSF1B)与p53基因突变之间的互斥性,以及突变负荷与患者生存率之间的关系。该资源主要应用于肿瘤基因组学、癌症通路分析和精准医学研究领域。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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