皮肤T细胞淋巴瘤综合基因组数据资源

这是一个整合了139例皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL)病例的基因组数据集,包含基因突变和拷贝数变异两种模态的分子数据,主要用于研究CTCL的驱动突变、关键通路(如NFkB和p53)的互斥性模式以及突变负荷与临床预后的关联,为肿瘤基因组学和精准医疗提供重要数据支持。

DataONE
2020-06-24 更新
浏览 9
皮肤T细胞淋巴瘤基因组学癌症突变互斥性分析

基本信息

创建/更新时间
2020-06-24

资源简介

该数据集是一个专门整合了多个皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL)队列的综合基因组数据资源,旨在为CTCL的疾病驱动突变识别和基因组分类研究提供支持。数据集包含139例CTCL病例的匹配基因组突变和拷贝数变异数据,这些数据来源于已发表的多项测序研究。通过对该数据集的分析,研究者可以探索NFkB通路基因(如PLCG1、CARD11、TNFRSF1B)与p53基因突变之间的互斥性,以及突变负荷与患者生存率之间的关系。该资源主要应用于肿瘤基因组学、癌症通路分析和精准医学研究领域。

原始链接

https://search.dataone.org/view/sha256:f7aa0c14ffe3d8eddc74d851fb86a4cf48a0011cf1e49257f39edfbc7d1be3f3

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源站:https://search.dataone.org/view/sha256:f7aa0c14ffe3d8eddc74d851fb86a4cf48a0011cf1e49257f39edfbc7d1be3f3

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    • OpenDataLab: pip install openxlabopenxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscopemodelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集是一个专门整合了多个皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL)队列的综合基因组数据资源,旨在为CTCL的疾病驱动突变识别和基因组分类研究提供支持。数据集包含139例CTCL病例的匹配基因组突变和拷贝数变异数据,这些数据来源于已发表的多项测序研究。通过对该数据集的分析,研究者可以探索NFkB通路基因(如PLCG1、CARD11、TNFRSF1B)与p53基因突变之间的互斥性,以及突变负荷与患者生存率之间的关系。该资源主要应用于肿瘤基因组学、癌症通路分析和精准医学研究领域。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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