皮肤T细胞淋巴瘤基因组分析综合数据集
该数据集整合了139例皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL)病例的基因组突变和拷贝数变异数据,属于基因组模态的临床研究资源,主要用于分析NFkB通路基因与p53等关键基因的突变互斥性、探索突变负荷与患者生存的关系,支持癌症基因组学、生物信息学及精准医疗领域的研究。

基本信息
资源简介
皮肤T细胞淋巴瘤基因组分析综合数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《An integrated data resource for genomic analysis of cutaneous T-cell lymphoma》。
【数据内容】
源站原始描述:Recently, several groups have conducted sequencing studies of cutaneous T-cell lymphoma (CTCL) in order to identify disease driving mutations. An integrated genomic dataset that combines multiple cohorts may facilitate more comprehensive studies of disease pathways and genomic classification of CTCL, but currently no such resource is available. In this study we compiled and analyzed one such dataset that included matched genomic mutations and copy number alterations of 139 CTCL cases. Using this…
【主题与分类】
主题标签:Cutaneous lymphoma。
【获取与许可】
源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256:f7aa0c14ffe3d8eddc74d851fb86a4cf48a0011cf1e49257f39edfbc7d1be3f3
下载信息
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使用方式
数据集获取
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是一个专为皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL)基因组分析而构建的综合数据资源。它整合了来自多个队列的测序数据,包含了139例CTCL病例的匹配基因组突变和拷贝数变异信息。数据集通过整合现有研究构建而成,旨在为更全面研究疾病通路和CTCL的基因组分类提供支持。主要研究方向包括分析NFkB通路基因(如PLCG1、CARD11、TNFRSF1B)与p53等关键基因的突变互斥性,以及探索突变负荷等参数与患者生存率的关系,适用于癌症基因组学、生物信息学和精准医疗领域的研究。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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