皮肤T细胞淋巴瘤基因组分析综合数据资源

该数据集是一个整合了139例皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL)病例的基因组数据资源,包含匹配的基因突变和拷贝数变异等分子数据,数据模态主要为基因组测序数据。其主要用途是支持对CTCL致病通路(如NFkB和p53通路)的深入研究,分析突变模式与临床预后的关联,并探索基于基因组特征的疾病分类方法,为开发针对特定突变的个性化治疗策略提供数据基础。

Mendeley Data
2024-06-25 更新
浏览 38
Cutaneous lymphoma
Data from: An integrated data resource for genomic analysis of cutaneous T-cell lymphoma

基本信息

大小
0.023728013 GB
许可
https://spdx.org/licenses/CC0-1.0.html
创建/更新时间
2024-06-25

资源简介

皮肤T细胞淋巴瘤基因组分析综合数据资源

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Data from: An integrated data resource for genomic analysis of cutaneous T-cell lymphoma》。

【数据内容】

源站原始描述:Recently, several groups have conducted sequencing studies of cutaneous T-cell lymphoma (CTCL) in order to identify disease driving mutations. An integrated genomic dataset that combines multiple cohorts may facilitate more comprehensive studies of disease pathways and genomic classification of CTCL, but currently no such resource is available. In this study we compiled and analyzed one such dataset that included matched genomic mutations and copy number alterations of 139 CTCL cases. Using this…

【数据结构与技术规格】

数据集 DOI:doi:10.5061/dryad.97c7v3k。

【主题与分类】

主题标签:Cutaneous lymphoma。

【获取与许可】

源站页面:https://doi.org/10.5061/dryad.97c7v3k

使用许可:https://spdx.org/licenses/CC0-1.0.html。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集是一个专门针对皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL)的综合性基因组分析资源。它整合了来自多个队列研究的139例CTCL病例的匹配基因组突变数据和拷贝数变异数据。数据集的构建旨在为更全面的疾病通路研究和CTCL的基因组分类提供支持。通过该数据集,研究人员可以分析关键基因通路(如NFkB通路和p53通路)中突变的互斥性,探索突变负荷与患者总体生存期的关系,并研究基于潜在致病通路的CTCL分类方法。该资源的主要研究方向包括CTCL的致病机制解析、基因组驱动的疾病分类以及个性化治疗靶点的发现。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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