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Parse Evercode v3 单细胞分析中环状向导RNA捕获评估(人诱导多能干细胞与K562混合)

Parse Evercode v3 单细胞分析中环状向导RNA捕获评估(人诱导多能干细胞与K562混合)

基因组预测GPL373099606

该数据集来自NCBI GEO,评估环状向导RNA捕获在Parse Evercode WT v3单细胞分析中的兼容性。实验将分别固定的人诱导多能干细胞与携带不同混合向导文库的K562细胞混合后进行细胞条形码标记,并采用CS1、DC1、两种向导特异性引物或无向导特异性引物进行第一轮逆转录

分类其他 / 其他
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SWI/SNF染色质重塑复合物缺失后的多组学分析:ARID1A CUT&RUN

SWI/SNF染色质重塑复合物缺失后的多组学分析:ARID1A CUT&RUN

基因组预测GPL342819606

数据针对SWI/SNF染色质重塑复合物功能缺失后的多组学变化,聚焦ARID1A的基因组结合/占据谱,采用高通量测序技术,物种为人类(9606),平台为GPL34281

分类肿瘤 / 其他
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SWI/SNF染色质重塑复合物缺失后的多组学分析[SWISNF ATAC-seq]

SWI/SNF染色质重塑复合物缺失后的多组学分析[SWISNF ATAC-seq]

基因组分类GPL342819606

该数据集来自NCBI GEO,标题为GSE347884,聚焦SWI/SNF染色质重塑复合物功能缺失后的多组学变化,包含ATAC-seq数据

分类肿瘤 / 其他
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乳腺肿瘤微环境细胞与血管多分辨率空间转录组图谱 [10x Visium]

乳腺肿瘤微环境细胞与血管多分辨率空间转录组图谱 [10x Visium]

时间序列分类OtherGPL246769606

该数据集来自 NCBI GEO,包含 40 个 10x Genomics Visium 切片(32 个肿瘤的 33 个肿瘤切片,其中 1 个肿瘤重复取样,另加 7 个匹配的非累及淋巴结)、4 个肿瘤的 Visium HD 数据以及 6 个肿瘤的 Xenium 数据

分类肿瘤 / 其他
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乳腺肿瘤微环境细胞与血管多分辨率空间转录组图谱

乳腺肿瘤微环境细胞与血管多分辨率空间转录组图谱

基因组OtherGPL246769606

数据聚焦乳腺肿瘤微环境的细胞与血管组成,采用多分辨率空间转录组技术构建图谱。该数据可用于研究乳腺肿瘤微环境的空间组织特征、细胞与血管分布及相关转录组分析(来源 NCBI)

分类肿瘤 / 其他
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人iPSC来源内皮与血管平滑肌细胞基因表达全局及遗传调控数据集 [Micro-C]

人iPSC来源内皮与血管平滑肌细胞基因表达全局及遗传调控数据集 [Micro-C]

基因组OtherGPL246769606

该数据集来自 NCBI GEO(GSE283786),聚焦人诱导多能干细胞(hiPSC)来源的同源内皮细胞(iECs)与血管平滑肌细胞(iVSMCs),整合 Micro-C 染色质构象、RRBS DNA 甲基化、ATAC-seq 染色质可及性与 RNA-seq 转录组数据,并通过敲低 CTCF 与

分类其他 / 其他
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人iPSC来源内皮与血管平滑肌细胞基因表达的全局与遗传调控[RNA-seq]

人iPSC来源内皮与血管平滑肌细胞基因表达的全局与遗传调控[RNA-seq]

基因组预测GPL246769606

该数据集来自NCBI GEO,包含人诱导多能干细胞(hiPSC)来源的同源内皮细胞(iECs)和血管平滑肌细胞(iVSMCs)的转录组RNA-seq数据

分类其他 / 其他
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人iPSC来源内皮与血管平滑肌细胞基因表达全局及遗传调控数据集[ATAC-seq]

人iPSC来源内皮与血管平滑肌细胞基因表达全局及遗传调控数据集[ATAC-seq]

基因组预测GPL246769606

该数据集来自NCBI GEO,包含人诱导多能干细胞来源的等基因内皮细胞(iECs)和血管平滑肌细胞(iVSMCs)的ATAC-seq数据,用于分析染色质可及性

分类其他 / 其他
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难治或复发性膜性肾病患者免疫细胞mRNA与开放染色质图谱及肾小球转录组揭示B细胞CD83病理生理作用

难治或复发性膜性肾病患者免疫细胞mRNA与开放染色质图谱及肾小球转录组揭示B细胞CD83病理生理作用

基因组分类GPL246769606

该数据集来自NCBI GEO,包含难治或复发性抗PLA2R抗体阳性原发性膜性肾病患者外周免疫细胞的单核RNA测序与ATAC测序(多组学分析)数据,以及肾小球转录组数据,共1个文件

分类泌尿生殖系统疾病 / 其他
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GSE327881:大肠杆菌对亚致死浓度工程化内溶素LNT113的生理响应

GSE327881:大肠杆菌对亚致死浓度工程化内溶素LNT113的生理响应

基因组分类GPL18133562

该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件(GSE327881_series_matrix.txt.gz),记录大肠杆菌在亚致死浓度工程化内溶素LNT113暴露下的生理与转录组响应

分类内分泌系统疾病 / 其他
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高突变子宫内膜癌增殖-侵袭二分性与lncRNA及UPS网络表型转换数据集

高突变子宫内膜癌增殖-侵袭二分性与lncRNA及UPS网络表型转换数据集

基因组分类GPL342849606

该数据集来自NCBI GEO,包含高突变子宫内膜癌转录组表达谱数据,聚焦增殖-侵袭二分性表型转换及lncRNA与泛素-蛋白酶体系统(UPS)网络的耦合机制

分类肿瘤 / 其他
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人iPSC来源内皮与血管平滑肌细胞基因表达全局及遗传调控数据集[BiSulfite-seq]

人iPSC来源内皮与血管平滑肌细胞基因表达全局及遗传调控数据集[BiSulfite-seq]

基因组回归GPL246769606

该数据集来自NCBI GEO,包含人诱导多能干细胞(hiPSC)来源的同基因内皮细胞(iECs)和血管平滑肌细胞(iVSMCs)的亚硫酸氢盐测序(BiSulfite-seq/RRBS)DNA甲基化数据

分类其他 / 其他
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