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整合多组学分析识别慢性阻塞性肺疾病异质性主要轴线并揭示其分子贡献者 - ECLIPSE 复制队列
该数据集来自 omicsdi.org,为慢性阻塞性肺疾病(COPD)异质性研究中的 ECLIPSE 复制队列,属于呼吸系统疾病范畴

DISARM 研究:吸入性糖皮质激素对 COPD 支气管上皮细胞基因表达的影响
本数据集来自 DISARM 研究,包含支气管刷检样本的 RNA-seq 数据。研究将受试者随机分配接受 12 周 LABA 单药或 LABA/ICS 联合治疗,并在治疗前后进行支气管镜检查,采集支气管肺泡灌洗液与第 6-8 代支气管刷检样本

COPD 全基因组测序血液与肺刷检样本数据集
该数据集包含 27 个全基因组测序文件(BAM),覆盖 12 个个体,其中 4 人患有 COPD。9 个个体同时具有来自血液和单一部位肺刷检的测序数据,另有 3 个个体还额外提供第二个部位的肺刷检测序文件

COPD 外周血与支气管肺泡中性粒细胞单细胞转录组样本
该数据集来自 omicsdi.org,聚焦慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者外周免疫细胞的分子变化。研究结合多色流式细胞术与单细胞 RNA 测序,发现 COPD 患者血液中性粒细胞数量显著增加且呈异质性,其中表达干扰素反应基因的转录组状态与肺泡损伤和急性加重相关,支气管肺泡中性粒细胞也表达与部分血液中

Seq-Well与10x Genomics来源的COPD与对照样本FASTQ数据集
该数据集由来自10名对照供体和10名COPD GOLD2患者的Seq-Well及部分Chromium(10x Genomics)文库的FASTQ文件组成,属于呼吸系统疾病领域的基因组学数据

单核细胞数据集样本
该数据集来自 omicsdi.org,包含对受试者(COPD 患者或表面健康的对照者)进行支气管镜检查、并用 5 mm 刷子对右肺亚段气道采样所获得的样本

整合多组学分析识别慢性阻塞性肺疾病异质性主要轴线及其分子贡献者 - ECLIPSE 复制队列
该数据集来自 omicsdi.org,属于呼吸系统疾病 / 其他分类,主题标签为 Transcriptomics。其源站描述介绍了一种基于变异自编码器的亚型划分流程,将临床数据与基因表达数据联合嵌入到单个受试者层面的表示中,并在 COPDGene 研究中评估该框架

COPD外周免疫细胞单细胞转录组与流式细胞术样本数据集
该数据集来自omicsdi.org,聚焦慢性阻塞性肺疾病(COPD)外周免疫细胞的分子变化。数据结合多色流式细胞术与单细胞RNA测序,覆盖COPD患者血液中性粒细胞数量增多及异质性、干扰素反应基因转录状态与肺泡损伤和急性加重的关联、支气管肺泡中性粒细胞基因特征,以及香烟烟雾暴露小鼠模型中骨髓中性粒细

应用文本挖掘构建基于AOP的黏液高分泌基因集并用体外与临床样本验证
该数据集来自 omicsdi.org,属于呼吸系统疾病及其他类别,主题为转录组学。其目的是通过文本挖掘方法构建黏液高分泌与黏液纤毛功能障碍的 adverse outcome pathways(AOPs)基因集,并利用公共数据库数据及内部生成的体外模型 RNA-seq 数据进行验证

戒烟者伴与不伴COPD的AT2细胞RNA-seq样本数据
该数据集为来自戒烟者的FACS分选AT2细胞的RNA-seq样本数据,包含伴有COPD(n=6)和不伴COPD(n=3)的不同疾病阶段样本,提供Fastq文件

肺气肿与健康中异质性肺泡II型细胞的高分辨率分析揭示受损肺泡再生的气道起源
该数据集来自omicsdi.org,为单细胞RNA测序数据,覆盖肺气肿患者与健康对照的富集上皮细胞。研究对78,699个ATII细胞进行高分辨率分析,在重度肺气肿与健康组织中揭示新的ATII细胞亚群,包括COPD中表达多种secretoglobin mRNA的SCGBpos亚簇,其转录组谱与健康亚簇

肺气肿与健康中异质性肺泡II型细胞的高分辨率分析揭示受损肺泡再生的气道来源
该数据集来自omicsdi.org,为单细胞RNA测序数据,覆盖COPD患者肺气肿实质肺组织与健康对照的富集上皮细胞,包含78,699个ATII细胞的高分辨率分析,并揭示重度肺气肿与健康中的新型ATII细胞亚群,包括COPD中表达多种secretoglobin mRNA的两个SCGBpos亚簇
