整合多组学分析识别慢性阻塞性肺疾病异质性主要轴线并揭示其分子贡献者 - ECLIPSE 复制队列

该数据集来自 omicsdi.org,为慢性阻塞性肺疾病(COPD)异质性研究中的 ECLIPSE 复制队列,属于呼吸系统疾病范畴

omicsdi
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基因组分类Genomics
Integrative multi-omic analyses identify major axes of heterogeneity in chronic obstructive pulmonary disease and uncover their molecular contributors - ECLIPSE replication cohort

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-12

资源简介

整合多组学分析识别慢性阻塞性肺疾病异质性主要轴线并揭示其分子贡献者 - ECLIPSE 复制队列

该数据集英文名称为 Integrative multi-omic analyses identify major axes of heterogeneity in chronic obstructive pulmonary disease and uncover their molecular contributors - ECLIPSE replication cohort,来源于 omicsdi.org,主题标签为 Genomics,本站分类归入呼吸系统疾病 / 其他。从名称与来源信息看,该数据集对应慢性阻塞性肺疾病(COPD)异质性研究中的 ECLIPSE 复制队列,属于呼吸系统疾病相关数据资源。其核心定位是围绕 COPD 异质性开展的多组学整合分析,并用于识别该疾病的主要异质性轴及其分子贡献因素。ECLIPSE 复制队列的命名表明,该数据在整体研究设计中承担复制或验证角色,用于对发现队列中得到的多组学关联结果进行独立队列层面的检验。数据集本身以英文名称和来源站描述为主要标识,未提供更多关于样本量、组学层次、分子类型或临床变量的具体说明。

【数据集背景】

慢性阻塞性肺疾病是一种具有显著异质性的呼吸系统疾病,不同患者在临床表现、疾病进展和治疗反应等方面可能存在差异。为解析这种异质性,研究者常采用多组学整合分析策略,从基因组、转录组、蛋白组或代谢组等多个层面寻找与疾病亚型或异质性轴相关的分子特征。该数据集正是这一研究背景下的产物,其名称明确指出研究目标是识别 COPD 的主要异质性轴并揭示其分子贡献因素。ECLIPSE 复制队列作为该研究的一部分,用于在独立样本中验证发现阶段的结果,从而增强研究结论的稳健性。该数据集被归入呼吸系统疾病 / 其他类别,主题标签为 Genomics,说明其内容与基因组学密切相关,并服务于呼吸系统疾病研究。

【数据内容】

该数据集的具体数据内容,包括所含组学类型、样本数量、分子特征数量、临床变量、数据文件格式及目录结构等,源站未提供。根据其名称可以确认,该数据集与多组学整合分析相关,且聚焦于 COPD 异质性轴及其分子贡献因素,但除名称和主题标签外,未给出可进一步描述的数据内容细节。

【采集与来源】

该数据集来源于 omicsdi.org。源站描述与数据集英文名称一致,均为 Integrative multi-omic analyses identify major axes of heterogeneity in chronic obstructive pulmonary disease and uncover their molecular contributors - ECLIPSE replication cohort。关于样本采集地点、采集时间、纳入排除标准、伦理审批信息、原始数据产生平台及具体实验流程等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于慢性阻塞性肺疾病异质性相关的多组学整合研究,尤其可用于复制或验证在发现队列中识别出的主要异质性轴及其分子贡献因素。由于主题标签为 Genomics,其可能适用于基因组学层面的分析,以及与其他组学数据联合开展的整合分析。该数据集也可作为呼吸系统疾病研究中独立验证队列的数据资源,用于检验候选分子标志物或异质性分型在不同队列中的可重复性。但具体适用场景需结合源站未提供的样本构成、组学类型和临床注释等信息综合判断。

【使用方法】

该数据集的使用方法,包括数据下载方式、访问链接、所需分析工具、预处理步骤、标准化流程及分析建议等,源站未提供。使用者如需使用该数据,应前往 omicsdi.org 查询该数据集的条目信息,以获取可能的访问途径和使用说明。

【质量与限制】

该数据集的质量评估信息、数据完整性、批次效应、缺失值情况、样本代表性及潜在偏倚等,源站未提供。已知限制是:该数据集为 ECLIPSE 复制队列,其作用主要在于验证而非发现,因此其结论外推需结合发现队列及更广泛人群数据。此外,由于源站未提供样本量、组学层次和临床变量等细节,无法对其适用范围和统计效力作出进一步判断。

【引用与许可】

该数据集的引用方式、许可协议、使用限制及版权信息等,源站未提供。使用者应参考 omicsdi.org 上该数据集的原始条目或相关发表文献,以获取准确的引用和许可要求。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/project/PRJNA1433498

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Integrative multi-omic analyses identify major axes of heterogeneity in chronic obstructive pulmonary disease and uncover their molecular contributors - ECLIPSE replication cohort

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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