单核细胞数据集样本

该数据集来自 omicsdi.org,包含对受试者(COPD 患者或表面健康的对照者)进行支气管镜检查、并用 5 mm 刷子对右肺亚段气道采样所获得的样本

omicsdi
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基因组分类Genomics
ena-DATASET-MONOCYTE-08-04-2016-13:52:35:934-121 - samples

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-12

资源简介

单核细胞数据集样本

该数据集英文名为 ena-DATASET-MONOCYTE-08-04-2016-13:52:35:934-121 - samples,来源于 omicsdi.org,在本站被归类为呼吸系统疾病 / 其他。其主题标签为 Genomics。数据集涉及对人类受试者开展支气管镜检查,并使用 5 mm 刷子对右肺亚段气道进行采样,受试者包括 COPD 患者或表面健康的对照者。所获得的材料主要由支气管上皮细胞组成,同时混有少量白细胞污染。整体来看,该数据集围绕呼吸系统疾病相关的气道样本展开,适合用于与基因组学相关的分析场景,尤其是关注气道细胞成分的研究。以下将依据已有信息,对该数据集作进一步介绍。

【数据集背景】

该数据集来自 omicsdi.org,属于呼吸系统疾病 / 其他分类,主题标签为 Genomics。其研究对象为人类受试者,包括 COPD 患者或表面健康的对照者。研究通过支气管镜检查,并使用 5 mm 刷子对右肺亚段气道进行采样。相关背景可进一步参考 Ziegler-Heitbrock 等发表于 European Respiratory Journal, 40:823-829, 2012 的文献。该数据集所涉及的样本类型与气道细胞采集有关,材料主要成分为支气管上皮细胞,并伴有少量白细胞污染。

【数据内容】

该数据集英文名称为 ena-DATASET-MONOCYTE-08-04-2016-13:52:35:934-121 - samples,主题标签为 Genomics。数据集内容为来自人类受试者的样本,这些受试者包括 COPD 患者或表面健康的对照者。样本通过支气管镜检查获取,采样部位为右肺亚段气道,采样工具为 5 mm 刷子。所获得的材料主要由支气管上皮细胞组成,同时存在少量白细胞污染。除上述信息外,源站未提供更详细的数据内容说明。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 omicsdi.org。采集对象为人类受试者,包括 COPD 患者或表面健康的对照者。采集方式为支气管镜检查,并使用 5 mm 刷子对右肺亚段气道进行采样。采集所得材料主要为支气管上皮细胞,并混有少量白细胞。关于更进一步的采集细节,可参见 Ziegler-Heitbrock 等发表于 European Respiratory Journal, 40:823-829, 2012 的文献。除这些信息外,源站未提供其他采集与来源细节。

【适用场景】

该数据集的主题标签为 Genomics,来源于 omicsdi.org,本站分类为呼吸系统疾病 / 其他。其样本来自 COPD 患者或表面健康的对照者,采集部位为右肺亚段气道,材料以支气管上皮细胞为主,并伴有少量白细胞污染。因此,该数据集适用于与呼吸系统疾病、气道样本以及基因组学相关的分析场景。除上述信息外,源站未提供更具体的适用场景说明。

【使用方法】

源站未提供。

【质量与限制】

该数据集所获得的材料主要由支气管上皮细胞组成,同时存在少量白细胞污染。受试者包括 COPD 患者或表面健康的对照者。采样通过支气管镜检查完成,使用 5 mm 刷子对右肺亚段气道进行采样。除上述信息外,源站未提供关于数据质量与限制的其他说明。

【引用与许可】

该数据集的相关研究可参考 Ziegler-Heitbrock 等发表于 European Respiratory Journal, 40:823-829, 2012 的文献。除该引用信息外,源站未提供关于许可的其他说明。

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数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001002003

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Human subjects (COPD patients or apparently healthy controls) where investigated by bronchoscopy and a 5 mm brush was used to sample the subsegment airways of the right lung. The material obtained mainly consist of bronchial epithelial cells plus some contamination with leukocytes. For further details see Ziegler-Heitbrock et al, European Respiratory Journal, 40:823-829, 2012.

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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