人源iNSC衍生的尼曼-匹克病C型溶酶体贮积症脑类器官模型

该数据集包含基于人源诱导神经干细胞构建的尼曼-匹克病C型脑类器官模型,涵盖类器官的形态、增殖、胆固醇积累、神经元分化及溶酶体功能等多模态实验数据,主要用于模拟该溶酶体贮积症的神经退行性病理过程,并支持药物筛选与疾病机制研究。

Seoul National UniversitySeoul National University
干细胞与再生医学数据中心
2022-02-20 更新
浏览 34
人神经干细胞转录组
Human iNSC-derived brain organoid model of lysosomal storage disorder in Niemann-Pick disease type C

基本信息

许可
openSource
创建/更新时间
2022-02-20

资源简介

人源iNSC衍生的尼曼-匹克病C型溶酶体贮积症脑类器官模型

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Human iNSC-derived brain organoid model of lysosomal storage disorder in Niemann-Pick disease type C》。源站首次发布:2022-02-20。

【数据内容】

源站原始描述:Recent studies on developing three-dimensional (3D) brain organoids from stem cells have allowed the generation of in vitro models of neural disease and have enabled the screening of drugs because these organoids mimic the complexity of neural tissue. Niemann-Pick disease, type C (NPC) is a neurodegenerative lysosomal storage disorder caused by mutations in the NPC1 protein. The pathological features underlying NPC are characterized by the abnormal accumulation of cholesterol in acidic compartme…

【主题与分类】

主题标签:人、神经干细胞、转录组。

【获取与许可】

源站页面:http://data.iscr.ac.cn/Article?id=8a8cd3730758c2431f005ee62ec879b7

使用许可:openSource。

规范引用:PMID: 33311479

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
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数据说明

该数据集基于人源诱导神经干细胞(iNSC)构建的三维脑类器官模型,用于研究尼曼-匹克病C型(NPC)的病理机制。数据集包含从NPC患者成纤维细胞衍生的iNSC生成的脑类器官,记录了类器官的形态、增殖能力、胆固醇积累、神经元分化、自噬流及溶酶体功能等表型数据。数据通过体外实验构建,模拟了NPC患者脑组织的关键病理特征,如胆固醇异常贮积和神经退行性变化。主要应用于神经退行性疾病机制探索、药物筛选(如丙戊酸的治疗效果验证)及个性化医疗模型开发。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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