白三烯A4水解酶抑制通过调节突触功能改善年龄相关认知衰退(第1/2部分)-84628
该数据集来自 search.dataone.org,属于神经系统疾病/阿尔茨海默病分类,主题涉及白三烯、单细胞RNA测序、脑与海马

基本信息
资源简介
白三烯A4水解酶抑制通过调节突触功能改善年龄相关认知衰退(第1/2部分)
Leukotriene A4 hydrolase inhibition improves age related cognitive decline via modulation of synaptic function (Part 1/2)
该数据集来自 search.dataone.org,属于神经系统疾病/阿尔茨海默病分类,主题涉及白三烯、单细胞RNA测序、脑与海马。源站描述显示,研究聚焦于白三烯A4水解酶(LTA4H)在健康小鼠神经元中的表达,抑制LTA4H可改善老年小鼠海马依赖记忆,单细胞核RNA测序揭示突触组织、结构和活动相关基因发生显著变化;LTA4H血浆水平在衰老和阿尔茨海默病中升高并与认知障碍相关。数据可用于探索LTA4H抑制改善认知的机制及突触功能调控研究(来源 DataONE)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):白三烯是一类炎症性生物活性脂质,在外周研究较为深入,但其在脑内的重要性所知较少。我们发现酶白三烯A4水解酶(LTA4H)在健康小鼠神经元中表达,抑制老年小鼠的LTA4H可改善海马依赖记忆。抑制后海马神经元的单细胞核RNA测序揭示了对突触组织、结构和活动重要的基因发生重大变化。我们提出,LTA4H抑制可能通过直接抑制神经元中的酶活性来改善认知,从而导致突触功能改善。此外,LTA4H血浆水平在衰老和阿尔茨海默病中均升高,并与认知障碍相关。这些结果确定了LTA4H在脑中的新作用,我们提出LTA4H抑制可能是一种有前景的治疗
【主题与分类】
主题标签:Leukotriene、single cell RNA-seq、Brain、Hippocampus。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。
【获取与许可】
源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256%3A2c3a4c2bb8baea0c4b69f5a04dc39c5a16f80df3e2785b6728694cbe573493d2
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
白三烯是一类炎症生物活性脂质,在外周已被广泛研究,但其在脑内的重要性却知之甚少。我们发现,酶白三烯A4水解酶(LTA4H)在健康小鼠神经元中表达,而在老年小鼠中抑制LTA4H可改善海马依赖性记忆。抑制后对海马神经元进行单细胞核RNA测序,揭示了对于突触组织、结构和活动重要的基因发生了重大变化。我们提出,抑制LTA4H可能通过直接抑制神经元中的酶活性来改善认知,从而导致突触功能改善。此外,LTA4H血浆水平在衰老和阿尔茨海默病中均升高,并与认知障碍相关。这些结果确定了LTA4H在脑中的新作用,我们提出抑制LTA4H可能是治疗衰老相关疾病中认知衰退的一种有前景的治疗策略。老年小鼠在最后一次给药两小时后使用异氟烷麻醉,并用20 mL冰冷的人工脑脊液进行经心脏灌注。
每个处理组取3只小鼠的海马体进行显微解剖,并按照制造商指南(10x Genomics样品制备示范方案CG000124;10x Genomics,Pleasanton,CA)处理以分离细胞核,用于10x Genomics单核测序,并进行以下修改:裂解孵育时间延长至4分钟。使用PE偶联的抗NeuN抗体(EMD Millipore,FCMAB317PE,1:1000)对细胞核进行NeuN染色,并用DRAQ5(Fisher Scientific,PI62251;1:5,000)在冰上复染30分钟,以便使用Sony MA900 FACS分选仪(Sony Biotechnology,San Jose,CA)将细胞核与碎片颗粒分离。每个处理组收集8个样本,每个样本含8,000个细胞核,并立即使用10x Genomics Chromium Next GEM Single Cell…进行10x单核测序处理,数据存储库包含
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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