CPTAC前列腺癌蛋白基因组数据
CPTAC前列腺癌数据包含蛋白质组、磷酸化、基因组和临床信息，适合前列腺癌蛋白标志物和治疗靶点研究。 该数据集与前列腺癌高度相关，覆盖多模态数据内容，可用于分类、特征筛选、算法评估和临床研究。
基本信息
资源简介
CPTAC前列腺癌蛋白基因组数据
【一句话概览】
CPTAC-3 项目包含受控访问数据，需通过 dbGaP 申请获取，相关说明可参见受控数据获取指引。该项目涉及 1866 名受试者，标签涵盖 CPTAC 以及脑、头颈、肾、肺、胰腺、子宫等部位，数据类型包括拷贝数变异、DNA 甲基化、测序读段、简单核苷酸变异和转录组分析（来源 portal.gdc.cancer.gov）。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《CPTAC-3》。
【数据内容】
源站原始描述：The project has controlled access data which requires dbGaP Access. See instructions for Obtaining Access to Controlled Data
中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：该项目包含受控访问数据，需获得dbGaP访问权限。有关获取受控数据访问权限的说明，请参见指南。
【主题与分类】
主题标签：CPTAC、Brain、Head and Neck、Kidney、Lung、Pancreas、Uterus、Copy Number Variation、DNA Methylation、Sequencing Reads。
【适用方向】
多模态数据适合跨模态对齐、融合建模与联合表征学习方向的研究。
【获取与许可】
源站页面：https://portal.gdc.cancer.gov/projects/CPTAC-3
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
需登录公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://portal.gdc.cancer.gov/projects/CPTAC-3
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
CPTAC前列腺癌数据包含蛋白质组、磷酸化、基因组和临床信息，适合前列腺癌蛋白标志物和治疗靶点研究。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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