NCICCR-DLBCL基因组数据集
包含574例DLBCL活检样本的外显子组、转录组、拷贝数和靶向测序数据,用于遗传亚型研究。由National Cancer Institute提供,来自GDC Data Portal,包含多种数据模态,适用于分类任务,专注于肿瘤领域的弥漫性大B细胞淋巴瘤研究。

基本信息
资源简介
NCICCR-DLBCL基因组数据集
【一句话概览】
NCICCR-DLBCL 项目(dbGaP 研究编号 phs001444)聚焦弥漫性大 B 细胞淋巴瘤的基因组变异,疾病类型为成熟 B 细胞淋巴瘤,原发部位为淋巴结,隶属 NCICCR 项目,共纳入 489 名受试者。该数据集包含受控访问数据,需通过 dbGaP 申请获取。相关标签涵盖 RNA-Seq、靶向测序、WXS、测序读段、结构变异及转录组分析等(来源 portal.gdc.cancer.gov)。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《NCICCR-DLBCL》。
【数据内容】
源站原始描述:The project has controlled access data which requires dbGaP Access. See instructions for Obtaining Access to Controlled Data. Project ID NCICCR-DLBCL dbGaP Study Accession phs001444 Project Name Genomic Variation in Diffuse Large B Cell Lymphomas Disease Type Mature B-Cell Lymphomas Primary Site Lymph nodes Program NCICCR
中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):该项目包含受控访问数据,需获得dbGaP访问权限。有关获取受控数据访问权限的说明,请参见指南。项目ID NCICCR-DLBCL,dbGaP研究登录号phs001444,项目名称:弥漫性大B细胞淋巴瘤的基因组变异,疾病类型:成熟B细胞淋巴瘤,原发部位:淋巴结,项目:NCICCR。
【主题与分类】
主题标签:Diffuse Large B Cell Lymphomas、Mature B-Cell Lymphomas、Lymph nodes、NCICCR、RNA-Seq、Targeted Sequencing、WXS、Sequencing Reads、Structural Variation、Transcriptome Profiling。
【适用方向】
多模态数据适合跨模态对齐、融合建模与联合表征学习方向的研究。
【获取与许可】
源站页面:https://portal.gdc.cancer.gov/projects/NCICCR-DLBCL
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
需登录公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://portal.gdc.cancer.gov/projects/NCICCR-DLBCL
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
包含574例DLBCL活检样本的外显子组、转录组、拷贝数和靶向测序数据,用于遗传亚型研究。
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