NCICCR-DLBCL基因组数据集

包含574例DLBCL活检样本的外显子组、转录组、拷贝数和靶向测序数据,用于遗传亚型研究。由National Cancer Institute提供,来自GDC Data Portal,包含多种数据模态,适用于分类任务,专注于肿瘤领域的弥漫性大B细胞淋巴瘤研究。

National Cancer InstituteNational Cancer Institute
GDC Data Portal
浏览 97
多模态分类Diffuse Large B Cell LymphomasMature B-Cell LymphomasLymph nodesNCICCRRNA-SeqTargeted SequencingWXSSequencing ReadsStructural VariationTranscriptome Profiling
NCICCR-DLBCL

基本信息

模态
多模态
大小
24031.629435069 GB
数据量
574
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-09-28

资源简介

NCICCR-DLBCL基因组数据集

【一句话概览】

NCICCR-DLBCL 项目(dbGaP 研究编号 phs001444)聚焦弥漫性大 B 细胞淋巴瘤的基因组变异,疾病类型为成熟 B 细胞淋巴瘤,原发部位为淋巴结,隶属 NCICCR 项目,共纳入 489 名受试者。该数据集包含受控访问数据,需通过 dbGaP 申请获取。相关标签涵盖 RNA-Seq、靶向测序、WXS、测序读段、结构变异及转录组分析等(来源 portal.gdc.cancer.gov)。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《NCICCR-DLBCL》。

【数据内容】

源站原始描述:The project has controlled access data which requires dbGaP Access. See instructions for Obtaining Access to Controlled Data. Project ID NCICCR-DLBCL dbGaP Study Accession phs001444 Project Name Genomic Variation in Diffuse Large B Cell Lymphomas Disease Type Mature B-Cell Lymphomas Primary Site Lymph nodes Program NCICCR

中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):该项目包含受控访问数据,需获得dbGaP访问权限。有关获取受控数据访问权限的说明,请参见指南。项目ID NCICCR-DLBCL,dbGaP研究登录号phs001444,项目名称:弥漫性大B细胞淋巴瘤的基因组变异,疾病类型:成熟B细胞淋巴瘤,原发部位:淋巴结,项目:NCICCR。

【主题与分类】

主题标签:Diffuse Large B Cell Lymphomas、Mature B-Cell Lymphomas、Lymph nodes、NCICCR、RNA-Seq、Targeted Sequencing、WXS、Sequencing Reads、Structural Variation、Transcriptome Profiling。

【适用方向】

多模态数据适合跨模态对齐、融合建模与联合表征学习方向的研究。

【获取与许可】

源站页面:https://portal.gdc.cancer.gov/projects/NCICCR-DLBCL

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://portal.gdc.cancer.gov/projects/NCICCR-DLBCL

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

包含574例DLBCL活检样本的外显子组、转录组、拷贝数和靶向测序数据,用于遗传亚型研究。

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