家族性阿尔茨海默病与Sanfilippo综合征斑马鱼模型的转录组分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE242370

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在此，我们采用家族内分析，比较了两种斑马鱼模型在年轻成年大脑（6月龄）中的基因表达谱：一种是我们的早发性阿尔茨海默病（EOfAD）模型——psen1Q96_K97del，另一种是我们的圣菲利波综合征模型（MPS IIIB，nagluA603fs）。我们发现在两个年龄段中，每种模型的基因表达均出现了不同的变化。然而，也观察到了重要的共性，这指向了病理机制中根本性的潜在相似之处。我们的研究结果凸显了斑马鱼模型作为研究神经退行性疾病宝贵工具的潜力。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。