体内DNA损伤保护:细胞穿越狭窄胚胎组织环境迁移

该数据集来自NCBI GEO,标题为GSE330051,研究体内细胞迁移穿越狭窄胚胎组织环境时的DNA损伤保护机制。以斑马鱼神经嵴为体内模型,通过测量细胞外空间大小发现组织尺度限域沿胚胎前后轴从头到尾增加,核形态计量分析显示神经嵴细胞在迁移中经历物理限域

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基因组回归GPL184137955
GSE330051: In vivo DNA damage protection during cell migration across confining embryonic tissue environments

基本信息

模态
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创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

体内DNA损伤保护:细胞穿越狭窄胚胎组织环境迁移

In vivo DNA damage protection during cell migration across confining embryonic tissue environments

该数据集来自NCBI GEO,标题为GSE330051,研究体内细胞迁移穿越狭窄胚胎组织环境时的DNA损伤保护机制。以斑马鱼神经嵴为体内模型,通过测量细胞外空间大小发现组织尺度限域沿胚胎前后轴从头到尾增加,核形态计量分析显示神经嵴细胞在迁移中经历物理限域。数据包含1个文件GSE330051_series_matrix.txt.gz,采用高通量测序表达谱分析,可用于探索物理限域对生理性细胞迁移的影响及DNA损伤保护机制(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:May 06 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):在生理和疾病状态下,细胞经常通过狭窄空间迁移,例如白细胞发生血细胞渗出或癌细胞在播散过程中。培养细胞在物理限域下可因细胞核变形而承受机械应力。核变形导致核完整性丧失和DNA损伤,并被认为可能是癌症发生和发展的基础。在体内,物理限域对生理性细胞迁移的后果仍知之甚少。在这里,我们使用斑马鱼神经嵴作为体内模型,来研究多能胚胎细胞在发育迁移过程中如何响应物理限域。通过测量细胞外空间的大小,我们发现组织尺度限域的水平沿胚胎前后轴从头到尾增加。核形态计量分析显示,神经嵴细胞

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL18413、7955。本站分类:肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE330051

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jul 14 202,引用时请注意版本时效。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE330051

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在生理和疾病状态下,细胞经常通过狭窄空间迁移,例如白细胞进行血细胞渗出或癌细胞在播散过程中。培养的细胞在物理限制下可因细胞核变形而经历机械应力。核变形导致核完整性丧失和DNA损伤,并被认为与癌症的发生和进展有关。在体内,物理限制对生理性细胞迁移的影响仍知之甚少。在此,我们利用斑马鱼神经嵴作为体内模型,来探讨多能胚胎细胞在发育迁移过程中如何响应物理限制。通过测量细胞外空间的大小,我们发现组织尺度的限制程度沿胚胎前后轴从头到尾逐渐增加。核形态计量学分析显示,神经嵴在相邻组织之间迁移时经历显著的核变形,其程度与组织限制定量相关。通过使用互补的遗传和机械策略消融周围组织,我们观察到体内核变形得到恢复。

令人惊讶的是,我们发现虽然神经嵴细胞核的变形会导致核质泄漏,但即使发生极端变形,也不会引起核膜破裂或增加DNA损伤。相反,受限迁移的神经嵴细胞在核膜上显示出LaminB2减少。通过干扰LaminB2的表达水平,我们发现LaminB2的缺失促进了变形后的快速恢复,而LaminB2的持续表达则导致细胞核持续变形,突显了LaminB2在核形状可变形性中的作用。利用光转换和RNA-seq方法,我们揭示了在受限的躯干神经嵴中,一个庞大的DNA修复基因网络被上调,表明这些干细胞可能对受限诱导的机械应力具有抵抗力。总之,我们建立

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