斑马鱼精神障碍模型:Neurexins 显著调控焦虑、社交行为与攻击性

研究构建了覆盖全部家族成员的斑马鱼 neurexin 敲除品系,包括跨膜结构域破坏等位基因以及覆盖完整基因组位点和部分基因区域的缺失,并包含 nrxn1a-nrxn1b、nrxn2a-nrxn2b、nrxn3a-nrxn3b 双基因突变品系

geo
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基因组分类GPL346937955
GSE324987: Modelling mental disorders in zebrafish. Neurexins severely modulate anxiety, social behaviors and aggression

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

斑马鱼精神障碍模型:Neurexins 显著调控焦虑、社交行为与攻击性

Modelling mental disorders in zebrafish. Neurexins severely modulate anxiety, social behaviors and aggression

该数据集来自 GEO,标题为 Modelling mental disorders in zebrafish. Neurexins severely modulate anxiety, social behaviors and aggression,包含 1 个文件 GSE324987_series_matrix.txt.gz。研究构建了覆盖全部家族成员的斑马鱼 neurexin 敲除品系,包括跨膜结构域破坏等位基因以及覆盖完整基因组位点和部分基因区域的缺失,并包含 nrxn1a-nrxn1b、nrxn2a-nrxn2b、nrxn3a-nrxn3b 双基因突变品系。所有纯合突变体可存活且无明显发育异常,可用于研究 neurexin 。

【数据集背景】

源站首次发布:Mar 16 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):我们构建了一套全面的斑马鱼 neurexin 敲除品系,覆盖所有家族成员,包括跨膜结构域破坏的等位基因以及覆盖完整基因组位点和部分基因区域的缺失。所有纯合突变体均可存活,且未表现出明显的发育异常,使得尽管行为表型出现较晚,仍可进行分子谱分析。该资源包括明确的 nrxn1a-nrxn1b、nrxn2a-nrxn2b 和 nrxn3a-nrxn3b 双基因突变品系,并提供了一个脊椎动物模型来研究 neurexin 功能缺失的旁系同源特异性后果。提交至该 GEO 的 RNA-seq FASTQ 文件由这些 neurexin 突变体和匹配的对照斑马鱼生成,支持分析与 neurexin 缺陷相关的转录变化。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL34693、7955。本站分类:精神与行为障碍。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE324987

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jun 28 202,引用时请注意版本时效。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们构建了一个全面的斑马鱼neurexin敲除品系集合,覆盖了所有家族成员,包括跨膜结构域破坏的等位基因以及覆盖整个基因组位点和部分基因区域的缺失。所有纯合突变体均可存活,且未表现出明显的发育异常,这使得尽管存在晚发的行为表型,仍可进行分子谱分析。该资源包括明确的nrxn1a-nrxn1b、nrxn2a-nrxn2b和nrxn3a-nrxn3b双基因突变品系,并提供了一个脊椎动物模型,用于研究neurexin功能缺失的旁系同源特异性后果。提交至该GEO数据库的RNA-seq FASTQ文件来源于这些neurexin突变体和匹配的对照斑马鱼,支持对neurexin缺陷相关转录变化进行分析。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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