跨痴呆类型人脑snRNA-seq(Rexach等2024)
该数据集为单核RNA测序(snRNA-seq)数据,来自三个人脑皮层区域,比较三种伴tau病理的神经退行性痴呆与未受累对照

基本信息
资源简介
跨痴呆类型人脑snRNA-seq(Rexach等2024)
该数据集为单核RNA测序(snRNA-seq)数据,来自三个人脑皮层区域,比较三种伴tau病理的神经退行性痴呆与未受累对照。诊断包括阿尔茨海默病(AD)、进行性核上性麻痹(PSP)、伴Pick病神经病理学改变的行为变异型额颞叶痴呆(bvFTD)及未受累对照。脑区包括运动皮层(BA4)、岛叶皮层和视觉皮层,每种诊断与脑区8-11例。可视化数据经过质控过滤。可用于研究不同痴呆类型的细胞类型组成与转录差异(来源 cellxgene.cziscience.com)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):对三个大脑皮层脑区进行单核RNA测序,比较三种不同的伴tau病理的神经退行性痴呆。纳入的诊断包括阿尔茨海默病(AD)、进行性核上性麻痹(PSP)、伴Pick病神经病理学改变的行为变异型额颞叶痴呆(bvFTD)以及未受累对照。纳入的脑区包括运动皮层(BA4)、岛叶皮层和视觉皮层。每种诊断和脑区8-11例。用于可视化的数据经过质控过滤。疾病:Alzheimer disease、Pick disease、normal、progressive supranuclear palsy。组织:Brodmann(1909)area 4、insular cortex、primary visual cortex。检测:10x 3' v2、10x 3' v3。单细胞数据集(CZ CELLxGENE)。
【主题与分类】
主题标签:Alzheimer disease、Pick disease、normal、progressive supranuclear palsy。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。
【获取与许可】
源站页面:https://cellxgene.cziscience.com/collections/c53573b2-eff4-4c5e-9ad0-b24d422dfd9b
下载信息
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数据集获取
源站:https://cellxgene.cziscience.com/collections/c53573b2-eff4-4c5e-9ad0-b24d422dfd9b
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
对三个大脑皮层脑区进行单核RNA测序,比较三种具有tau蛋白病理的不同神经退行性痴呆。纳入的诊断包括阿尔茨海默病(AD)、进行性核上性麻痹(PSP)、具有皮克病神经病理学特征的行为变异型额颞叶痴呆(bvFTD)以及未受影响的对照。纳入的脑区包括运动皮层(BA4)、岛叶皮层和视觉皮层。每种诊断和脑区有8-11例病例。提供用于可视化的数据已经过质量控制过滤。疾病:阿尔茨海默病、皮克病、正常、进行性核上性麻痹。组织:Brodmann(1909)4区、岛叶皮层、初级视觉皮层。检测方法:10x 3‘ v2、10x 3’ v3。单细胞数据集(CZ CELLxGENE)。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




