跨痴呆类型人脑snRNA-seq(Rexach等2024)

该数据集为单核RNA测序(snRNA-seq)数据,来自三个人脑皮层区域,比较三种伴tau病理的神经退行性痴呆与未受累对照

cellxgene
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基因组分类Alzheimer diseasePick diseasenormalprogressive supranuclear palsy
Cross-dementia human brain snRNA-seq (Rexach et al 2024)

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

跨痴呆类型人脑snRNA-seq(Rexach等2024)

该数据集为单核RNA测序(snRNA-seq)数据,来自三个人脑皮层区域,比较三种伴tau病理的神经退行性痴呆与未受累对照。诊断包括阿尔茨海默病(AD)、进行性核上性麻痹(PSP)、伴Pick病神经病理学改变的行为变异型额颞叶痴呆(bvFTD)及未受累对照。脑区包括运动皮层(BA4)、岛叶皮层和视觉皮层,每种诊断与脑区8-11例。可视化数据经过质控过滤。可用于研究不同痴呆类型的细胞类型组成与转录差异(来源 cellxgene.cziscience.com)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):对三个大脑皮层脑区进行单核RNA测序,比较三种不同的伴tau病理的神经退行性痴呆。纳入的诊断包括阿尔茨海默病(AD)、进行性核上性麻痹(PSP)、伴Pick病神经病理学改变的行为变异型额颞叶痴呆(bvFTD)以及未受累对照。纳入的脑区包括运动皮层(BA4)、岛叶皮层和视觉皮层。每种诊断和脑区8-11例。用于可视化的数据经过质控过滤。疾病:Alzheimer disease、Pick disease、normal、progressive supranuclear palsy。组织:Brodmann(1909)area 4、insular cortex、primary visual cortex。检测:10x 3' v2、10x 3' v3。单细胞数据集(CZ CELLxGENE)。

【主题与分类】

主题标签:Alzheimer disease、Pick disease、normal、progressive supranuclear palsy。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。

【获取与许可】

源站页面:https://cellxgene.cziscience.com/collections/c53573b2-eff4-4c5e-9ad0-b24d422dfd9b

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

对三个大脑皮层脑区进行单核RNA测序,比较三种具有tau蛋白病理的不同神经退行性痴呆。纳入的诊断包括阿尔茨海默病(AD)、进行性核上性麻痹(PSP)、具有皮克病神经病理学特征的行为变异型额颞叶痴呆(bvFTD)以及未受影响的对照。纳入的脑区包括运动皮层(BA4)、岛叶皮层和视觉皮层。每种诊断和脑区有8-11例病例。提供用于可视化的数据已经过质量控制过滤。疾病:阿尔茨海默病、皮克病、正常、进行性核上性麻痹。组织:Brodmann(1909)4区、岛叶皮层、初级视觉皮层。检测方法:10x 3‘ v2、10x 3’ v3。单细胞数据集(CZ CELLxGENE)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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