共 14598 个数据集

GSE329336:转录记忆塑造癌症与干细胞可遗传状态及功能异质性 [scRNA-seq]

GSE329336:转录记忆塑造癌症与干细胞可遗传状态及功能异质性 [scRNA-seq]

基因组分类GPL246769606

数据基于谱系分辨的单细胞转录组学,用于研究跨分裂持续存在的可遗传细胞状态,区分其与瞬时波动,并揭示由广泛转录记忆支撑的两类状态:聚集状态与潜在状态

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基因工程小鼠模型胰腺癌细胞与组织的转录组分析

基因工程小鼠模型胰腺癌细胞与组织的转录组分析

基因组分类GPL2845710090

该数据集来自基因工程小鼠模型,用于研究胰腺导管腺癌(PDAC)进展相关的转录组改变。样本包括从KPC和KPNiC肿瘤中分离的胰腺癌细胞,以及WT、NiC、KC和KNiC小鼠的全胰腺组织裂解液

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脑转移瘤单细胞基因表达数据集

脑转移瘤单细胞基因表达数据集

时间序列分类Genomics

该数据集来自 omicsdi.org,包含 9 例脑转移瘤样本的单细胞基因表达数据。其中 6 例配有匹配的脑脊液样本,采集时间包括手术前,以及两例在手术后(术后 1 个月)和治疗后(术后 3 个月)的样本

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GSE329335:广泛转录记忆塑造癌症与干细胞中的可遗传状态及功能异质性 [RRBS]

GSE329335:广泛转录记忆塑造癌症与干细胞中的可遗传状态及功能异质性 [RRBS]

基因组分类GPL294809606

该数据集来自 NCBI GEO,标题为 GSE329335,聚焦广泛转录记忆如何塑造癌症与干细胞中的可遗传状态及功能异质性,属于 RRBS 甲基化高通量测序数据

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Y79视网膜母细胞瘤细胞MYCN敲低RNA-seq分析

Y79视网膜母细胞瘤细胞MYCN敲低RNA-seq分析

基因组回归GPL111549606

该数据集为Y79视网膜母细胞瘤细胞中MYCN敲低后的转录组分析,采用bulk RNA测序,比较转导对照shRNA与MYCN靶向shRNA的Y79细胞,每种条件设三个独立生物学重复

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转录-翻译冲突是细胞转化和癌症进展的屏障

转录-翻译冲突是细胞转化和癌症进展的屏障

蛋白质分类Proteomics

数据可用于比较两类样本的蛋白质表达差异,探索ARID1A缺失对蛋白质组的影响,以及转录-翻译冲突在细胞转化和癌症进展中的作用

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人结肠癌细胞模型中SOX9-BAF多组学图谱

人结肠癌细胞模型中SOX9-BAF多组学图谱

基因组分类GPL246769606

该数据集来自人结肠癌细胞模型,整合了配对的ATAC-seq、RNA-seq和CUT&RUN图谱,用于追踪SOX9降解与恢复、BAF亚基扰动、组蛋白修饰占据、ARID1A/ARID1B敲低以及SOX9变异体染色质可及性

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通过隔离MEK与ERK并促进抗肿瘤T细胞免疫持久抑制获得性MEK抑制剂耐药[RNA-seq]

通过隔离MEK与ERK并促进抗肿瘤T细胞免疫持久抑制获得性MEK抑制剂耐药[RNA-seq]

基因组分类GPL212909606

该数据集为GSE158607的RNA-seq部分,研究通过将MEK从ERK隔离并促进抗肿瘤T细胞免疫,实现对获得性MEK抑制剂耐药的持久抑制

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CDK8抑制解除融合驱动肺泡横纹肌肉瘤肌分化阻滞 [CUT&RUN]

CDK8抑制解除融合驱动肺泡横纹肌肉瘤肌分化阻滞 [CUT&RUN]

基因组分类GPL246769606

该数据集为GSE303151的CUT&RUN部分,聚焦融合驱动的肺泡横纹肌肉瘤(aRMS)。研究通过Depmap功能基因组分析发现CDK8是aRMS的新依赖靶点,CDK8敲除或药物抑制均可抑制肿瘤细胞生长并诱导肌源性分化

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人头颈癌细胞系SQD9 TMEM45A敲除顺铂暴露RNA-seq

人头颈癌细胞系SQD9 TMEM45A敲除顺铂暴露RNA-seq

基因组回归Differential

该数据集来自 EBI Expression Atlas 的差异表达实验,物种为 Homo sapiens,研究对象是人头颈癌细胞系 SQD9 在敲除 TMEM45A 后暴露于顺铂的 RNA-seq 表达谱

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GSE58780:视网膜母细胞瘤基因表达数据

GSE58780:视网膜母细胞瘤基因表达数据

基因组分类Expression profiling by arrayGPL287189606

视网膜母细胞瘤是婴幼儿期最常见的眼内恶性肿瘤,其发生早期事件为 RB1 基因双等位基因功能缺失,但其他基因也可能参与肿瘤发展

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脂肪细胞在塑造网膜卵巢癌肿瘤微环境中并非必需

脂肪细胞在塑造网膜卵巢癌肿瘤微环境中并非必需

基因组分类GPL246769606

该数据集来自 NCBI GEO,标题为脂肪细胞在塑造网膜卵巢癌肿瘤微环境中并非必需,包含 1 个文件 GSE300038_series_matrix.txt.gz,属于高通量测序表达谱数据,物种为人(9606),平台为 GPL24676

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