人结肠癌细胞模型中SOX9-BAF多组学图谱
该数据集来自人结肠癌细胞模型,整合了配对的ATAC-seq、RNA-seq和CUT&RUN图谱,用于追踪SOX9降解与恢复、BAF亚基扰动、组蛋白修饰占据、ARID1A/ARID1B敲低以及SOX9变异体染色质可及性

基本信息
资源简介
人结肠癌细胞模型中SOX9-BAF多组学图谱
SOX9-BAF multi-omics profiling in human colon cancer cell models
该数据集来自人结肠癌细胞模型,整合了配对的ATAC-seq、RNA-seq和CUT&RUN图谱,用于追踪SOX9降解与恢复、BAF亚基扰动、组蛋白修饰占据、ARID1A/ARID1B敲低以及SOX9变异体染色质可及性。主要时间序列使用HT29-dTAG细胞,SOX9变异体ATAC-seq子集使用LS180细胞。数据可用于研究SOX9与BAF复合物在结肠癌染色质调控中的协同作用,支持转录调控、染色质状态和基因表达关联分析(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jun 11 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):本研究结合配对的ATAC-seq、RNA-seq和CUT&RUN图谱,在人结肠癌细胞模型中追踪SOX9降解/恢复、BAF亚基扰动、组蛋白标记占据、ARID1A/ARID1B敲低以及SOX9变异体染色质可及性。主要时间序列使用HT29-dTAG细胞;SOX9变异体ATAC-seq子集使用LS180细胞。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/其他。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE335210
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jun 16 202,引用时请注意版本时效。
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数据说明
本研究结合了匹配的ATAC-seq、RNA-seq和CUT&RUN图谱分析,在人类结肠癌细胞模型中追踪SOX9降解/恢复、BAF亚基扰动、组蛋白标记占据、ARID1A/ARID1B敲低以及SOX9变异体的染色质可及性。主要时间序列使用HT29-dTAG细胞;SOX9变异体ATAC-seq子集使用LS180细胞。
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