GSE30528糖尿病肾病肾组织表达谱
内分泌系统疾病领域表格公开数据集,来源:ncbi。

基本信息
资源简介
GSE30528糖尿病肾病肾组织表达谱
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Transcriptome Analysis of Human Diabetic Kidney Disease (DKD Glomeruli vs. Control Glomeruli)》。源站首次发布:Jul 08 201。
【数据内容】
源站原始描述:We identified 1,700 differentially expressed probesets in DKD glomeruli and 1,831 in diabetic tubuli; 330 probesets were commonly differentially expressed in both compartments. The canonical complement signaling pathway was determined to be statistically differentially regulated in both DKD glomeruli and tubuli and was associated with increased glomerulosclerosis even in an additional set of DKD samples
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL571、9606。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE30528
【使用注意】
· 源站最后修改于 Dec 06 201,引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE30528
标准获取流程:
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
糖尿病肾病肾组织表达谱公开数据,常用于DN差异表达与标志物验证。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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