脂肪细胞在塑造网膜卵巢癌肿瘤微环境中并非必需

该数据集来自 NCBI GEO,标题为脂肪细胞在塑造网膜卵巢癌肿瘤微环境中并非必需,包含 1 个文件 GSE300038_series_matrix.txt.gz,属于高通量测序表达谱数据,物种为人(9606),平台为 GPL24676

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基因组分类GPL246769606
GSE300038: Adipocytes are dispensable in shaping the ovarian cancer tumor microenvironment in the omentum

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

脂肪细胞在塑造网膜卵巢癌肿瘤微环境中并非必需

Adipocytes are dispensable in shaping the ovarian cancer tumor microenvironment in the omentum

该数据集来自 NCBI GEO,标题为脂肪细胞在塑造网膜卵巢癌肿瘤微环境中并非必需,包含 1 个文件 GSE300038_series_matrix.txt.gz,属于高通量测序表达谱数据,物种为人(9606),平台为 GPL24676。研究围绕卵巢癌腹膜转移中的网膜微环境,利用小鼠模型与单细胞 RNA 测序,探讨成熟脂肪细胞缺失对肿瘤种植与腹膜扩散的影响,并提示内皮细胞 FABP4 的作用。数据可用于卵巢癌转移机制、肿瘤微环境及脂肪细胞相关基因表达分析(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jun 17 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):网膜是腹膜内一种特化的脂肪组织,是卵巢癌(OC)在腹膜癌病期间播散的关键转移生态位。主流观点认为,网膜脂肪细胞通过提供脂质促进肿瘤生长,因为全身性 FABP4 缺陷会抑制肿瘤生长。在此,我们构建了腹膜和网膜中缺乏成熟脂肪细胞的小鼠。ID8p53–/–Brca2–/–、BPPNM 和 KPCA OC 细胞即使在缺乏成熟脂肪细胞的情况下,仍倾向于在通常与脂肪细胞相关的区域种植。然而,缺乏成熟脂肪细胞并未抑制腹膜 OC 的扩张,而切除无脂肪细胞的网膜则抑制了扩张。小鼠和人类单细胞 RNA 测序分析显示,网膜中内皮 FABP4 高表达。事实上,内皮细胞选择性 FABP4 缺陷减少了腹膜中的 OC 生长。这些发现促使重新评估

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE300038

【使用注意】

· 源站最后修改于 Oct 06 202,引用时请注意版本时效。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

大网膜是腹膜内一种特化的脂肪组织,是卵巢癌(OC)在腹膜癌播散过程中的关键转移微环境。主流观点认为,大网膜脂肪细胞通过提供脂质促进肿瘤生长,因为全身性FABP4缺陷可抑制肿瘤生长。在此,我们构建了腹膜和大网膜中缺乏成熟脂肪细胞的小鼠。ID8p53–/–Brca2–/–、BPPNM和KPCA卵巢癌细胞即使在没有成熟脂肪细胞的情况下,仍倾向于在通常与脂肪细胞相关的区域定植。然而,缺乏成熟脂肪细胞并未抑制腹膜卵巢癌的扩展,而切除无脂肪细胞的大网膜则能抑制。小鼠和人类单细胞RNA测序分析显示,大网膜中内皮FABP4高表达。事实上,内皮细胞选择性FABP4缺陷减少了腹膜中卵巢癌的生长。这些发现促使我们重新评估脂肪细胞对卵巢癌进展的贡献,并指出大网膜血管系统在代谢上支持卵巢癌生长中发挥关键作用。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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